...UniKP 框架,大模型 + 机器学习高精度预测酶动力学参数
针对于此,中国科学院深圳先进技术研究院合成所罗小舟团队提出了,基于预训练大语言模型和机器学习模型的酶动力学参数预测框架(enzymekineticparameterspredictionframework,UniKP)。该框架仅通过给定酶的氨基酸序列和底物的结构信息,就可以实现多种不同的酶动力学参数的预测。此外,研究团队进一步将环境因素纳入考量,提...
AI大模型颠覆数十亿年蛋白进化模式 “按需定制”蛋白变革生物产业
通过深度AI蛋白质大模型与分子动力学模拟、量子化学等科学计算方法,构建端到端、低门槛的产业应用路径:抗体亲和力优化方案、极端环境下蛋白质稳定性优化方案、酶活性优化方案、酶——特定底物对接方案以及蛋白质从头设计方案。目前,NewOrigin与这些场景解决方案正逐步集成至MoleculeOS平台中。MoleculeOS是分子之心自研的全...
脑声常谈:激光散斑血流成像技术在慢性脑缺血动物模型中的应用
有研究探索更年期是否会加剧雌性小鼠慢性脑缺血所致的认知障碍,利用LSCI技术观察更年期CCH模型与对照CCH模型小鼠脑血流量变化,发现二者无明显差异,但证明CBF减少可导致小鼠日常生活能力受损。综上,LSCI技术可作为评价CCH动物模型成模的重要工具,并可对模型造模前后的CBF进行长期观察,判断不同造模方法对动物模型CBF的影响,从...
ADC的临床药理学基础
由于ADC具有多种清除途径(解离和分解代谢),以及存在多种分析物的复杂的PK特征,使得其动力学模型也较为复杂。不同的模型具有不同的应用,如可采用二房室模型和PBPK模型可以用清除率、解离、代谢速率等参数描述ADC的稳定性特征。目前非房室模型、群体药代模型、基于机制的模型、基于生理的模型在ADC药物动力学研究中均...
2024纯计算!宁波材料所,最新AM!|纳米|应力|原子|摩擦力|摩擦系数...
同时还提出了一种基于原子分子动力学的模拟方法,为准确揭示摩擦机理、指导设计润滑材料提供更多途径。研究亮点1、本文从基本的摩擦学分析模型出发,按照模拟精度和复杂度递增的顺序,总结了经典的MD、DFT、AIMD和QM/MM方法,并详细介绍了这些方法在研究具体摩擦学问题中的应用。
2024年6月小分子药物专利-吉利德小分子 GLP-1R 激动剂 GS-4571
专利中使用商业来源的重组人、小鼠和大鼠碱性磷酸酶测定化合物的水解动力学kcat、Km和kcat/Km(www.e993.com)2024年9月18日。化合物被重组人、小鼠和大鼠碱性磷酸酶以相似的效率水解(表2)。人和大鼠的酶是肠碱性磷酸酶,而小鼠APase是组织非特异性同工酶,这可以解释动力学参数的一些差异。
JACS | 深理工殷勤团队开发基于动态动力学拆分的吲哚不对称氢化新...
动态动力学拆分(DKR)是手性合成领域高效制备光学纯多手性化合物的理想方法,可将外消旋底物的两种对映体转化为单一对映体产物,这种巧妙的策略可以克服传统“动力学拆分”最大理论产率50%的限制。因此,DKR在构建具有多个立体中心的手性分子方面展示了巨大的潜力。基于DKR的不对称还原已被广泛研究并发展为制备具...
Zymeworks公司的新型喜树碱ADC荷载的分子设计与评估
耐受性的差异可归因于有效负载的不同特性,而不是ADC药代动力学的差异。根据ADC耐受性结果和总体小分子体外DMPK概况,选择FD1(ZD06519)作为开发多个ADC候选药物的主要有效负载。10.携带DL2并靶向不同TAA的ADC在小鼠模型中表现出强大的抗肿瘤活性,在NHP中表现出耐受性...
AI颠覆生物学!谷歌AlphaFold 3开启药物发现新时代
DemisHassabis强调,AlphaFold3模型和数据库技术已经开始有一些应用场景,对于药物和化合物发现有巨大的推动作用。相对于传统过程,AlphaFold至少快2、3倍,且系统足够准确。然而目前,AlphaFold3模型在立体化学、幻觉、动力学和某些目标的准确性等方面仍存在一定局限性。
从菌株之间的相互作用,解析控制着微生物群落的生态进化动态
因此,粗粒度组合(例如,同一分类家族的成员)应该更好地代表代谢生态位与群落组成之间的关系,特别是对于短期群落组装动力学。但目前尚不清楚一般应该如何定义这种组合,以及它们捕获了哪种类型的功能冗余,这是因为对构成“功能”的定义有很多。在本文之前的研究中,我们发现群落的底物消耗概况与群落组成(在16SrRNA...