Nat Commun :原佳沛/张蔷/杨扬团队揭示基因启动子选择调控新机制
启动子在基因的转录起始过程中扮演着关键角色。在人类基因组中,蛋白编码基因通常拥有多个启动子,选择不同的启动子会产生不同的转录本1。启动子选择的失衡与多种组织发育异常及疾病的发生密切相关。尽管已有研究表明遗传变异位点能够影响可变启动子的选择,并在有限的组织类型中鉴定了相关的性状位点(PromoterusageQT...
Nat Commun 丨原佳沛/张蔷/杨扬团队揭示基因启动子选择调控新机制
启动子在基因的转录起始过程中扮演着关键角色。在人类基因组中,蛋白编码基因通常拥有多个启动子,选择不同的启动子会产生不同的转录本1。启动子选择的失衡与多种组织发育异常及疾病的发生密切相关。尽管已有研究表明遗传变异位点能够影响可变启动子的选择,并在有限的组织类型中鉴定了相关的性状位点(PromoterusageQT...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
这些方法的组合(也包括dRNA-seq和后面提到的分析其它状态的RNA的方法)允许研究者揭示由可变poly(A)(alternativepoly(A),APA),或选择性启动子(alternativepromoter)和可变剪接(alternativesplicing)导致的转录组的复杂性。Poly(A)富集的替代方法大多数发表的RNA-seq数据都是基于oligo-dT方法富集包含poly(A...
Nature系列综述:脂肪组织是生物衰老的关键
这种方法得到了遗传模型的支持,在该模型中,表达衰老标志物p16和p21的细胞通过激活特定启动子驱动的促凋亡转基因而被消除。据报道,这种方法可以延缓多种与衰老相关的表型出现,并延长平均寿命。除了遗传模型外,人们还在积极探索使用衰老细胞清除剂(senolytics,一种可以选择性消除衰老细胞的药物)。衰老细胞清除剂包括激酶抑...
人早期胚胎发育的表观遗传调控(染色质组蛋白修饰+DNA甲基化
组蛋白修饰变化普遍存在,发生在不同的发育时期和不同类型的基因组区域之间。组蛋白修饰具有组合作用,大致可分为两类:(1)促进性染色质相关修饰,如启动子上的H3K4me3,增强子和其他基因间区域的H3K4me1,以及活性增强子和启动子上的H3K27ac;(2)抑制性染色质相关修饰,如H3K27me3和H3K9me3。每一种修饰又会招募下游...
SWI/SNF全基因组靶点鉴定揭示染色质重塑因子 EP400的补偿作用
Cluster1基因主要富集在与细胞信号传导、发育和特定细胞类型相关的功能和一些非编码RNA(www.e993.com)2024年10月17日。此外,SWI/SNF抑制可以抑制CpG岛启动子和GC含量较低的启动子。BRG1在Cluster1启动子和增强子上的结合模式与其在+1核小体(启动子下游的第一个核小体)上的结合不同,这表明BRG1可能在Cluster1启动子和增强子上发挥核小体移除...
Cancer Cell:顾伟实验室长文总结p53领域45年研究进展
除了FLp53之外,p53基因还可以产生其它isoform,这是由启动子选择、选择性剪接、选择性翻译,甚至FLp53的翻译后切割引起的。由四种不同N末端(ATG1、Δ40、Δ133和Δ160)和三个不同的C末端(α、β和γ)的不同组合方式,p53蛋白有至少12种典型isoform。这些isoform的表达取决于其种类、发育阶段、组织类型,并且还...
Cancer Cell:顾伟/刘彦卿等2万字长文综述全面总结p53领域研究进展
除了全长p53(FLp53)之外,p53基因还可以产生其它转录本(isoform),这是由启动子选择、选择性剪接、选择性翻译,甚至FLp53的翻译后切割引起的。由四种不同N末端(ATG1、Δ40、Δ133和Δ160)和三个不同的C末端(α、β和γ)的不同组合方式,p53蛋白有至少12种典型isoform。这些isoform的表达取决于其种类、发育阶...
《食品科学》:四川农业大学刘书亮教授等:丝状真菌降解拟除虫菊酯...
毕赤酵母含有醇氧化酶(AOX)启动子,可用甲醇诱导调控外源基因的表达,既可实现胞内表达,也可实现胞外表达,与酿酒酵母相比,发酵产物不产生乙醇,不会对酵母生长有影响,大大提高了表达效率,适合大批量发酵生产外源蛋白。黑曲霉和米曲霉也属于GRAS微生物,作为丝状真菌表达宿主,可进行高效表达、高分泌及糖基化修饰和二硫...
学术大爆发!中国/华人学者一天发表35篇Nature Communications|...
在雌性小鼠胶质瘤模型中,BET抑制剂通过阻断IGF2BP3诱导的NETosis来增强oHSV的溶瘤活性,通过CDK9/RPB-1复合物募集BRD4到HSV基因启动子来增强病毒复制。总之,该研究揭示了m6A介导的NET形成的调控,强调了溶瘤病毒诱导的NETosis是阻碍溶瘤潜力的关键检查点,并提出了靶向NETosis作为溶瘤病毒治疗中克服耐药的策略。