JPA中科院1区:天然产物虚拟筛选-相互作用-表型的靶标鉴定策略—以...
选择通过各种靶标筛选方法鉴定的5种蛋白,包括STAT3、PARP1、APP、GAD67和GLUL,它们是PPI网络的核心,用于实验验证。随后,采用DARTS技术结合WB分析来验证和量化SME组分与潜在靶蛋白的直接结合。实验结果显示,在0.1、0.5和1.0mg/mL的SME剂量下,GLUL、GAD67、STAT3、APP和PARP1的表达水平呈剂量依赖性增加,证实了...
Phytomedicine | CETSA和TPP策略用于天然产物的靶点鉴定和药物...
TPP一般包括两种类型的实验:一种是TPP-tr实验,类似于WB-CETSA,即在固定的药物浓度下检测温度依赖性的蛋白质组热稳定性;另一个是TPP-CCR实验,类似于ITDR-CETSA,即在固定温度点检测药物浓度依赖性的全蛋白质组热稳定性(图2)。在完整细胞的典型tp-tr方案中,首先将细胞与饱和浓度的药物或溶剂对照孵育一段时间。
...高产量牧草、耐空心青菜头…… 重庆农作物种质资源精准鉴定...
精准鉴定柠檬黄脉病为种植者提供高效实用工具在柠檬方面,培育出抗黄脉病柠檬新种质“金柠1号”,并开发出一套精准鉴定柠檬黄脉病的方法,有助于解决柠檬产业的关键挑战。针对柠檬产业长期面临的品种单一和黄脉病威胁等问题,项目团队开发出一套精准鉴定柠檬黄脉病的方法,并在全球卓越工程师大赛上获得优秀成果转化奖...
Trends Genet | 表型进化的分子基础:超越常见的疑点
这种分类单元特异性基因(Box1)可以对表型多样化和创新产生深远影响,有时会形成控制共同适应的性状集的超基因。在本文中,作者回顾了最近的研究,这些研究指出了表型变异的具体遗传原因,特别是在自然生物体中,强调了生物体进化分子机制的多样性和复杂性。Box1类群特异性基因随着生命之树全基因组测序的爆炸式增长,人们...
Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型...
组合遗传策略是一种通过分析多个基因变异与癌症表型之间的关联来探索癌症发生机制的方法。该策略通过综合考虑多基因交互作用,提供了更全面的癌症遗传图谱。在癌症研究中,组合遗传策略有助于揭示复杂的遗传网络,为癌症预防、诊断和治疗提供新的思路和方法。单细胞和空间解析测序技术在癌症研究中的优势是什么?
近10年柑橘芽变选种新进展
芽变鉴定方法检测柑橘芽变的方法多种多样,有些可以通过形态学观察来鉴定(www.e993.com)2024年11月3日。但是有的芽变品种则是改变了果实的风味等不好辨别的性状,一般需要细胞学观察和分子标记技术等来确定其遗传物质发生的改变。细胞学标记主要包括染色体核型和带型。最常用的标记技术便是流式细胞术。流式细胞术是指利用流式细胞仪对处在快速...
髓母细胞瘤肿瘤排斥性抗原和免疫学特征的鉴别
总之G3型和G4型肿瘤的新抗原数量比WNT和SHH型肿瘤少。另外从所有肿瘤中鉴定出的3018个突变(SNV和插入/缺失)中,仅有390个具有免疫原性(12.9%),这表明并非所有可鉴别的突变都具有免疫原性。图2:MB中MHC-I/II类限制性新抗原。A:各个亚型MHC-I类限制性新抗原;B:MHC-I类限制性新抗原按变异类型分组;C:各个...
专家论坛|唐洁婷/茅益民:中草药相关肝损伤的诊断——实践中的挑战
专家意见是重要的DILI因果关系评估方法之一,被认为是金标准。DILIN开展的前瞻研究采用结构性专家意见(SEOP)进行因果关系评估。对疑似DILI的个体患者,专家意见是在综合考虑所有目前已知的相关信息后做出的专业判断,其优势是可进行更细致深入的鉴别诊断,有助于考虑到不同的或少见的DILI特殊表型。尽管SEOP可克服RUCAM量表的...
最新发布丨重度哮喘诊断与处理中国专家共识(2024)_腾讯新闻
(一)临床表型依据患者临床表现,结合病理生理学、影像学、疾病的自然转归和药物治疗的反应性等特征,目前重度哮喘可区分为以下几种临床表型(表1)。1.早发过敏性哮喘:起病年龄是成人哮喘表型的良好识别标志[188]。早发过敏性哮喘虽然缺乏确切年龄界限,但儿童期起病的成人哮喘患者多属于此表型。患者多有过敏性鼻炎...
Nature Methods | 多中心协作揭示:非编码CRISPRi筛选的力量与潜能
数据分析工具的基准测试:研究比较了五种不同的筛选分析工具,包括CASA,来评估哪种工具在确定CRE时最为保守且能有效规避低特异性sgRNA带来的问题。功能性确认的CRE-基因联系:通过在特定的细胞类型(如K562细胞)中进行大规模的CRISPRi筛选,研究人员能够识别并确认CRE与特定基因之间的直接联系。