AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评
预测对了结构,但不等于明白了蛋白质折叠过程和原理。生物实验科学家也有不少看法:算出结构只是生物学规律发现的第一步;计算的多个models中,有时打分排序不准;开放AlphaFold2的server之后,使用效果不一定那么好;只是在已有蛋白质结构数据集上训练得到的模型,尚不能计算其它构象或其它类别的分子结构。还有关心这...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
物质运输(血红蛋白)、机械收缩(肌动蛋白)、机体免疫(抗体)等,进而参与几乎所有生命过程,如分子水平的DNA复制和转录、蛋白质翻译、物质与能量代谢等,以及细胞层面的精卵融合、细胞增殖和分化、细胞凋亡和坏死、细胞衰老和细胞通信等,其重要性不言而喻。
中国科大在精准合成高分子单链选键化学和质谱测序方面取得进展
当前,该课题组正在基于这一进展开展三方面的深入研究:1)基于数码胶束无标记定量技术的蛋白质组学与蛋白冠主动精准调控;2)基于数码油墨的无法反向破解的加密打印和信息安全存储;3)基于该类单链选键化学和精准高分子材料化学创制单一组分极紫外光刻胶,这一设想已在中国科大微纳研究与制造中心的全力配合下获原理性验...
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
提纯蛋白质,确定浓度、pH值、缓冲液等条件,控制蛋白质稳定性等。1、目的蛋白质信息检索与调查-利用生物信息学工具搜集目标蛋白质的基因序列、结构域、同源蛋白质的信息-分析目标蛋白质的理化性质,如分子量、等电点、聚合程度、稳定性等2、质粒制备-设计引物,克隆目标基因到表达载体-转化表达宿主,提取...
2024诺贝尔化学奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
首先是建模系统,利用神经网络和强大运算能力基于能量最低原理预测蛋白质内各氨基酸残基之间的空间距离,产生一系列结构片段(类似二级结构),初步组装出三维结构;其次是优化系统,对建模结构进行再计算的重复操作以提升精确度;最后是输出系统,产生最终三维结构。
一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识
MALDI-TOFMS鉴定前处理的主要目的是灭活病原微生物、破坏其细胞壁及提取胞内蛋白质(www.e993.com)2024年10月16日。不同类型微生物细胞壁的结构和成分不同,破壁难易程度有别,从而直接影响蛋白质释放。因此需要选择适当的前处理流程,主要包括:直接涂抹法、原位甲酸提取法、甲酸乙腈提取法、双甲酸法等多种方法??[??6??]??,??图1??中...
串联质谱蛋白质测序方法综述:技术、应用与挑战
1.串联质谱蛋白质测序的原理串联质谱蛋白质测序是一种基于质谱仪的技术,通过将蛋白质分解成肽段,并对这些肽段进行质谱分析,从而推导出蛋白质的氨基酸序列。主要的原理包括肽段裂解、质谱分析和数据解析。2.串联质谱蛋白质测序的技术方法2.1液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)...
动态追踪蛋白质结构:深入了解氢氘交换质谱的原理与应用
一、氢氘交换质谱的基本原理氢氘交换质谱是一种测量蛋白质中氢和氘交换的技术。当蛋白质暴露在含有氘化物的缓冲液中时,氢原子会被氘原子取代。交换速率取决于蛋白质的结构和溶液条件。通过质谱仪测量交换后的蛋白质样品,可以得到关于蛋白质结构的信息。交换速率较快的区域通常对应于蛋白质表面暴露的区域,而交换...
...methods》期刊封面 解码“生命天书” 成功破译蛋白质测序难题
withfunctionalizednanopore”的研究论文,阐明纳米孔单分子检测新策略,实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分,提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序方法(简称NEPS),为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,展示出生物传感器技术与人工智能算法结合的优异潜力,代表我国生物传感技术与蛋白组学工具的原始创新能力进入全球前沿...
蛋白质“扩增测序”新方法 | NSR论文
蛋白质是生命功能的基石,单分子、单细胞水平的蛋白质测序技术能够为科学研究带来突破性的进展,并推动人类疾病诊断和治疗的进步。尽管基于质谱的蛋白质组学技术已经能够快速、高通量地鉴定生物样品中的蛋白质,但是与更为成熟的核酸测序技术相比,尚不能借助类似聚合酶链式