透视生命的单细胞世界:理解单细胞蛋白质组学对生物药物的影响
单细胞蛋白组学的第一步是将细胞从组织或样本中分离出来。传统的方法如流式细胞术和细胞排序等对于单细胞分离起到了重要作用。近年来,新兴的微流控技术和单细胞捕获技术的发展,使得我们能够更加高效、精确地分离单个细胞,为后续的蛋白质组学分析奠定了基础。1.2单细胞蛋白质组学分析技术单细胞蛋白质组学的关键是...
蛋白组学测序技术路线指南:IP质谱数据库的探讨
蛋白组学测序技术是通过对生物样本中的蛋白质进行定性和定量分析,以揭示蛋白质组的组成和功能。常用的蛋白组学测序技术包括质谱法、免疫沉淀法等。其中,质谱法是最常用的技术之一,而IP质谱数据库则是质谱法中的重要组成部分。2.IP质谱数据库的原理和应用IP质谱数据库是基于免疫沉淀(Immunoprecipitation,简称IP)和质...
...腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学?
论文一中建立的SPDB数据库,通过标准化处理不同来源的单细胞蛋白质组学数据,使得数据易于比较和分析,是目前全球数据量最大、覆盖技术和数据集最为广泛的单细胞蛋白质数据库。论文二中的scPROTEIN框架,针对单细胞蛋白组数据的特殊性提出了解决方案,能够处理数据中的不确定性、缺失值、批次效应和噪声问题。为基...
Seer 公司 Max Mahoney:高深度无偏蛋白质组学新技术,开启肿瘤早筛...
接下来,蛋白质组学的研究跟基因组学类似,我们已经能够利用海量数据充分理解血清或血浆的蛋白质组,理解器官的蛋白质组。未来,这项技术会从根本上改变我们看待以及管理人类健康的方式。但蛋白质组却会根据身体状况而改变,所以它提供的是一个动态的指标,动态缩影。让大家能实时掌握自己的健康状况。直到5年前,蛋白质组...
蕴卓生物浅谈OLINK蛋白质组学小知识
原理OlinkProteomics致力于发现人类蛋白质生物标志物。Olink新一代蛋白组学平台可实现高通量、高特异性、高灵敏度、高动态范围的靶向蛋白质组定量检测。基于专利临位延伸分析(ProximityExtensionAssay,PEA)技术,赋予Olink蛋白组学解决方案结合了抗体免疫分析的高特异性和基因组学的高灵敏度/高通量,通过在1-6??...
复旦大学开发用于无标记蛋白质组学的多平台评估标准
与其他组学技术(如基因组学和转录组学)类似,蛋白质组学在大规模实验中的低可重复性仍然是最关键的挑战之一(www.e993.com)2024年7月24日。这种低可重复性主要归因于实验设计、样品处理方法、环境和操作条件、质谱仪器、数据搜索算法、统计分析方法以及其他条件在研究和实验室之间引入的大量变异。
定量蛋白质组:揭示蛋白质组的量级与动态变化
一、定量蛋白质组学的原理定量蛋白质组学旨在测量不同样本中蛋白质的数量,并比较它们之间的表达差异。为了实现准确的定量,我们需要选择适当的定量方法和技术。常用的定量方法包括质谱定量、免疫检测和基因表达分析等。其中,质谱定量是最常用和广泛应用的技术之一,通过质谱仪器测量蛋白质片段的信号强度,来推断蛋白质...
西湖欧米丨蛋白质谱学堂征集令
2023即将落下帷幕,但蛋白组学研究的大幕才徐徐拉开。在2023年的最后一个月,欧米蛋白质谱学堂第三期培训即将开课。此次蛋白质谱学堂的课程内容,基于前两期学员提出的建议和此次部分已报名学员的“课程定制”,除了涵盖蛋白组学基础、质谱数据采集原理、蛋白组学数据分析基础等入门课程,还将涉及单细胞组学、修饰蛋白质组...
FSAP|哈尔滨工业大学马莺教授:乳清蛋白的酸凝和酶凝工艺对蛋白质...
E300HS和TP800之间的肽组学特征差异乳清蛋白中的活性肽在多种生理活动中发挥重要作用,如抗氧化、免疫刺激和抗炎。采用LC-ESI-MS/MS分析酸凝乳和酶凝乳工艺所得乳清蛋白肽的差异。结果显示,在E300HS中相比于TP800,产生一些上调的肽(表4)。其中,乳铁蛋白(No.1)和乳凝集素(No.4~6)的肽在E300HS中丰度较高...
追问|通过监测血液中这三种蛋白质,能提前15年预测痴呆?
UKBiobank在近期释放了对54306名参与者的血浆蛋白质组学分析的数据。采用Olink邻位延伸分析技术(ProximityExtensionAssay,PEA)对血浆蛋白浓度进行统一量化,该方法针对每个待检蛋白设计一对抗体,抗体上偶联有特定的DNA单链标记,抗体对结合目标蛋白后,处于邻位的两条DNA单链可互补结合并延伸形成双链DNA模板,通过qPCR/...