Cell | 转座子:基因组中的“垃圾”如何化身为免疫调控的利器?
数据统计了各种转座子(TEs)类型的外显子化事件,主要包括SINE(短散布核元件,如Alu)、LINE(长散布核元件)、LTR(长末端重复序列)以及DNA转座子等。研究发现,在免疫基因中,Alu等SINE转座子的外显子化事件最多,且它们可以与母基因的正义链或反义链结合,从而形成新的剪接位点。IFNAR2-S和IFNAR2-L的异构体比对...
Cell:北京大学杜鹏团队通过剪接抑制获得两种新型人全能性干细胞
这种类ZGA细胞被命名为ZLC(ZGA-likecells)。通过对8CLC和ZLC进行转录组比较,发现ZLC的转录组与已知的8CLC显著不同。这两种细胞类型都富集一组8细胞/桑椹胚特异性基因(commonZGAgenes),如HIST1H2BG/BK、GADD45A/B和GPATCH3。然而,与8CLC不同,ZLC并不表达典型的ZGA基因如DUXA/B、ZSCAN4/5B、LEUTX和TP...
《细胞》重磅:北大团队获得两种新型人全能性干细胞
这两种细胞类型都富集一组8细胞/桑椹胚特异性基因(commonZGAgenes),如HIST1H2BG/BK、GADD45A/B和GPATCH3。然而,与8CLCs不同,ZLCs并不表达典型的ZGA基因如DUXA/B、ZSCAN4/5B、LEUTX和TPRX1(8CLCZGAgenes),反而表达了一组在8CLCs中不激活的8细胞/桑椹胚特异性基因(ZLCZGAgenes),如ZNF23...
Cell | 北京大学杜鹏课题组通过剪接抑制获得两种新型人全能性干细胞
这两种细胞类型都富集一组8细胞/桑椹胚特异性基因(commonZGAgenes),如HIST1H2BG/BK、GADD45A/B和GPATCH3。然而,与8CLCs不同,ZLCs并不表达典型的ZGA基因如DUXA/B、ZSCAN4/5B、LEUTX和TPRX1(8CLCZGAgenes),反而表达了一组在8CLCs中不激活的8细胞/桑椹胚特异性基因(ZLCZGAgenes),如ZNF23/34、FAM...
Nature | 首次获得非人灵长类动物的性染色体完整序列,揭示不同...
图2:在组装中获得的序列、非B型DNA、基因、序列类别、回文和染色体内相似性02重复序列的组成和甲基化研究团队通过全面注释发现,Y染色体和X染色体长度的71–85%和62–66%分别由重复元件组成(图3),包括转座元件、卫星序列和简单或低复杂度区域,相比之下,人类T2T常染色体长度中只有53%是重复元件。在Y染色体上,重...
平均准确率达96.4%,中山大学&重庆大学开发基于Transformer的单...
单细胞ATAC-seq(scATAC-seq)技术是一种用于探究单个细胞内转座酶可接近性染色质的测序方法,它为理解基因调控机制与表观遗传异质性提供了前所未有的单细胞分辨率(www.e993.com)2024年12月19日。虽然scATAC-seq数据蕴含丰富的生物学信息,但由于其高维度(大量开放染色质峰)和极端稀疏性(每个细胞仅有一小部分峰有读数),使得从这些数据中准确地识别...
Nature:老人「致命一跤」有救了!广州健康院揭秘衰老个体肌肉萎缩...
此外,一些富集的转录抑制因子是肌纤维类型特异性的,例如,TBX15富集I型肌纤维,JDP2富集II型肌纤维。这两种转录因子通过抑制AP-1复合物活性参与糖酵解肌纤维代谢和心肌细胞保护,它们的富集可能解释了老年肌纤维类型特异性功能障碍。5.过早启动衰老导致的肌肉衰竭...
中国碳青霉烯耐药肠杆菌科细菌感染诊治与防控专家共识
免疫层析技术操作简单,结果容易判读,但价格较高,适用于高危患者(免疫抑制患者或骨髓移植患者等)分离的CRE菌株碳青霉烯酶类型的快速检测,有助于临床尽早启动更加精准的抗感染治疗方案。三、CRE感染治疗原则、主要治疗药物和给药方案1.CRE感染的抗菌治疗原则
Nature连发10篇,揭示迄今最全小鼠完整大脑细胞图谱
研究团队结合了两个海量数据集——约700万个细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据和约430万个细胞的空间转录组学(MERFISH)数据,将小鼠全脑细胞分为34个大类(class),再进一步细分为338个子类(subclass),1,201个超型(supertype),5,322个细胞集群(cluster)。其中,神经元的细胞类型显示出惊人的多样性,共有5,205个...
甘蓝类蔬菜何以快速驯化?研究发现是它在“推波助澜”
甘蓝类蔬菜作物种类众多，包括结球甘蓝（圆白菜）、花椰菜、青花菜、芥蓝、苤蓝、羽衣甘蓝、抱子甘蓝等十余种变种类型，在世界范围内广泛种植，是我国最重要的一大类蔬菜作物之一。甘蓝类蔬菜虽具有形态类型快速多样化驯化的特征，但与其他作物相比，其在较短的驯化过程中形成异常丰富表型变异的机制尚不清楚。因此，揭示...