基因测序:比肩移动的下一个“平台技术”(三)
除了这项强大的功能之外,这种仪器还可以同时对病毒进行测试和测序:在测序仪上进行的分析可以告知患者是否患有该病毒,而阳性样本匿名化的测序数据可以为公共卫生机构提供大量的流行病学数据,用来跟踪病毒变异。布罗德研究所负责病原体基因组监测的BronwynMacInnis告诉我说:“我可以想象一个测序与诊断等同的世界。我们...
测序仪笔记分享(万字长文,建议收藏)
·DNA测序:基于Sanger法的原理,利用DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记和终止子的双脱氧核苷酸(ddNTPs),从而得到不同长度的DNA片段。这些片段经过电泳分离后,通过激光激发和CCD检测,得到每个碱基发出的荧光信号,从而确定DNA的碱基序列。·片段分析:基于荧光检测的原理,利用不同颜色的荧光染料标记不同...
...| 第50期·普译生物黄亿华:自主创新研发,领跑轻量化基因测序
第四代基因测序技术,即纳米孔基因测序,和其他三代在测序原理上有着本质的不同,独特优势主要体现在:一是具有超长的测序读长。理论上来讲,不管DNA有多长,都可以从头测到尾,但第二代最长只能测300-500个碱基,第三代可以测10000个碱基左右,而纳米孔测序则可以测几百万个连续碱基;二是纳米孔测序仪可以做得非常便携...
...本文系统总结常见测序仪的原理和主机结构,并介绍相关测序原理...
·DNA测序:基于Sanger法的原理,利用DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记和终止子的双脱氧核苷酸(ddNTPs),从而得到不同长度的DNA片段。这些片段经过电泳分离后,通过激光激发和CCD检测,得到每个碱基发出的荧光信号,从而确定DNA的碱基序列。·片段分析:基于荧光检测的原理,利用不同颜色的荧光染料标记不同...
【陈巍学基因】视频:对全基因组甲基化和全基因组序列进行同步测序
1、5字母测序的原理2、实测准确性3、用于微量DNA甲基化测序4、拓展到6字母测序我们先讲第一部分,5字母测序的原理。作者把这种既可以测到DNA链上的甲基化信息,又可以测到DNA链原来碱基序列的建库测序方法,称为“5字母测序”,five-letterseq。
scNanoCOOL-seq: 单细胞多组学测序技术的新里程
??可以同时检测基因组、转录组、染色质可及性和DNA甲基化(www.e993.com)2024年7月28日。??可以检测全长CpG岛(CGIs)和基因启动子的表观遗传特征。??可以检测具有结构变异(SVs)的基因组区域。??可以提供在单个细胞内分析等位基因特异性表观遗传状态的机会。scNanoCOOL-seq技术整合了三代测序平台的优势和scCOOL-seq原理,为科研人员提供...
专精特新“科代表”丨自主可控 基因测序服务人人可及
自主可控基因测序服务人人可及无创DNA产前检查,只需采集孕妇静脉血,就可通过对孕妇外周血中的游离DNA片段测序,来判断胎儿的健康状况,这是当下基因测序较为成熟的应用场景之一。人类对生命奥秘的探索,已经从纵深走向微观、从人体到器官、从组织到细胞,每一次拓展都在更准确地理解自己和世界,这其中基因测序发挥着...
锁定病原体感染来源的利器——高通量测序
第二代测序(NGS)又称为高通量测序,是基于聚合酶链反应(PCR)和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们通过物理或是化学的方式将DNA随机打断成无数的小片段,之后通过建库富集了这些DNA片段。接下来将建完的库放入二代测序仪中测序,测序仪中有着可以让DNA片段附着的区域,每一个片段都有独立的附着区域,这样测序仪可以...
《iMeta》综述 | 多组学在肿瘤微生物研究中的应用
ChIP-seq的原理为:DNA片段纯化与目标蛋白质结合并通过ChIP纯化富集和免疫共沉淀,然后纯化并构建文库,富集的DNA片段通过高通量技术进行测序;借助该技术,研究人员已经精确定位了基因组中与特定组蛋白相互作用的序列和转录因子。对于肿瘤微生物组研究而言,ChIP-seq技术适用于宿主和微生物细胞的基因组或表观遗传学研究。
再创新高!生命科学领域最新赛道,必将突破历史科研难题!
卷积神经网络CNN在基因调控预测中的应用1.Chip-Seq中识别基序特征G4,如DeepG42.Chip-Seq中预测DNA甲基化,DeepSEA3.Chip-Seq中预测转录调控因子结合,DeepSEA4.DNase-seq中预测染色体亲和性,Basset5.DNase-seq中预测基因表达eQTL,Enformer实操内容...