追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
研究团队构建了希望语言数据集,并提取了心理语言学和情感特征,探讨了不同类型希望(如普遍的、现实的、不现实的)的认知、情感和沟通特征差异。通过训练机器学习模型(如LightGBM和CatBoost),研究团队成功分类了不同类型的希望语言。结果显示,经过超参数调优后,LightGBM和CatBoost模型的表现超越了传统的机器学习方法,接近深度...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
short-read测序是检测和定量转录组范围基因表达的最常见方式,部分原因是因为它比表达芯片更便宜、更易于应用,但更主要的是它可以获得全转录组水平高质量的表达数据。采用Illumina的short-read测序做DGE分析的核心步骤包括RNA提取,cDNA合成,接头连接,PCR扩增,测序和数据分析(图一)。由于mRNA片段化和基于beads的文库纯化过...
如何为CbM传感器设计一款小巧的共享电源和数据接口
对结构的模态响应进行仿真可使用基于ANSYS或类似程序的有限元方法(FEM),这样有助于优化设计和减少传感器原型制作的迭代次数。方程1是单自由度系统模态分析控制方程的简化形式。固有频率与外壳设计的质量矩阵(M)和刚度矩阵(K)有关。方程1提供了一种简单、直观的设计评估方法。如果降低传感器外壳的高度,刚度增大,质量减...
eDNA增进北极生物多样性研究:拖网与分子数据的结合分析
分子操作分类单元(MolecularOperationalTaxonomicUnits,简称MOTU),是一种基于分子数据对生物进行分类的方法。它通过对DNA或RNA序列进行聚类分析来划分MOTU,每个MOTU代表一群具有高度相似性(通常>97%)的序列。MOTU在许多情况下可以作为传统分类单元的补充或替代。MOTU的概念最初是由Schloss等人在2011年提出的,旨在解决...
...Methods | 克服PCR扩增误差:利用同源三聚体核苷酸提高测序数据...
评估UMI错误校正效率的方法通常包括比较校正前后的数据准确性、复制序列的一致性以及假阳性率的变化。通过分析特定UMI标记的序列在PCR扩增和测序过程中的变异情况,可以直观地评估UMI的错误校正能力。此外,采用模拟数据集进行错误引入和校正的实验,也是评估UMI校正效率的有效方法之一。通过这些方法,可以全面了解UMI设计对于提高...
乳腺癌FISH检测可能还有哪些漏网之鱼|预后|组织学|her2|美国临床...
2.导管原位癌(DCIS):HER2扩增常见于DCIS,特别是高分级病变(www.e993.com)2024年10月23日。3.较少见于低分级肿瘤:低分级(Grade1)肿瘤通常不伴有HER2基因扩增。不一致情况的基础解读当HER2基因扩增与组织病理学特征不符时,可能有以下几种解释:1.检测方法的技术误差:免疫组化(IHC)和荧光原位杂交(FISH)检测的误差:IHC用于检测HER2蛋白表达...
最新发布丨Ⅳ期原发性肺癌中国治疗指南(2024版)
临床信息包括姓名、性别、年龄、病历号、送检科室、病变部位、活检方式或手术方式、相关肿瘤史和治疗史。大体描述内容包括标本类型、肿瘤大小、与支气管或胸膜的关系、其他伴随病变或多发病变、切缘。诊断内容包括肿瘤部位、组织学亚型。(六)分子病理检测对于Ⅳ期NSCLC中的肺腺癌、含腺癌成分的其他类型肺癌、小的组织...
微生物组-宏基因组分析专题研讨会 (2024.11,线下+线上)
图6.宏基因组学常用手段:扩增子、宏基因组、宏转录组所能回答的科学问题五、宏基因组学有参分析流程刚上手每个样品几G到几十G的数据,如果无从下手,还是建议立马来一套有参分析,快速获得样品的物种组成和功能组成。有参(Reference-based)方法,顾名思义,是直接使用现在的物种、功能基因注释数据库,数据只通过...
读书笔记丨感恩并传承CTONG-中国肺癌原创临床研究|吉非|肺腺癌|...
读书笔记(INTEREST研究):是一项大型Ⅲ期随机对照临床研究,总计1466例既往接受过化疗的晚期非小细胞肺癌患者随机接受吉非替尼或者多西紫杉醇治疗,预先设定的肿瘤组织生物标志物与临床疗效相关性分析结果,生物标志物检测项目包括:FISH法检测表皮生长因子受体EGFR基因拷贝数(374例可评价标本)、免疫组化法检测EGFR蛋白表达(380...
Cancer Cell:顾伟/刘彦卿等2万字长文综述全面总结p53领域研究进展
p53蛋白可经历多种类型的PTM,包括ubiquitination、phosphorylation、acetylation、methylation、SUMOylation、NEDDylation、OGlcNAcylation、ADP-ribosylation、UFMylation、hydroxylation、β-hydroxybutyrylation、sulfation及isoLGadduction(参见)。不同的刺激信号决定PTM的位点和类型。p53的许多PTM是可逆的。PTM对p53的影响包括改变...