2024年诺奖技术再升级,AlphaFold3来了!超越蛋白质结构,全面预测...
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...
2024诺贝尔化学奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
蛋白质拥有广泛的生物学功能,包括结构组分(胶原蛋白)、催化功能(酶)、调节作用(激素)、物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
第一步:贝克依赖于他们开发的Rosetta蛋白质结构预测算法,可以预测氨基酸序列在形成蛋白质时可能采取的三维结构。第二步:利用这个工具,他们针对随机生成的一系列氨基酸序列进行结构预测,这些序列都是在自然界中未被观察到的。如果预测结果显示出合理的蛋白质结构,那么这条氨基酸序列就会被保留下来,反之则抛弃该序列。第...
2024化学诺奖专家解读:颁给蛋白质预测和AI实至名归,化学家还不会...
多肽链会以螺旋或折叠的方式形成特定的“二级结构”,这些二级结构又能通过连接结构形成更复杂的三级结构。正如在折纸时涉及到纸张硬度、施力大小等多种物理、材料规律,多肽链的折叠也是由氨基酸序列中原子和分子的相互作用决定的,如氢键、疏水作用、离子键、范德华力等。沈琦说,要研究这个过程,就涉及到微观层面的物...
因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质
蛋白质由很多氨基酸通过化学键串在一起。这里我用一些小球去表示这些氨基酸,每种颜色的小球表示一种氨基酸。从数学角度,你也可以用一个字符串去表示一个蛋白质的氨基酸序列。每个氨基酸都是由几十个原子形成的,在这页幻灯片的下半部分,我画了一些原子结构,大家可以对蛋白质的分子式有一个直观的认识。现在我们只要知...
诺贝尔化学奖给了预测蛋白质的哈萨比斯等,是AI for Science,物理...
包括甘氨酸(Glycine)谷氨酸(Glutamicacid)谷氨酰胺(Glutamine)半胱氨酸(Cysteine)天冬氨酸(Asparticacid)等等...右侧展示了从氨基酸到蛋白质的形成过程:氨基酸首先以"串珠子"的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS)这条氨基酸链最终会折叠成特定的三维结构,形成功能性蛋白质(PROTEIN)...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
蛋白质以氨基酸为基本组成单位,氨基酸的不同排列(即序列)以及在此基础上的卷曲折叠,形成了特定的三维立体结构,进而执行不同的功能。人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上可能存在的蛋白质数量会达到约10^1300,比整个宇宙中的原子数量还要多...
...学院蔡华珍教授等:多频复合超声真空煮制对卤牛肉肌纤维结构及...
蛋白质二级结构是多肽链通过氢键沿一定方向盘旋、折叠而形成有规则的重复构象,包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲结构。由图2可知,各处理组牛肉肌原纤维蛋白质在波长208nm和222nm附近有两个强负吸收峰,这是α-螺旋结构的特征吸收峰,该特征吸收峰峰形随着超声波频数的增加渐趋平缓。
为何两项诺贝尔奖都颁给“AI”?诺奖评委亮相抖音直播间做解读
的顺序就是蛋白质的一级结构;而让这个顺序的积木块在空间上产生螺旋、转角等空间构象,就相当于用积木拼成一个小的原件,就是蛋白质的二级结构;而这些彼此连接的小原件进一步拼装成一个小汽车,就可以理解成蛋白质的三级结构;其四级结构又要涉及到多个“小汽车”在空间上布局,一般是含有多个氨基酸长链的蛋白质才具有...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI
包括甘氨酸(Glycine);谷氨酸(Glutamicacid);谷氨酰胺(Glutamine);半胱氨酸(Cysteine);天冬氨酸(Asparticacid);等等...右侧展示了从氨基酸到蛋白质的形成过程:氨基酸首先以“串珠子”的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS);这条氨基酸链最终会折叠成特定的三维结构,形成功能性蛋白质(PROTEIN...