实现蛋白质动态对接预测!上海交大/星药科技/中山大学等联合推出...

提出了为蛋白质动态对接(dynamicdocking)设计的几何深度生成模型DynamicBind,可以有效地将蛋白质构象从最初的AlphaFold预测状态调整到类似全息(holo-like)状态,为后AlphaFold时代的药物研发提供了一种基于深度学习的、考虑蛋白动态变化的新研究范式。

面对蛋白质难题,这次有了空前强大的新工具——透视2024年诺贝尔...

由于在折叠过程中,多肽链中具有非常大量的自由度,这就使得生成的蛋白质具有天文数量的可能构象。在1969年的论文中,分子生物学家利文索尔提到,一个由100个氨基酸分子组成的肽链具有99个肽键,这些肽键在折叠形成蛋白质的过程中,会产生3的198次方,即3乘以10的94次方种可能的蛋白质构象。因此,如果蛋白质通过连续采样所...

蛋白质集合生成-VAE

分子动力学(MD)轨迹通过模拟蛋白质在原生结构周围的运动来生成蛋白质集合,并且经常在进行小分子对接计算之前生成集合,但通常无法识别未结合结构中不存在的隐蔽配体结合口袋,或者需要非常长的、因此计算密集的模拟(通常在亚到数微秒的水平上)。Rosetta碎片组装和最小化以及运动闭合方法已用于建模蛋白质和环构象多样性,但...

大模型落地应用:难点与破局

蛋白质是一切生命活动的物质基础,堪称分子生物学“皇冠上的明珠”。基于深势科技发布的Uni-Mol分子构象大模型,可实现分子生成、性质预测等多种通用能力。在药物发现领域,基于Uni-Mol开发的虚拟动力学分子生成方法VD-Gen,能直接在蛋白靶点空腔中生成具有高结合亲和力的分子。深势科技联合创始人、CEO孙伟杰介绍,近年来,...

科技自立自强之专家说|许锦波:望向生物产业下一站

AI颠覆蛋白质结构预测:这只是一个开始“现在通过使用AI技术,可以在很短的时间内精确算出蛋白质的三维构象。”许锦波说。在生物计算领域深耕20余年,许锦波一直致力于用计算机算法、尤其是人工智能算法及大数据技术解决蛋白质结构预测、优化、设计等问题,将AI蛋白质技术推向产业应用。

2024年淮阴师范学院硕士研究生招生大纲

三、考试基本题型和考试方式(一)基本题型与分值1.名词解释,5小题,共计30分;2.简答题,4小题,共计40分;3.论述题/案例分析,2小题,共计30分;4.教学设计,1小题,共计50分;总分值:150分(www.e993.com)2024年11月8日。分数占比:语文课程占40分,语文教材占30分,语文教学占60分,语文教师占20分。(二)考试方式1.闭卷,笔试;2.考试时间...

不同来源的开菲尔谷物, 在山羊奶中继代培养后多糖构象的差异

此外,从CN、DE和美国的开菲尔谷物中提取的蛋白质残留量(图1B)分别为3.04±0.09、1.68±0.19和10.55±0.59%(P<0.05)。美国开菲尔粒样品的总糖含量和蛋白质残留量显著低于CN和DE开菲尔粒样品,这可能与它们之间的构象差异有关。美国开菲尔粒中的多糖易与蛋白质结合,降低了乙醇中多糖的分离效率。

西湖大学冷冻电镜解析新冠病毒细胞受体结构:“开关”双构象

受体ACE2-B0AT1复合物：呈现开放和关闭两种构象尽管ACE2（宿主细胞受体血管紧张素转化酶2）因被冠状病毒“劫持”而为公众所知，但正如其名，ACE2的主要生理作用是促进血管紧张素的成熟，血管紧张素是一种控制血管收缩和血压的肽激素。ACE2是一种I型膜蛋白，主要位于肺、心脏、肾脏和肠中，其表达水平与心血管...

Molecular Cell | 一种高通量二硫键扫描方法,系统探究蛋白构型...

二硫键是蛋白序列中构象形成的关键因素之一,二硫键异构酶(disulfideisomerases)能够水解对蛋白构象不利的二硫键5。二硫键扫描突变是一种较为完善的研究二硫键结构模型的方法6,然而,双半胱氨酸变体(double-Cysvariant)的数量与多肽长度的平方成正比,这使得扫描整个蛋白质变得很难实现。

武汉纺织大学2024 年硕士研究生入学考试自命题大纲

三,题型比例名词解释20%,选择20%,简答20%,论述30%,综合实践10%.1,聚合物的多层次结构:高分子链的基本化学结构及构造,高分子构型,构象的概念及两者之间的差别,高分子链的链段和柔顺性的概念及主要影响因素,不同的链结构对高分子材料性能的影响,内聚能密度的概念,聚合物各种结晶形态和形成条件及结晶...