2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
10月9日,欧洲中部时间11时45分(北京时间17时45分),瑞典皇家科学院决定将2024年诺贝尔化学奖的一半授予大卫·贝克(DavidBaker),以表彰他在“计算蛋白质设计”方面的贡献,并将另一半授予戴密斯·哈萨比斯(DemisHassabis)和约翰·M·詹伯(JohnM.Jumper),以表彰他们在“蛋白质结构预测”方面的贡献。DavidBaker...
2024化学诺奖再次垂青AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克
本次诺奖奖励的另一项发现则涉及蛋白质结构的预测。在蛋白质中,氨基酸以长链的形式连接在一起,然后折叠成三维结构,这对蛋白质的功能至关重要。自20世纪70年代以来,研究人员一直试图根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这非常困难。然而,就在四年前,科学家在这一领域取得了惊人的突破。2020年,Hassabis和Jumper首次...
为什么诺贝尔化学奖又被人工智能学者拿了:阿尔法折叠,蛋白质结构...
它能从蛋白质的一级结构,即氨基酸序列的组合,来预判1)蛋白质的二级结构,即蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构;2)三级结构,即在二级结构基础上多段进一步折叠盘绕后形成的特定空间结构;3)四级结构,即蛋白质-蛋白质复合形成的结构,是更为复杂的生物大分子。AlphaFold系列对蛋白质结构与功能的预测,有望对人类在...
超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
下图展示了AlphaFold3对RNA修饰蛋白复合物的结构预测,该复合物包含一个蛋白质(蓝色)、一条RNA链(紫色)和两个离子(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。下图展示了AlphaFold3对一种分子复合物的结构预测,该复合物包含一种酶蛋白(蓝色)、离子(黄色球体)和单糖(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。这种酶...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
AlphaFold问世于2018年,就参加了一个国际学术比赛——蛋白质折叠预测比赛(CriticalAssessmentofproteinStructurePrediction,简称CASP),并取得了不俗的成绩,立刻引起了领域内的关注。CASP从1994年开始,每两年举办一次,是蛋白质结构预测领域最重要的国际性赛事,参赛团队需要使用计算方法预测给定蛋白质序列的三维结构。
诺贝尔化学奖给了预测蛋白质的哈萨比斯等,是AI for Science,物理...
第二项发现涉及蛋白质结构的预测(www.e993.com)2024年10月17日。在蛋白质中,氨基酸以长链的形式连接在一起,并折叠形成三维结构,这种结构对蛋白质的功能起着决定性作用。自20世纪70年代以来,研究人员一直试图从氨基酸序列预测蛋白质结构,但这项工作出了名的困难。然而,四年前出现了一个惊人的突破。
Nature亮点丨David Baker让蛋白质从头设计“飞入寻常百姓家”
球状溶剂排除的蛋白质折叠,Baker团队向Foldit补充了三条设计规则:1.“核心存在”规则——在设计的结果中规定了疏水残基的最小比例(比如30%);2.“二级结构设计”规则——在所有二级结构元件中禁止甘氨酸和丙氨酸,以保证只有50%的残基可以形成α-螺旋;3.“残基相互作用能量”规则——在设计的结构中排除分子内相互...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
从生命科学的角度来说,蛋白质是生命体内四种主要大分子之一(另外三种分别是核酸、多糖和脂质)。在生命体内,DNA作为生命信息的载体,负责遗传信息的存储。围绕它的研究、技术及应用,构成了20世纪人类生命科学领域最重大的进步之一。而关于它的故事,从20世纪50年代双螺旋结构的发现,到当下各种新兴医疗技术的诞生,人们已经...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
我们会举例说明RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用,包括转录和翻译的动力学分析,RNA结构,RNA-RNA和RNA-蛋白质间相互作用等。最后我们小小地展望一下RNA-seq的未来,如单细胞和空间转录组是否也会是以后的常规分析,在什么情况下longreads会替代shortreadsRNA-seq。不过篇幅有限,本文对RNA-seq分析还是有照顾不到...
...给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构预测成果
1951年,他发表了α-螺旋的化学结构,α-螺旋是蛋白质常见的二级结构。获得1962年诺贝尔和平奖。原子弹在广岛和长崎的爆炸成为了莱纳斯·鲍林事业的转折点。他和其他科学家一起,通过演讲和写作抗议核武器战争。莱纳斯·鲍林是帕格沃什运动中的一股驱动力。帕格沃什运动的目的是削弱核武器在国际政治中的作用,发起此...