科学家研发新型核酸检测系统,无需依赖昂贵蛋白质酶,单次材料成本...
受自然酶和核酸酶的启发,通过实施异构模块(如aptamer、toehold)来设计异构的DNAzyme生物传感器,可以通过小分子、蛋白质、核酸或细菌等,调节因子介导其催化活性。传统的异构DNAzyme生物传感器通常被设计成多组分分子复合体,通过具有toehold的抑制链,来抑制并释放DNAzyme。以及通过在靶结合后分裂并恢复催化...
线粒体前蛋白输入的分子途径,PCR Clean??高效清除核酸污染
最近在TIM23复合体中发现的亚基是Mgr2,它具有两个TMs,与Tim17和TIM23具有序列同源性。Mgr2是一个非必需的亚基,其功能是作为看门人调节TMs从转位体的侧向释放。在序列前途径中,TOM和TIM23复合体被精心安排以实现有效的蛋白质跨线粒体双膜输入。已经确定TOM和TIM23在蛋白质易位过程中形成一个超复合体。然而,...
Nature | 不止蛋白质结构!AlphaFold3可高精确度预测生物分子结构...
对于蛋白质-核酸复合物和RNA结构,AF3预测准确性也高于RoseTTAFold2NA(目前最好的预测方法),AF3能够预测具有数千个残基的蛋白质-核酸结构。此外,AF3还可以准确预测共价修饰,包括对任何聚合物残基(蛋白质、RNA或DNA)的修饰。在扩展建模能力的同时,相对于AlphaFold-Multimerv2.3,AF3也提高了对蛋白质复合物的预测准...
更高准确性,覆盖蛋白等更多分子,DeepMind发布AlphaFold新版本
新版模型AlphaFold-latest(暂称)极大地扩展了应用范围,能够预测包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物的联合结构。这些不同的结构类型和复合物对于理解细胞内的生物机制至关重要。在大多数情况下,AlphaFold-latest比以前的专业工具大大提高了准确性:蛋白质-配体相互作用的准确性优于最先进的对接...
《自然》重磅!AlphaFold 3不止预测蛋白质结构,还可以…
其诞生也“解决了生物学50年来的一个重大挑战”。而AlphaFold3则在此基础上进行进一步的突破,科学家可以在模型中输入一个生物分子复合体的描述,并在几秒内获得该复合体3D结构的准确预测。输入的生物分子系统可以包含多种蛋白质、核酸(DNA和RNA)、小分子配体和离子。
“开门红”小核酸时代将开启?热门靶点、国内企业管线布局早知道
ASO与靶标mRNA结合通过诱导降解、空间位阻阻碍翻译或影响核酶剪切性调节等方式调控表达;siRNA包含正义链和反义链,它与AGO2等结合形成沉默诱导复合体(RISC),正义链被降解,反义链指导RISC识别与结合到靶标mRNA的相应位点,通过复合体中的核糖核酸酶剪切靶mRNA,从而达到调节靶基因的蛋白表达(www.e993.com)2024年7月27日。
产品科普|简述小核酸药物
Aptamer是一段经体外筛选得到的,折叠成特殊三维结构的短单链寡核苷酸,能特异性结合较大范围的目标,包括蛋白质、小分子、金属离子、病毒、细菌和全细胞,其高特异性和结合亲和力可达到抗体水平。相比抗体药物,核酸适配体具有体积小、较低免疫原性、无细胞化学合成以及较强组织穿透力、易修饰成本低等优点,在疾病诊断、治...
...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。
加州大学团队提出AI生信模型,填补RNA结合蛋白的认知空白
RNA结合蛋白,是一类具有特定功能的蛋白质,它们通过自身单体、或以核糖核酸蛋白复合体(RNP复合体)的形式,参与调控RNA分子生命周期中的每个关键步骤。RNA结合蛋白能与RNA分子发生物理互作,从而对RNA的转录、剪接、稳定性、运输和翻译等进行调节。这些过程对于细胞功能的调控非常重要,而RNA结合蛋白的...
AlphaFold3: 生物分子预测的大一统工具?
为了衡量AF3在预测不同生物分子结构上的表现,研究者分别在蛋白质-配体相互作用、蛋白质-核酸复合体、RNA结构、共价修饰、蛋白复合体四个任务上对AF3的准确性进行了测量。对于蛋白质-配体相互作用预测,AF3在PoseBusters5基准数据集上进行测试。在蛋白质-配体相互作用任务上,主要有两类模型:一类仅使用蛋白质序列和配...