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...AI技术在肺癌诊治中的应用?如何辅助病理类型分类、指导治疗决策?
1、辅助病理类型分类LUAD和LUSC在起源上存在差异,具有明显的病理特征和治疗方式。病理学家通常需要通过视觉判断进行分类,而人工智能模型已经成为有力的辅助工具。基于Inception-V3的深度卷积神经网络被用于将WSI分类为LUAD、LUSC和正常组织,其AUC为97%,其性能接近病理医生的水平。同时,另一个深度神经网络被创新性地用...
DNA甲基化和相关功能变化的泛癌图谱|介导|位点|dna|rna|特异性...
除了每个队列中的甲基化亚型外,研究人员还对HNSCC、LSCC、LUAD和PDAC进行了甲基化分析和特征富集分析,它们在UMAP中形成了一个不同的簇。研究人员鉴定了六个具有不同特征的甲基化组,包括富含免疫相关特征的组(MC1和MC2)、富含鳞状肿瘤的组(MC3和MC4)、LUAD显性组(MC5)和PDAC显性组(MC6)。MC5和MC6富含癌症类型特...
肺癌免疫治疗的进展、陷阱与前景|特异性|nsclc|美国临床肿瘤学会...
1、肺癌(SCLC,LUAD和LUSC)的遗传谱显示了几种癌基因和抑癌基因的变化Geneticproflingoflungcancer(SCLC,LUAD,andLUSC)haveshownchangesinseveraloncogenesandtumorsuppressorgenes2、免疫细胞(T、APC)与肿瘤细胞的相互作用ImmuneinteractionbetweenT-cells,APCs,andcancercells...
Nature:王凌华团队等通过单细胞和空间转录组揭示肺腺癌最早的细胞...
研究团队对全部样本进行了单细胞RNA测序,并对16个腺癌样本进行了全外显子组测序,并获取了229038个高质量的正常上皮单细胞的转录组数据以及17064个肿瘤细胞的转录组数据。这项研究工作是迄今为止关于早期未经治疗干预的肺腺癌在上皮细胞规模和整合数据类型上最大和最全面的单细胞研究。研究团队首先构建了正常上皮的...
Nat Commun | 基于单细胞和空间转录组学分析构建NSCLC免疫和非...
图2.整合的单细胞和空间转录组学揭示了LUAD和LUSC拥有不同的细胞-细胞相互作用网络03整合验证L-Rs在原位的相互作用基于scRNA-seq数据集中不同细胞类型的基因共表达,研究人员计算了显著L-Rs及其相互作用的细胞类型(www.e993.com)2024年11月12日。然而,为了辨别生物学上重要的相互作用,有必要确定相互作用的细胞类型是否确实在物理上是共存的。
JECCR:中国医科大学团队发现早期肺腺癌发生的重要生物学事件!
研究团队进一步利用TCGA数据库和脂质组学分析等技术,鉴定磷脂磷酸酶2(PLPP2)是LUAD早期阶段时脂筏形成的关键决定因素,参与调控组成脂筏的成分类型和含量。在体外实验中,利用RNA干扰技术使人肺癌细胞系的PLPP2表达下调时,脂筏标志物caveolin-1和flotillin-1的定位显著减少,肿瘤细胞增殖能力减弱、克隆集落数量减少,而且肿瘤...
8+新热点:外泌体+公开数据的预后相关分析~
接下来,本研究展示了17种TCGA癌症类型的泛癌TEXscore,癌症类型按TEXscore中位数排序(图3A)。高TEXscores显示在TCGA-PRAD、TCGA-BRCA、TCGA-ESCA、TCGA-HNSC、TCGA-READ、TCGA-LUSC、TCGA-GBM和TCGA-LUAD,表明这些肿瘤容易产生更多的TEX(图3A)。高TEXscore(作为连续变量和分类变量)与较差...
国家生物信息中心发布「癌症单细胞表达图谱」数据库:整合 208 个...
据介绍,ancerSCEM1.0版本整合分析了208个癌症scRNA-seq数据集,涵盖肺腺癌(LUAD)、结肠直肠癌(CRC)、恶性胶质瘤(GBM)等在内的20种人类癌症类型。研究团队还还开展了一系列附加分析,包括不同细胞类型间基因差异表达分析(可为新型标志物筛选提供参考)、细胞表面受体-配体基因对表达谱等,可为用户提供更加丰...
新突破,上海交大合作发现肺腺癌进展新机制
数据显示,T淋巴细胞和骨髓细胞占大多数的免疫细胞,与以往的研究一致,将T细胞和骨髓细胞重新聚类后,研究人员观察到IA中CD4+NR4A3和TAM-FOLR2细胞的比例相对于其他阶段显著增加。这些沿着LUAD进展的细胞动态变化通过内部早期LUAD队列的IHC染色在蛋白质水平上进一步得到验证,并部分得到对另一个已发表的数据集的深入分析的...