中国农业科学院谷物加工与品质调控创新团队从蛋白质相互作用角度...
团队通过系统梳理国内外相关研究数据报道,从蛋白质相互作用视角解析了大豆蛋白聚集和凝胶形态的变化机制。研究发现,蛋白质中的二硫键、疏水相互作用、静电相互作用和氢键等相互作用力的占比对大豆蛋白的聚集和凝胶形态影响各有不同。结果表明,pH诱导下的静电相互作用和氢键、NaCl协同诱导的静电相互作用、温度诱导下的疏水...
质谱解码蛋白质之间的密语:蛋白相互作用质谱技术深度解析
蛋白质相互作用是细胞内生物过程的基础,通过相互作用形成的复合物调控着细胞的功能和代谢。蛋白质相互作用对于细胞信号传导、基因调控、药物研发等领域都具有重要意义。解码蛋白质相互作用可以揭示细胞内的调控机制和疾病发生的分子基础。2.蛋白质相互作用质谱技术的基本原理:蛋白质相互作用质谱技术是基于质谱分析的方法,...
蛋白质与核酸相互作用的奥秘——欧倍尔虚拟仿真软件
蛋白质与核酸相互作用是生物体内许多重要生命过程的基础,如转录、翻译、DNA修复等。为了深入理解蛋白质与核酸相互作用的机制和功能,科学家们开发了一种虚拟仿真软件,可以帮助研究人员模拟和分析这些相互作用的过程。虚拟仿真软件通过模拟和重现蛋白质与核酸相互作用的过程,可以帮助研究人员更好地理解和揭示这些相互作用的...
仅根据蛋白质序列便可预测相互作用界面,一种基于Transformer的...
总的来说,通过将基于pLM的结合预测与用于蛋白质降解的uAb相结合,该工作激发了利用蛋白质相互作用来设计用于大规模蛋白质组编辑应用的可编程工具。论文链接:httpsnature/articles/s42003-023-05464-z
质谱分析蛋白相互作用:深入了解生物药物的分子机制与优化设计
质谱分析还可以帮助解析蛋白复合物的结构和功能。通过质谱分析蛋白复合物的组成、亚单位的相对丰度以及亚单位之间的相互作用,可以了解蛋白复合物的结构组成和功能调控机制。三、见解与研究进展:1.结合其他技术手段的应用:质谱分析通常与其他技术手段结合使用,如免疫沉淀、蛋白质结晶和核磁共振等。这些组合应用能够提供...
Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法
蛋白质-配体相互作用是许多重要细胞活动的分子基础,如信号转导、基因调控和细胞代谢等(www.e993.com)2024年7月25日。鉴定和预测蛋白质-配体相互作用对于理解生命活动机理和开发新药具有重要意义。尽管已经有多种实验技术可用于测量和分析蛋白质-配体相互作用,但基于计算的研究方法,特别是深度学习方法,凭借其成本低、速度快的优势,正逐渐成为蛋白质-配...
曾坚阳课题组提出蛋白质口袋结构表征新方法
蛋白质-配体相互作用是许多重要细胞活动的分子基础,如信号转导、基因调控和细胞代谢等。鉴定和预测蛋白质-配体相互作用对于理解生命活动机理和开发新药具有重要意义。尽管已经有多种实验技术可用于测量和分析蛋白质-配体相互作用,但基于计算的研究方法,特别是深度学习方法,凭借其成本低、速度快的优势,正逐渐成为蛋白质-配...
陕西师范大学杨鹏教授《自然·通讯》:新发现!超强蛋白质水下胶黏剂!
通常,蛋白质的生理结构是通过分子内的二硫键和一些非共价相互作用(包括静电键、疏水键和氢键相互作用)来稳定的。因此,为了获得未折叠蛋白,需要分解二硫键,然后使用比水更有利于包裹在蛋白链周围的稳定剂,如三氟乙醇(TFE)或尿素,来屏蔽蛋白链之间的非共价相互作用,从而稳定未折叠蛋白,防止其聚集。在这里,小蛋白...
PRC2和其他广泛报道的染色质蛋白在体内似乎不直接与RNA结合
CLAP能够显著减少非特异性信号,同时准确地绘制已知的RNA-蛋白质相互作用,以获得良好表征的RBPs。他们的研究结果主张重新评估RNA结合在各种染色质调节机制中的广泛作用,并为研究体内非经典RNA-蛋白相互作用提供了一个重要的新框架。原文链接:httpscell/molecular-cell/abstract/S1097-2765(24)00093-5#...
予路乾行|分子运动的共舞者,描绘分子动态世界
提升先导化合物的蛋白与细胞活性(Kd,IC50等)提高药物靶向选择性,降低脱靶效应针对别构位点结合的药物结构优化针对结合蛋白质多聚体的药物结构优化针对固有无序蛋白(IDP)的药物结构优化共价结合药物分子的靶向选择性优化及弹头优化药物代谢位点识别与药物相互作用机理探索PROTAC药物设计和结构优化泛素连接酶的选择...