真迈生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

全基因组甲基化测序文库(WGBS)的碱基比例严重失衡(GC%～20%),这给高质量的测序数据交付带来了极大的挑战。通常,我们采用掺入高比例的专用平衡文库(例如PhiX文库、E.coli文库)或与GC含量40%～50%的其他应用样本Pooling测序的方法来缓解失衡,提高测序质量。然而,这种方法不仅降低了生产效率,还增加了测序的成本和操作...

【Nature子刊】中国医学科学院刘芝华教授等合作揭示食管鳞状细胞...

首先,遗传变异的内在价值(例如,拷贝数变异;CNV)和嵌入在全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)数据中的片段特征(例如片段大小)被低估了。需要同时分析单个WGBS数据集中的cfDNA甲基化标记、遗传变异和片段化特征。其次,鉴于遗传和表观遗传畸变在从癌前病变到胚胎离瘤的转变中的关键作用,这些多组学特征的相互互补性和综合...

cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量

WGBS(全基因组重亚硫酸盐测序)提供了全面和高分辨率的全基因组甲基化信息,是甲基化检测的“金标准”,但它面临着复杂的数据处理和高测序要求等挑战。另一方面,MCTA-seq(甲基化CpG串联扩增和测序)是一种灵敏的方法,能够分析微小的基因组DNA量(低至7.5pg),有望用于非侵袭性癌症筛查。然而,与全基因组方法相比,它...

ctDNA甲基化测序分析(ctDNA-WGBS)用于

DNA重亚硫酸盐处理将DNA中未修饰的胞嘧啶转化为尿嘧啶,同时保持5-甲基胞嘧啶(5mC),PCR扩增后测序,可以达到单碱基分辨率,将亚硫酸盐处理与下一代测序(NGS)结合,产生5mC的WGBS数据,基因组覆盖率超过70%。此外,血浆中的ctDNA浓度极低,制备WGBS文库需要约2000ng基因组DNA,显著超过临床可用血浆样品中的ctDNA水平。

【陈巍学基因】视频:对全基因组甲基化和全基因组序列进行同步测序

1、5字母测序的原理2、实测准确性3、用于微量DNA甲基化测序4、拓展到6字母测序我们先讲第一部分,5字母测序的原理。作者把这种既可以测到DNA链上的甲基化信息,又可以测到DNA链原来碱基序列的建库测序方法,称为“5字母测序”,five-letterseq。

新纪录!一年可测5万人全基因组,华大智造发布全球通量最高测序仪

基于华大智造独有的DNBSEQ原理，DNBSEQ-T20×2采用了创新的浸没式生化反应技术，即直接将载片浸没在试剂槽中进行生化反应，反应均匀且稳定；同时试剂槽中的测序试剂可以支持载片的多次浸泡，从而实现了将耗材成本降到极致的目标(www.e993.com)2024年11月18日。在完成5万例人全基因组测序基础上，将单个人全基因测序成本降低至100美元以内。延续DNBSEQ...

刷新通量和单例成本纪录!华大智造发布超高通量测序仪DNBSEQ-T20×2

基于华大智造独有的DNBSEQ原理,DNBSEQ-T20×2采用了创新的浸没式生化反应技术,即直接将载片浸没在试剂槽中进行生化反应,反应均匀且稳定;同时试剂槽中的测序试剂可以支持载片的多次浸泡,从而实现了将耗材成本降到极致的目标。在完成5万例人全基因组测序基础上,将单个人全基因测序成本降低至100美元以内。

【陈巍学基因】视频:全基因组甲基化测序分析报告解读

全基因组甲基化测序(WGBS)分析报告包含大量的内容、图表、数据,不熟悉高通量测序的用户拿到这样一份报告后,读起来会很吃力。为此,把这个报告做了一个全面的解读,以帮助用户能够快速地掌握报告中的要点,读懂报告中的各种图表,并找到自己感兴趣的信息点。字幕内容大家好,今天我为以逆耳生物公司的《全基因组甲基化...

干货:cfDNA甲基化测序实验怎么做,看完你就知道了

cfDNA-RBS测序原理示意图如下:二、cfDNA重亚硫酸盐测序(cfDNA-RBS)建库测序(一)DNA提取与检测从组织或细胞中提取DNA,随后对DNA样品进??严格质控,质控标准主要包括以下??个????:琼脂糖凝胶电泳:分析样品DNA完整性及是否存在降解;Qubitfluorometer(Quant-iTdsDNAHSAssayKit):检测DNA总量。

关于甲基化和羟甲基化测序的技术介绍

该技术原理示意图如下(图3):图3.ACE-seq5hmC单碱基分辨率测序(Schutsky,E.K.etal.2018,Nat.Biotechnol)四、酶法甲基化测序(EM-seq)全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)长期以来一直是甲基化图谱分析的金标准,但重亚硫酸盐的化学反应会破坏和降解DNA,导致DNA断裂和丢失。基于酶法的甲基化测序就克服...