Nature子刊:赵英明/张迪团队等开发区分蛋白质乳酰化修饰同分异构...
2019年,芝加哥大学赵英明教授团队发表Nature论文上首次揭示了Warburg效应的产物L-乳酸能够驱动一种新型蛋白质修饰——赖氨酸乳酰化,张迪为该论文的第一作者。随后,该修饰的立体异构体修饰——赖氨酸D-乳酰化(KD-la)也被发现存在于细胞中。KD-la是通过乙二醛酶途径产生的S-D-乳酰谷胱甘肽(LGSH)与蛋白质发生的非...
Carboxy-PEG5-sulfonic acid常用作生物大分子如蛋白质的修饰剂
四、试剂简介Carboxy-PEG5-sulfonicacid常被用作生物大分子如蛋白质、多肽和核酸的修饰剂,能改善这些生物分子在生理环境中的稳定性,并降低其免疫原性。此外,它还可以作为合成高分子材料的原料,通过与其他单体共聚,制备出具有优良性能的新型高分子材料。此外,Carboxy-PEG5-sulfonicacid还具有良好的水溶性和稳定性,...
科学家开发出利用纳米孔区分20种蛋白质氨基酸及其修饰的方法
研究人员建立一种工程异质八聚体包皮分枝杆菌porinA(MspA)纳米孔,其中包含唯一的Ni2+修饰。它可以完全区分所有20种蛋白氨基酸和4种代表性修饰氨基酸,Nω、N'ω-二甲基精氨酸(Me-R)、O-乙酰苏氨酸(Ac-T)、N4-(β-N-乙酰基-葡萄糖胺基)-天冬酰胺(GlcNAc-N)和O-磷丝质碱(P-S)。在机器学习的帮助下,...
Nature子刊:黄硕团队首次通过纳米孔实现20种蛋白质氨基酸和翻译后...
该纳米孔传感器还可以在分辨20种氨基酸的同时直接分辨翻译后修饰(如磷酸化、甲基化、糖基化、乙酰化),对纳米孔蛋白质测序和翻译后修饰的测序检测具有里程碑意义。图3:机器学习辅助20种天然氨基酸及4种修饰氨基酸的识别南京大学化学化工学院博士生王可凡、张善雨,南京大学物理学院博士生周骁为该论文共同第一作者,黄硕...
蛋白质质谱分析:多肽结构鉴定的新视角
蛋白质质谱分析有多种方法,其中最常用的包括质谱仪、质谱图谱和数据库搜索等。2.1质谱仪质谱仪是蛋白质质谱分析的核心设备,它可以将离子化的蛋白质进行分析,并生成质谱图。常见的质谱仪包括质谱仪和飞行时间质谱仪等。2.2质谱图谱质谱图谱是蛋白质质谱分析的结果,它是一种图形化的表示方式,可以显示蛋白质的...
国自然:热门的蛋白翻译后修饰(糖基化、SUMO化)标书撰写技巧教学
O-GlcNAc糖基化修饰:是一种动态可逆的糖基化修饰过程,涉及将N-乙酰葡萄糖胺(O-GlcNAc)添加到蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基上(www.e993.com)2024年9月7日。这种修饰可以影响蛋白质的功能、稳定性和细胞内定位。SUMO化:是一种类似于泛素化的翻译后修饰,涉及将小分子泛素样修饰蛋白(SUMO)共价地附加到目标蛋白质上,影响其功能、定位和蛋白...
国内Nature,Cell三连发:翻译后修饰研究如何花式发顶刊
使用抗体识别K120-或K139-乳酰化p53,作者证实了内源性p53中在这些氨基酸上发生了乳酰化。结合这些结果和结构分析,作者推断出AARS1的作用机制:AARS1是一种进化上保守的酶,以ATP依赖的方式将lactate转化成lactate-AMP,AARS1会将乳酰基共价转移到目标蛋白的赖氨酸残基上形成乳酰化修饰。
阿司匹林可以直接乙酰化修饰 SIRT1 蛋白的关键位点
在体外实验中,阿司匹林可以对SIRT1蛋白的关键位点赖氨酸进行乙酰化修饰,降低SIRT1蛋白与底物的结合亲和力,从而抑制SIRT1蛋白的去乙酰化酶活性。在此基础上,研究人员发现阿司匹林处理可以增强肿瘤细胞中SIRT1的下游底物p53蛋白的乙酰化水平,并促进p53蛋白依赖的细胞凋亡,抑制结直肠肿瘤的生长,而这一过程...
mRNA药物修饰及其递送系统研究进展
共转录加帽的修饰可通过一步法完成,这是目前主要的帽修饰方式,通常5??帽在体外转录时加至mRNA,但研究发现共转录加帽修饰mRNA是个可逆的过程,这导致加帽效率降低[23]。ARCA已广泛应用于mRNA的体外转录合成。研究发现,在培养的细胞中,ARCA修饰的mRNA相比未被修饰的mRNA具有更长的作用时间和更稳定的蛋白质表达...
“质”的飞跃:Orbitrap Astral革新修饰组学研究
在众多的PTM类型中,磷酸化修饰(Phosphorylationmodification)的蛋白占到了所有蛋白质约三分之一,是普遍的修饰类型之一。会影响到细胞内信号转导、细胞结构、细胞增殖、凋亡、转录、代谢过程以及调控病原微生物的适应能力等等,所以在不同细胞中,蛋白磷酸化水平会呈现不同的差异,特定位点的磷酸化程度可能从小于1%到大于...