...健团队发现胰腺癌seRNA甲基化调控组蛋白修饰和癌基因表达新机制
此项研究首次揭示了胰腺癌中seRNA甲基化修饰对组蛋白修饰和癌基因表达的调控,扩展了人们对超级增强子及其转录本功能新的认知。此种表观转录组和表观基因组的相互作用必定与其它类型癌症也有关系,因此可能开辟一个癌症中基因表达调控新的研究方向。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是哺乳动物RNA最常见的修饰,对多种生理和病理...
...| 中山大学李陈龙团队揭示植物BCL7A/B亚基调控基因表达和营养...
植物的SWI/SNF复合体可分为三类,分别是BAS复合体(BRM-AssociatedSWI/SNFcomplex)、SAS复合体(SYD-AssociatedSWI/SNFcomplex)、和MAS复合体(MINU-AssociatedSWI/SNFcomplex)。在这项研究中,研究人员通过ChIP-seq和RNA-seq展示了拟南芥中的BCL7A/B作为SWI/SNF复合体的成员,...
10分+ 使用单细胞数据预测序列模序对基因调控的影响
转录因子在近端启动子和远端增强子处的结合是基因调控的核心。识别调控模序并量化其对表达的影响仍然具有挑战性。使用在单细胞数据上训练的卷积神经网络,本研究推断出假定的调控基序和细胞类型特异性的重要性。我们的模型scover解释了多个小鼠组织中基因表达方差的29%。将scover应用于使用来自发育中人脑的scATAC-seq鉴定...
《自然》:癌症为了进展和转移,究竟打开/关闭了哪些基因?科学家...
对比癌细胞和正常细胞,研究者们分别发现了22187个和29074个在癌细胞中可及性增加和降低的区域,75%的DACR与肿瘤的基因表达变化方向匹配。癌症类型特异性DACR包括GBM中的HOXA4、这是一个已知的不良预后因素,还有BRCA中的FGF19和ccRCC中的EGLN3,都是相应癌种的已知病理标志物。研究者还进一步分析了原发癌和转移癌...
科学家建立全脑甲基化和三维基因组图谱,为大脑提供分子百科全书
刘翰青表示,已经有不少研究在使用类似ChatGPT这样的模型,去理解大脑不同细胞类型的基因调控元件模式,并且在此基础上生成自然界中不存在的序列,但却可以具有在特定细胞或者组织中调控基因表达的功能。图丨大脑中一致的空间表观基因组和转录组多样性(来源:Nature)例如,最近在Nature发表了两篇论文,用机器学习...
核酸的功效与作用
核酸还参与了基因表达调控的过程,即控制哪些基因在何时何地被激活或沉默(www.e993.com)2024年7月29日。这种调控有助于生物体适应环境变化、分化为不同类型的细胞以及执行特定的任务。3.免疫调节此外,核酸还具有一定的免疫调节作用,能够影响机体的免疫应答。适当补充核酸有利于增强机体免疫力,减少感染性疾病的发生风险。
Nature | 怀孕与逆龄的奇妙联系:科学揭示生育对DNA的年轻化效应
DNA甲基化是细胞调控基因表达的一种关键表观遗传机制。通过在DNA序列中的特定位点添加甲基团(一个碳原子和三个氢原子组成的基团),细胞能够控制基因的活性,而不改变DNA序列本身。这一过程对于正常的细胞发育、分化以及多种生理过程至关重要。DNA甲基化通常发生在胞嘧啶核苷酸的5位碳上,形成5-甲基胞嘧啶。这种化学修...
Nature连发10篇,揭示迄今最全小鼠完整大脑细胞图谱
(2)构建小鼠全脑脊髓投射神经元与脊椎动物视网膜神经元分类图谱;(3)剖析小鼠全脑表观遗传学特征与基因调控元件。这些发现对完整的哺乳动物大脑结构和组织,以及单个脑细胞和神经回路的功能提供了详尽的信息。此外,它们也为进一步研究哺乳动物大脑的发育和演化提供了工具,包括不同类型的细胞组织引起神经系统疾病的微观机...
结构变异:甘蓝进化的“分子加速器”
该研究构建了包含所有变种类型的甘蓝泛基因组,揭示了甘蓝变种快速驯化的隐藏驱动力(2.780,-0.06,-2.11%),获得了一批重要性状的关键基因。钱前告诉《中国科学报》,这项研究回答了甘蓝是如何在较短的时间内驯化出如此多样的变种类型,揭示了结构变异(SV)调控基因表达是甘蓝多样性进化的“分子加速器”这一重要规律,为...
养虾新利器!生物肽(AMP)在养虾中,妙用无穷!
2、SpPR-AMP1对虾免疫基因表达的调控作用与对照组相比,以5μg/g剂量注射SpPR-AMP1对虾没有毒性作用。然后在肽注射后0、6、24和48小时收集血细胞样本,并对虾中免疫基因的表达水平进行RT-PCR分析。结果显示,SpPR-AMP1可以激活虾血细胞中抗菌肽基因的表达,包括:ALF(LvALF;DQ208703)、青霉素(LvPEN3;DQ20...