AI概念大热!诺贝尔化学奖授予蛋白质结构预测领域科学家
蛋白质,一直是诺贝尔化学奖青睐的研究方向。蛋白质是执行生命功能的最重要的生物大分子,是生命的重要组成部分,也是化学家研究的重要对象,例如消化食物所需要的酶就是一种蛋白质。但以往的化学研究主要靠猜测、尝试、纠错,再猜测、再尝试……这种研究范式下,科研人员必须在不断试错的过程中取得发现,研究效率低、...
他们破译了蛋白质复杂结构的密码!解读2024年诺贝尔化学奖
精准预测蛋白质结构在蛋白质的世界里,氨基酸以长链的形式相连,折叠成复杂的三维结构,这些结构对蛋白质的功能至关重要。自20世纪70年代以来,科学家一直致力于根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这是一项极其艰巨的任务。因为有些氨基酸和其他氨基酸相互吸引、相互作用;有些氨基酸则具有疏水性。而且氨基酸链形成了复杂的形...
唠科|人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码——2024年诺贝尔化学奖...
唠科|人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码——2024年诺贝尔化学奖成果解读记者:郭爽视觉:王涵宇(实习生)唠科工作室出品
...AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构...
他的研究重点是蛋白质结构的预测和设计、蛋白质折叠机制、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-核苷酸相互作用以及蛋白质-配体相互作用。他通过实验来理解这些问题背后的基本原理,并基于这些见解开发简单的计算模型,还通过结构预测和设计来测试模型。近年来,Baker团队开发了可用于蛋白质结构预测的RoseTTAFold,该算法已扩展到...
2024年诺贝尔化学奖揭晓,花落AI蛋白质设计/结构预测
Jumper,以表彰其在蛋白质结构预测方面的贡献。2024年的诺贝尔奖单项奖金为1100万瑞典克朗,与2023年持平,合人民币744.117万元。过去10年诺贝尔化学奖得主名单2023年——美国科学家MoungiG.Bawendi、LouisE.Brus和俄罗斯科学家AlexeiI.Ekimov获奖,获奖理由是“对量子点的发现和合成”。2022年——美国...
不懂AI、不会编码?如何轻松拿捏AlphaFold准确预测蛋白结构
ColabFold是一个集成的蛋白质预测解决方案,旨在简化用户的结构建模过程(www.e993.com)2024年11月8日。因此,它既提供了各种蛋白质预测模型的简单界面,也提供了预处理和后处理程序。ColabFold有两个界面:基于Web的界面(使用GoogleColaboratorynotebooks,以下简称Colab)和命令行工具。
为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字详解:AI重塑结构生物学
在这场友好的竞争中,一些人已经参与了近三十年,沉迷于探讨一个不变的问题——著名的“蛋白质结构预测问题”。它解释起来很简单:人们能否凭借最为简单的信息——一段蛋白质分子的一维序列,精准预测出它的三维结构?蛋白质维持着我们细胞与身体的活力和运转,由于它的行为取决于其形状与结构,因此成功解答这一问题将...
从计算机跨界生物学,坐了10年冷板凳后,他开创了蛋白质预测新范式
而在氨基酸序列折叠的过程中,遵循着物理学的“最小能量原理”,即在没有外部干扰的情况下,一个系统会自然趋向于能量最低的状态,这也是系统最稳定的状态。因此,找到氨基酸序列折叠后形成的能量最低的构象,就可以预测蛋白质结构。然而,许锦波曾向媒体解释,这种方法存在两个弊端:“第一,一个蛋白质是一个非常大的体系...
...颁给AI?万字专题详解:计算和人工智能颠覆我们对蛋白质的理解方式
在这场友好的竞争中,一些人已经参与了近三十年,沉迷于探讨一个不变的问题——著名的“蛋白质结构预测问题”。它解释起来很简单:人们能否凭借最为简单的信息——一段蛋白质分子的一维序列,精准预测出它的三维结构?蛋白质维持着我们细胞与身体的活力和运转,由于它的行为取决于其形状与结构,因此成功解答这一问题将...
单模型斩获“蛋白质突变预测”榜一,西湖大学提出基于结构词表方法
新智元导读Saprot在proteingym蛋白质突变预测任务公开基准榜(由牛津大学计算机与哈佛医学院设立)排名第一。相比,其他排名靠前的算法都是混合模型,专门针对突变任务设计,而Saprot不仅是单模型,而且是通用模型。蛋白质结构相比于序列往往被认为更加具有信息量,因为其直接决定了蛋白质的功能。