中国科大首次解析人类溶酶体维生素B12外排蛋白ABCD4的电镜结构

该蛋白由606个氨基酸残基组成,以同源二聚体的形式在人体内行使功能。本次解析的结构为生理状态下ABCD4二聚体复合物的结构,包含两个六次跨膜的跨膜结构域(TMD)和两个核酸结合结构域(NBD),整体呈现对溶酶体内开放的构象,其中两个核酸结合结构域各自结合一个ATP分子并二聚化,两个跨膜结构域通过跨膜螺旋的交错形成...

超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用

2020年,谷歌旗下公司DeepMind推出了基于人工智能(AI)的蛋白质结构预测工具——AlphaFold,2021年7月,DeepMind团队推出了AlphaFold2,其能够根据氨基酸序列来准确预测蛋白质的三维结构。此后,DeepMind团队还推出了AlphaFold-Multimer,用于预测蛋白质-蛋白质复合物的结构和相互作用。不过,扩大单一深度学习模型能预测的复合物范围...

...AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构...

在蛋白质中,氨基酸以长链的形式连接在一起,然后折叠成三维结构,这对蛋白质的功能至关重要。自20世纪70年代以来,研究人员一直试图根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这非常困难。然而,就在四年前,科学家在这一领域取得了惊人的突破。2020年,Hassabis和Jumper首次公布了AlphaFold2人工智能模型。在该模型的帮助下,二人得以...

同时生成蛋白序列和结构,David Baker团队序列空间扩散新模型

从噪声序列表示开始,PG通过迭代去噪生成序列和结构对,并以所需的序列和结构蛋白质属性为指导。研究设计了具有不同氨基酸组成和内部序列重复的耐热蛋白质和笼状生物活性肽,例如蜂毒肽。PG设计轨迹可以由实验序列活性数据指导,为蛋白质功能的综合计算和实验优化提供了一种通用方法。该研究以「Multistateandfuncti...

Nature子刊:中山大学/西湖大学合作揭示多肽的氨基酸组成及拓扑...

随后,在类风湿关节炎(RA)慢性炎症动物模型中证实了聚精氨酸的抗炎作用。综上所述,该研究在天然多肽的启发下,通过人工合成多肽,阐明了其氨基酸组成和拓扑结构对抗炎作用的影响。因此,该研究提供了阳离子核酸清除剂阻断炎症反应的结构证据,促进了该领域的概念验证研究向临床应用的发展。论文链接:...

川北医学院2025考研招生自命题科目考试大纲:638生物化学(理)

(一)生物大分子的结构和功能1.组成蛋白质的20种氨基酸的化学结构和分类(www.e993.com)2024年11月14日。2.氨基酸的理化性质。3.肽键和肽。4.蛋白质的一级结构及高级结构。5.蛋白质结构和功能的关系。6.蛋白质的理化性质(两性解离、沉淀、变性、凝固及呈色反应等)。7.分离、纯化蛋白质的一般原理和方法。

洪亮团队基于图扩散概率模型生成活性高、体积大、结构复杂蛋白质

在前向扩散过程中,输入蛋白中的每种氨基酸类型都通过遵循某个替换概率矩阵,在T个步骤中被逐步破坏,以达到均匀分布;逆向扩散过程从随机抽样开始,每个氨基酸节点的类型在20种氨基酸类型中均匀分布,随后进行逐步去噪过程。去噪过程受到条件的指引,如待生成序列的野生型骨架结构和二级结构,以及基于野生型蛋白质的氨基酸替换...

全球与中国氨基酸分析仪行业市场调查研究及发展前景预测报告(2024...

氨基酸分析仪报告详细探讨了产业链结构、价格趋势,并对氨基酸分析仪各细分市场进行了研究。同时,预测了氨基酸分析仪市场前景与发展趋势,剖析了品牌竞争状态、市场集中度,以及氨基酸分析仪重点企业的表现。此外,氨基酸分析仪报告还揭示了行业发展的潜在风险与机遇,为氨基酸分析仪行业企业及相关投资者提供了科学、规范、客观的...

2025年浙江理工大学硕士研究生招生考试初试338生物化学考试大纲已...

(一)结构生物化学1.蛋白质的结构与功能:(1)氨基酸分类、结构、性质和功能,氨基酸的分离与纯化(2)肽与肽键,寡肽的理化性质,天然活性肽(3)蛋白质的结构、功能以及结构与功能的关系(4)蛋白质的分类、理化性质及研究技术和方法2.核酸的结构与功能:...

中国科大用深度学习实现高实验成功率的蛋白质序列从头设计

第一部分为预训练的编码器-解码器网络:该网络用Transformer把中心氨基酸残基的化学和空间结构环境映射为隐空间表示向量,再用多层感知机网络将该向量解码为包括中心残基氨基酸类型在内的多种真实特征(图1a)。在方法的第二部分,经用非冗余天然蛋白序列结构数据训练后,ABACUS-R编码器-解码器被用于给定主链结构的全部或...