Nature常客,保底1区,T2T基因组和群体GWAS分析为何备受青睐?
培训时间:8月12日-14日(3天);地点:南京。课程简介:从Linux基础到reads比对基因组、callSNP等重测序数据处理,再到群体遗传进化和GWAS关联分析,主流分析内容一课尽揽。课程价格:原价:4480元/人;限时优惠价4080元/人。团报优惠:2人及以上减200元/人。参加本次培训班可获得如下增值服务:1.赠送价值700元...
GWAS关联分析知识普及(样本收集、性状调查、基因分型、关联分析...
全基因组关联分析(Genomewideassociationstudy,GWAS)是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状/表型进行群体水平的统计学分析。根据统计量或显著性p值筛选出最有可能影响该性状/表型的遗传变异(标记),进而挖掘与性状相关的基因。GWAS分析方法介绍G...
用单细胞与空间转录组测序技术解析膝关节骨性关节炎软骨细胞异质
另外,研究人员对scRNA-seq数据与全基因组关联分析(GWAS)数据进行了整合分析,发现欧洲人群与亚洲人群的GWAS关联基因均主要富集于肥大软骨细胞群(HTC),提示遗传因素可能通过影响HTC的稳定性导致KOA的发生。总的来说,该研究通过scRNA-seq、Geo-seq、RNA-seq、GWAS等数据整合分析,绘制了KOA和正常对照软骨的细胞景观图谱,...
优秀!又一基因组+群体GWAS分析在Nature Genetics上发表!
课程简介:从Linux基础到reads比对基因组、callSNP等重测序数据处理,再到群体遗传进化和GWAS关联分析,主流分析内容一课尽揽。课程价格:原价:4480元/人;7月28日(含)前限时早鸟价3980元/人。团报优惠:2人及以上减200元/人。参加本次培训班可获得如下增值服务:1.赠送价值700元组学大讲堂云服务器3个月使用...
诺禾致源2023年年度董事会经营评述
③建库:将核酸进行打断、末端修复、扩增等处理,制作样本浓度、片段长度等符合不同技术原理、不同型号测序仪要求的文库,为测序仪识别样本做准备工作。公司已实现了标准文库构建的自动化,并积累了对非标建库流程差异化处理的丰富经验。④上机测序:准备完成后,由测序仪进行测序读取碱基信息。由于现有的主流测序仪通量较大...
精神分裂症30年研究徒劳无功?(下)
??图1GWAS识别的常见等位基因分布图源：ebi.ac.uk/GWAS的实现得益于对人类基因组的测序工作，揭示了30亿核苷酸基因组中的超过100万个单核苷酸多态性（SNP）(www.e993.com)2024年11月18日。SNP是DNA序列中的单个碱基对变异。要被认定为SNP，这种单个核苷酸的变异必须在超过1%的人群中出现，这使得它们相当普遍。研究者利用这些SNP作为生物标志...
NAR | 华大和上海师范大学合作开发的全基因组选择平台CropGS-Hub
GS的原理是基于连锁不平衡(LD),SNP数量和有效性对GS影响较大。研究虽然用到了很多方法,如估计标记有效数量、LD过滤、SNP注释分类、GWAS因果位点筛选、以及根据交叉验证预测准确性来筛选特定SNP,但究竟最后如何确定基因型密度,以及如何综合选择出最有代表性位点似乎没有明确说明。此外,从WGS中提取靶点来做GS,是不是...
Cell | 综述:解密复杂性状的遗传与分子基础
全基因组关联研究(GWAS)已成为揭示遗传变异与复杂性状之间关系的重要手段。通过分析成千上万个样本的遗传数据,GWAS能够发现那些与人类的身高、体重、疾病易感性等性状相关的遗传标记。近年来,随着测序技术的发展和数据处理能力的提高,GWAS已成功鉴定出数千个与复杂性状相关的遗传位点。然而,这一进展也伴随着诸多挑战,例...
学术大爆发!中国/华人学者一天发表35篇Nature Communications|...
31耶鲁大学HongyuZhao团队在NatureCommunications在线发表题为“TuningparametersforpolygenicriskscoremethodsusingGWASsummarystatisticsfromtrainingdata”的研究论文,该研究通过广泛的模拟和实际数据应用证明了PRStuning在PRS方法和参数方面的准确性。
性状定位之--重测序GWAS
GWAS研究方法包括基因芯片、简化基因组测序、基因组重测序。基因芯片是根据已有的SNP信息定制芯片,不能发现新的SNP位点。简化基因组测序覆盖度只占基因组5%左右,会遗漏很多SNP位点。基因组重测序可以在全基因组范围内发现SNP位点且不会导致SNP位点的遗漏。相比于芯片GWAS和简化GWAS,重测序GWAS具有以下显著的优势:...