追问daily | 首个跨物种生命基础大模型;睡眠剥夺对大脑发育的负面...

由中国科学院多个研究机构组成的团队近日在顶级期刊CellResearch上发表了重要突破——世界首个知识与数据联合驱动的多物种生命基础大模型GeneCompass。该模型利用了人类和小鼠的1.26亿个单细胞数据,覆盖超过3.6万个基因,融合了四种生物学先验知识(promotersequences、基因共表达关系、基因家族标注和基因调控关系),展示...

为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字详解:AI重塑结构生物学

模型建成后,科学家用尺来测量各原子之间的距离,确定蛋白质结构坐标。“这个方法很古老,”桑顿说。接下来,他们将所有坐标数据输入计算机中,计算机版本的蛋白质结构看上去像一片密林,她继续解释道,原子杂乱聚集在一起,只有戴上3D眼镜,才开始能看到蛋白质的拓扑结构。“整个过程非常折磨人,”桑顿说,“但结果出来后又令...

新一代高分辨化学成像显微镜,突破荧光限制,开启生命科学新纪元!

mIRage不仅具备传统荧光显微镜的荧光成像功能,还采用新型光学光热红外(O-PTIR)技术,能够对物质的分子结构进行无荧光标记的化学成像,解决了传统化学成像空间分辨率低的问题,其化学成像分辨高达500nm,可在亚微米尺度上对细胞或组织内的目的蛋白或分子进行表征。这为代谢组学、细胞生物学、药物学等多个生命科学研究领域提...

科学家用最先进的成像技术揭开细胞结构的神秘面纱

这项尖端技术可以使细胞及其成分在不变形的情况下逐渐膨胀,这样就可以使用传统显微镜以极高的分辨率对它们进行观察。以如此高的分辨率获取中心粒图像可以确定蛋白质在特定时间的确切位置,但却无法提供关于亚结构域或单个蛋白质出现顺序的信息。该研究的第一作者、前联合国工程师学会研究和教学人员MarineLaporte利用膨...

广州健康院电镜平台:看清细胞里的“小宇宙”

助力细胞超微结构功能探索为了寻找预防和治疗脑梗死的药物，广州健康院研究员潘光锦团队通过研究脑缺血动物模型，确认研究药物的疗效及作用机制。在此过程中，需要对神经元的亚细胞器以及神经突触等超微结构深入到纳米级进行观察。常规的光学显微镜分辨率无法达到分辨突触前后膜的尺度，需要利用电镜技术进行确认。李合英十年...

斑马鱼行为篇(58):骨质疏松斑马鱼模型

骨质疏松是以骨量减低、骨显微结构退化、骨脆性增高、易发生骨折为特征的全身代谢性骨疾病,而糖皮质激素是引起骨质疏松、增加骨折风险的常见因素(www.e993.com)2024年11月22日。2006年,BarrettR等首次采用不同浓度泼尼松龙作用不同时间,创建斑马鱼骨质疏松模型,并最终确定泼尼松龙建模的最佳浓度为25μM,最佳暴露时间为斑马鱼受精后4～5h,且连续作...

广州健康院电镜平台:看清细胞里的“小宇宙”—新闻—科学网

为了寻找预防和治疗脑梗死的药物,广州健康院研究员潘光锦团队通过研究脑缺血动物模型,确认研究药物的疗效及作用机制。在此过程中,需要对神经元的亚细胞器以及神经突触等超微结构深入到纳米级进行观察。常规的光学显微镜分辨率无法达到分辨突触前后膜的尺度,需要利用电镜技术进行确认。

斑马鱼行为篇??:斑马鱼肝纤维化模型

遗传操作斑马鱼HF模型HBV/HCV转基因斑马鱼丙型肝炎病毒(HCV)宿主范围极窄,建立动物模型比较困难。转基因斑马鱼的出现就很好地解决了这个难题。通过显微注射pFL-GIC(HCVIRES介导核心蛋白Core表达)和pFL-5AiR(含有HCVNS5A的表达质粒)构件显示,Core与NS5A协同上调Tgf-β的转录水平,促使HSC转化为MFB,分泌大量ECM,产生纤维...

Nature评选今年值得关注的七大科技:蛋白质设计、脑机接口、细胞...

“基于序列”的蛋白质设计使用了大语言模型,这一模型也使得聊天机器人ChatGPT等工具的出现成为可能。如果把多肽看作“文字”,而蛋白序列是由这些“文字”组成的文件,算法通过学习真实世界中蛋白质的结构,可以识别出其中蕴含的模式。巴塞罗那分子生物学研究所的蛋白质生物化学家诺埃利亚·费鲁兹(NoeliaFerruz)表示:“它...

JACS等高水平成果汇总!新型光热红外技术,亚细胞无标记化学成像利器!

加州大学圣巴巴拉分校的KennethS.Kosik研究组以棕榈酸叠氮化物(azide-PA)作为探针,使用非接触亚微米分辨红外拉曼同步测量系统——mIRage检测体外细胞模型中新合成的脂质以研究细胞脂代谢。该成果以Single-cellmappingoflipidmetabolitesusinganinfraredprobeinhuman-derivedmodelsystems为题发表在Naturecomm...