...Discovery新成果!上海交大洪亮团队提出CPDiffusion模型,超低...

模型架构:6步法自动设计pAgo蛋白为了验证CPDiffusion对功能性蛋白质的生成效果,研究人员选择将关注点放在pAgo蛋白上。pAgo蛋白是一种在原核生物DNA干扰过程中起重要作用的内切核酸酶,能够特异性地识别并切割特定的单链DNA或RNA序列,在诊断学领域具有广泛的应用价值。此外,pAgo蛋白对底物具有高度...

美媒:原核生物或成气候变化赢家

原核生物对气候变暖的反应,既是理解在全球变暖中海洋的微妙平衡如何变化的关键,也是我们研究的重点。我们想预测气候变化将如何影响海洋原核生物的“生物量”或全球总重量。我们还想研究气候变化将如何影响它们的碳排放。为了做到这一点,我们建立了计算机模型,整合了数十年来对全球海洋进行的数十次科学调查的观测结果。

??Cell Res:我国学者开发零样本突变效应预测模型,高效指导蛋白...

为了验证ProMEP的零样本突变效应预测能力,研究团队使用ProteinGym测试基准中涵盖人类、其他真核生物和原核生物共53个蛋白的160万突变体及功能数据进行测试。现有的其他突变效应预测方法作为对比基准,包括MSA依赖的方法(如AlphaMissense和EVE),MSA-free的方法(如ESM2_3B,ESM2_650M,ESM1v和Tranception)。测试结果表...

国际地质多样性日丨复杂生物是如何出现的?

除了与线粒体内共生,一些能够进行产氧光合作用的蓝细菌与早期的真核生物发生了内共生,这便是真核生物细胞内叶绿体的来源,这也使得真核生物也可以利用光能、水和二氧化碳合成有机物,从此地球上的生产者不再只有那些原核生物,这些能够进行光合作用的真核生物在后来演化成了陆生植物和各种真核藻类,最终取代原核生物成为...

新物种、新 CRISPR 系统!Evo 大模型突破全基因组生成,创造生物大...

Evo使用大量的原核生物和噬菌体基因组序列在单核苷酸(单字节,注:这里同常规自然语言模型不同,自然语言模型1个token通常对应一到多个字符,这里一个token对应一个字符,更容易处理单核苷酸突变类似的情况。之前AlphaFold在处理单氨基酸突变的蛋白结构预测上表现不好。)分辨率上进行训练。

生命相变必然涌现,而演化则不可预期

反应与分子的比率R/M必然增加(www.e993.com)2024年10月31日。当系统中的分子具有一定的复杂性,及R/M比率时,一个集体自催化集(RAF)就必然出现(概率接近1.0)(3)。这是基本的一级相变,通过它可以产生自我复制的分子系统,例如6700种原核生物中都包含的小分子集体自催化集。

半夜灵机一动 ,他获得一个神奇“工具”

2014年,他与合作者在《自然-生物技术》发表相关研究论文,这是全球首个证明CRISPR(原核生物基因组内的一段重复序列)可以治疗遗传病的研究。当时,该研究在业内引起较大反响,美国多家媒体对他进行了专访。之后,他与合作者又一起研发了CRISPR体内递送方案,用于基因编辑的体内疗法。目前,这一基因编辑的体内疗法已经进...

2024年度(上半年)宝山区博士后创新实践基地科研项目,等你来揭榜!

专业方向:生物、生物化学拟提供科研经费(万元):50万元博士后薪资(元/月):2.5万元博士后类型:全职研发其他待遇:高温费、过节费、商业意外保险、年度健康体检项目介绍:外泌体是所有细胞(包括原核生物和真核生物)都会释放胞外囊泡,包含细胞的许多成分,包括DNA、RNA、脂质、代谢物以及胞质和细胞表面蛋白。外泌...

2024年江苏科技大学硕士研究生招生生物技术学院考试大纲

10、基因表达调控:掌握操纵子的概念、组成,了解操纵子模型调控原核生物基因表达的作用方式。掌握常见的概念如增强子、衰减子、启动子、反义RNA、DNA结合域等。2024年江苏科技大学硕士研究生入学考试自命题科目考试大纲1.土壤的概念;2.成土母质与土壤矿物质;...

...等开发大规模基因组重写技术,快速构建模拟人类疾病的动物模型

随着基因组合成技术的进步,我们现在已经可以合成原核生物(例如大肠杆菌、支原体)的基因组,甚至是合成真核生物酿酒酵母的染色体。然而,由于基因组的大小和复杂性,哺乳动物基因组合成仍然令人望而却步。人源化小鼠模型是研究人类疾病的重要模型,然而,许多人类疾病缺乏精确的小鼠模型,这是因为在技术上很难制造广泛的遗传人...