蜘蛛丝:一种神奇的天然生物纤维材料

蜘蛛丝主要由一种或多种蜘蛛蛋白组成,这些蛋白质往往很大(每个单体可达350千道尔顿)。尽管蜘蛛丝性质不同,但所有蜘蛛蛋白都有一个共同的初级结构模式,中间为一个由重复模块单元组成的大核心,两侧是非重复结构域。非重复末端结构域具有折叠的球形结构,由100~140个氨基酸组成。这种末端结构域对于蛛丝腺中蛛丝蛋白的储存...

独家专访诺奖得主DeepMind CEO哈萨比斯:我们将看到一种全新的科学...

例如,血红蛋白是一种在体内运送氧气并使血液呈红色的蛋白质,它的形状像一个小袋子,这让它能捕获肺部的氧气分子。而SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白结构,使其能附着在细胞上。问题在于,很难从一串氨基酸中找出蛋白质的结构以及功能,一条展开的氨基酸串有10^30000种可能的形式,这是与围棋游戏中所有可能走法的规模...

分析蛋白质功能结构域的策略和步骤

1.序列比对使用如BLAST之类的工具,将目标蛋白序列与已知的蛋白数据库进行比对,寻找相似的已知结构或功能的区域。2.域预测使用专门的软件工具,如Pfam、InterPro、SMART等,来预测蛋白序列中可能存在的结构域或功能域。3.三维结构预测如果可行,可以使用如Phyre2、SWISS-MODEL等工具来预测蛋白质的三维结构。这可以...

...基础化学#》形考作业1|辅酶|氢键|酪氨酸|丙氨酸|蛋白质_网易订阅

A.一级结构B.二级结构C.三级结构D.四级结构E.空间结构5.蛋白质分子中主要的化学键是()A.肽键B.二硫键C.酯键D.盐键E.氢键6.蛋白质的等电点是指()A.蛋白质溶液的pH值等于7时溶液的pH值B.蛋白质溶液的pH值等于7.4时溶液的pH值C.蛋白质分子呈正离子状态时溶液的pH值D.蛋白...

生命科学与技术学院张赫团队关于染色质拓扑相关结构域调控基因...

真核生物基因组在进化上保守,但在空间层次上具有高度可塑性,由染色质环、拓扑相关结构域(topologicallyassociatingdomain,TAD)等动态的染色质高维结构组成。当TAD重构介导的染色质环处于紊乱状态时,易引起染色质构象重塑,导致基因表达异常,甚至促使肿瘤发生。因此,亟需进一步发现受TAD变化调控的功能基因,并深入揭示TAD重...

Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...

我们根据这些家族的分类学、栖息地、地理分布和基因邻近分布对其进行了注释,并在有足够序列多样性的情况下预测了蛋白质的三维模型,揭示了新的结构(www.e993.com)2024年11月8日。总之,我们的研究结果揭示了一个极其多样化的功能空间,突出了进一步探索微生物功能暗物质的重要性。-正文-...

【科学家掠影】江山代有才人出:中国新生代结构生物学家 |...

结构生物学囊括了核磁共振、X射线和冷冻电镜等多种技术,我有幸实践了所有这些方法。这一领域的精髓在于揭示原子之间错综复杂的舞蹈,探索将原子转化为功能性蛋白质的微妙联系。此外,结构生物学还要将这些复杂结构传达给更广泛受众,为人们深入了解蛋白质内部运作提供洞见。对我来说,结构生物学是科学与艺术之间的动态互动,...

疟原虫和弓形虫微孔的蛋白质组成及其潜在机制

其中,Kelch13可能作为一个适配器起作用,它包含一个Kelch结构域和一个BTB/POZ结构域。含有这些结构域的蛋白质在其他真核生物中通常参与将待降解的蛋白质呈递进行泛素化。Kelch13的这些结构域可能也通过类似的机制来发挥功能。第二个蛋白UBP1已知是Kelch13的关键互作蛋白[5,7,8],且与青蒿素抗药性相关[9]...

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

图|蛋白质结构水平(来源:MarkBelan)地球上已知的蛋白质有数亿种,未知的也有很多。它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。

诺贝尔化学奖也花落AI领域!刚刚,AlphaFold开发者等人获奖 | 深度...

在比赛中,AlphaFold成功预测了给定的43种蛋白质中的25种的最准确结构,而同一类别的第二名参赛队伍只预测出了43种中的3种。和以往依赖预先构想逻辑的传统人工智能方法不同的是,AlphaFold并未使用已经明确结构的蛋白质3D模型作为模板,而是通过将机器学习作为蛋白质结构预测网络的核心组成部分,让AlphaFold从数据中自行...