《Nature》新型DNA“活字印刷机”快速存储海量数据

对于“类型”,他们合成了数百个短单链DNA“砖块”,每个“砖块”长24个碱基,其序列被设计成沿着DNA模板与特定区域结合。然后,研究人员转向细胞中一种叫做甲基化的自然过程,用数字0或1对积木进行编码。在体内,细胞将甲基(一个碳原子和三个氢原子)附着在特定的DNA序列上,以指示哪些基因应该在不同的组织中表达和沉...

Nature Cancer:线粒体DNA突变增强免疫检查点疗法的癌症治疗效果

在这项研究中,研究团队旨在通过设计线粒体靶向碱基编辑器来诱导小鼠Mt-Nd5中的终止密码子提前(导致蛋白编码提前终止,产生截短突变),类似于在肿瘤中发现的人类MT-ND5基因的热点突变,将其引入多个黑色素瘤小鼠模型中,以一种生理学相关的、癌细胞特异性的方式评估线粒体复合物I功能障碍。该研究显示,小鼠Mt-Nd5的截...

华大基因基因测序技术又一突破:基于测序数据的碱基突变检测专利

基因测序是研究基因组学的关键之一,通过获取目标DNA片段中碱基(A、T、C、G)的排列顺序,科研人员能够深入了解生物体的遗传信息。然而,在实际应用中,碱基突变(即DNA序列中的某个碱基被另一个碱基取代)的检测尤为重要,因为这类突变往往与遗传疾病、肿瘤发生等密切相关。华大基因此次取得的专利名为“基于测序数据的碱...

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

长读长测序能够检测长度为1000到20000个碱基或更长的DNA(或RNA)片段。这些片段通常来自于“原生”分子,这些分子是直接从生物样本中提取出来进行分析的。相比之下,大多数短读长测序技术只能检测50-300个碱基长度的片段。2022年,长读长测序被《NatureMethods》评为年度技术,开始越来越多地应用于各类重要的研究项目中...

人造合成DNA,离现实又近了一步

我们知道,地球生命虽然形态各异、多种多样,但所有自然生命的碱基都可以用4个字母来表示,它们是腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。在DNA中,这些碱基以特定的方式配对,A与T配对,C与G配对。这种独特的分子几何结构,被称为沃森和克里克几何。

肿瘤基因检测方法有哪些

1.PCR技术:可以对DNA片段的拷贝数以及特定DNA序列是否存在等方面进行判断,对于基因诊断有重要意义(www.e993.com)2024年11月15日。而肿瘤的发生发展与细胞基因有关,在癌症早期或癌前病变阶段,可能只发生单个碱基改变或者插入缺失等微小变化,此时可以通过PCR技术,检测到这种微小的变化,从而帮助判断是否出现基因异常。

Nature子刊:毕昌昊/张学礼团队开发基于糖基化酶的新型碱基编辑器

碱基编辑通常使用可编程的DNA结合蛋白(例如nCas9)与脱氨酶(deaminase)进行融合,但脱氨酶可能导致非Cas9依赖的DNA或RNA脱靶,从而带来潜在安全性问题,还会对碱基编辑类型带来限制。2024年1月2日,中国科学院天津工业生物技术研究所毕昌昊团队和张学礼团队合作,在NatureBiotechnology期刊发表了题为:Glycosylase-basedbase...

Cell:消除脱靶性,实现精准的线粒体碱基编辑

线粒体(mitochondrion)是细胞的“能量工厂”,线粒体内有一套独立于细胞核的遗传物质——线粒体DNA(mtDNA),人类线粒体DNA的长度为16569bp,拥有37个基因,编码13种蛋白,这些蛋白都参与细胞的能量代谢。由于线粒体在能量稳态中的重要作用,线粒体DNA中的点突变就可导致发育障碍、神经肌肉疾病、癌症进展等等多种严重疾...

2024年最值得期待的11项临床试验:人工智能、碱基编辑、艾滋病疫苗...

Verve公司开发的这项临床试验VERVE-101,是全球首个体内DNA碱基编辑的人类临床试验,其通过单次给药,在肝脏中灭活PCSK9基因表达,以持久降低导致疾病的LDL胆固醇(LDL-C)水平。VERVE-101的成分是编码腺嘌呤碱基编辑器(ABE)的mRNA和gRNA,它们被包装在脂质纳米颗粒(LNP)中,并通过静脉注射进行递送。

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

虽然现在有几种方法可以使用,但是比较研究显示两种方法表现最佳,即RNaseH与RNAexome。如前所述,RNaseH法使用核酸酶消化RNA:DNA复合物中的rRNA,但保留降解的mRNA用于后续测序。RNAexome方法使用寡核苷酸探针来捕获RNA-seq文库分子,非常类似于外显子测序(exomesequencing)使用的策略。这两种方法应用简单,并都...