Science子刊发表上海交通大学蛋白质工程通用人工智能技术

Pro-PRIME模型在目前公共突变数据库中的283个蛋白质实验中(ProteinGym和ΔTm),表现出超越现有最先进模型的强大预测能力;同时在野生型蛋白质溶解温度Tm预测和最适酶促反应温度Topt预测中都取得了超越现有最先进模型的强大预测能力。在湿实验中,团队选择了五种蛋白质进行实际验证,包括LbCas12a、T7RNA聚合酶、肌酸酶...

陈玲玲:RNA有自己的特点,别把它当蛋白质来研究

这是因为在2005年左右,人们开始使用覆瓦式阵列(TilingArray)等基因组学、转录组学的方法对基因组进行大规模测序,发现以前认为不转录的基因区域实际可以被转录,产生了众多与编码蛋白质的信使RNA类似——带有5′端m7G帽子和3′端polyA尾巴——但不编码功能蛋白质的长非编码RNA。目前人们已经发现了数十万条不同的lncR...

ByteDance Research登Nature子刊:AI+冷冻电镜,揭示蛋白质动态

单链蛋白（氨基酸数量约1,000）图8CryoSTAR与CryoDRGN、3DFlex在EMPIAR-10059上的结果对比对于毒素蛋白α-LCT（EMPIAR-10827），cryoSTAR揭示了两种类型的运动，与离散3D分类发现的两种构象相吻合，且生成的粗粒度原子模型合理，与密度图拟合良好。结构正则化在这个具有连续异质性的小蛋白中效果显著...

技术变革还是炒作噱头?AI for Bio到底能做什么|AI驱动科学

ESM3是由一家新成立的前沿人工智能公司EvolutionaryScale创建的大型(98B参数)语言模型,该模型基于来自27.8亿种天然蛋白质的蛋白质序列、结构和功能数据进行训练[6]。输入一段给定的序列,它可以输出预测的蛋白质结构;输入一个结构,它可以预测匹配的序列。(于2024年6月25日正式发布,第一个兼具预测蛋白质序列、结构...

EMBO J:揭示TRP14是细胞内半胱氨酸还原的限速酶,调节蛋白质组半胱...

这种称为半胱氨酸的氨基酸不仅是蛋白合成所必需的,也是产生谷胱甘肽所必需的,而谷胱甘肽是一种含硫醇的低分子量分子,在细胞内高浓度存在,可提供还原当量,支持抵御氧化损伤和有毒代谢物偶联。一种曾经神秘的酶论文第一作者PabloMartí-Andrés博士说,“长期以来,TRP14一直没有明确的功能。我们的研究不仅明确了它在...

“增豆控油”小百科|什么是大豆的胰蛋白酶抑制剂,对人体有不利...

胰蛋白酶抑制剂是广泛存在于植物中的抗营养因子,例如大豆、水稻、玉米中都含有胰蛋白酶抑制剂(www.e993.com)2024年11月29日。而大豆中含有的蛋白酶抑制剂尤其丰富,含量约为2%,通常被认为是导致大豆食品不易被消化的主要原因。有研究认为大豆胰蛋白酶抑制剂具有抑制蛋白酶对蛋白质的分解作用,从而对肠道产生直接的刺激。同时还降低了蛋白质的利用率...

肌酐低淀粉酶高是什么问题

肌酐是肾功能的一项指标,主要反映肾脏的滤过功能。而淀粉酶包括血清淀粉酶和尿淀粉酶两种类型,正常情况下不超出正常上限值,若数值偏高提示可能有急性胰腺炎、胆囊疾病等消化系统疾病。一、肌酐降低1.生理因素:健康人群偶尔出现一次肌酐偏低,可能是由于饮食结构不合理导致,如长期素食者因摄入蛋白质不足可引起;也可能与...

《食品科学》:东北农业大学李柏良教授、郭增旺副教授等:乳脂肪球...

婴儿的消化系统与成人相比是不成熟的,这与酶的类型和非酶促参数(母乳喂养、喂养频率和胆盐浓度)有关。婴儿的膳食主要以高脂肪的液态奶为主,食物在嘴里停留的时间不长,所以胃和肠是最基本的营养消化场所。胃液中含有的酶主要是用于催化乳脂和蛋白质水解的胃脂肪酶和胃蛋白酶。胃相通过2种方式影响MFGM:1)胃脂肪...

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

每一个蛋白质都代表了多年的工作。通常情况下,一个博士生会在研究生阶段的四年或更长时间里,都在研究单个蛋白质的结晶,从中收集或解释数据,从而确定折叠结构。在当时,牛津大学生物物理学系是世界上X射线晶体学的中心之一。1965年,蛋白质晶体学的先驱之一DavidPhillips在那里首次确定了溶菌酶(免疫系统用它...

...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...

蛋白质序列设计:深度学习可以用于预测蛋白质序列的功能和稳定性。通过神经网络模型和自然语言处理技术的结合,可以设计出具有特定功能和稳定性的蛋白质序列,例如酶活性、药物靶点等。蛋白质-蛋白质相互作用预测:深度学习模型可以预测蛋白质和蛋白质之间的相互作用,从而帮助设计新的蛋白质复合物和抗体。