Cell | 绘制人体病原体与人体外蛋白间的互作图谱
其原理是利用生物素化的单个菌株与表达人类外蛋白的酵母文库进行共培养,分离细菌和酵母复合物后通过测序鉴定与特定菌株互作的蛋白。根据BASEHIT得到的数据进行评分,可以评估单个微生物与每个宿主外蛋白之间的相互作用程度。此前,NoahW.Palm和AaronM.Ring团队利用该技术系统性地揭示了数百种人体共生微生物与人体外...
FIDA分子互作仪:带你复现Nature青睐蛋白质与核酸互作50分顶级发文...
通过蛋白间相互作用,2个CbCas9蛋白和2个PcrIIC1蛋白能够形成异源四聚体复合物。图2.冷冻电镜分析CbCas9和PcrIIC1结合的三个阶段蛋白质与核酸的分子互作实验表明,与单独的CbCas9相比,CbCas9-PcrIC1复合物表现出增强的DNA结合进而体现出切割活性,对原间隔区相邻基序序列的兼容性更广,对错配的耐受性更强,抗噬...
武汉病毒所建立研究活细胞内蛋白质互作的新方法
蛋白质之间的相互作用对生命活动至关重要。尽管已有不少体内研究蛋白互作的方法,但由于许多蛋白互作是高度动态的,因此用传统的方法难以捕获。该研究基于“招募”和“聚集”的原理,即将“诱饵”蛋白A锚定在线粒体的外膜上......点击评论分享到:请扫描下面的二维码进行分享新闻标题...
...性读书会:从微观到宏观,多尺度视角探索生命复杂系统的构成原理
导语在生物学中心法则的起点,基因作为生命复杂系统的遗传信息载体,在生命周期内稳定存在;而位于中心法则末端的蛋白质,其组织构成和时空变化的复杂性呈指数式增长。随着分子生物学数十年来的突飞猛进,尤其是生命组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等的集合
三π连发!“人体蛋白质组导航”国际大科学计划又有新进展
未来在π-HuB计划的支持下,将持续提升软件各方面的性能,并不断融合团队之前研发的系列知识库,包括自免疫抗原知识库、药物-靶蛋白互作数据库、癌症用药响应基因特征数据库以及癌症治疗基因扰动信号数据库等,以解析人体的构造原理与演变规律为目标,建设一条智能引领的自动化、工业化的蛋白质组知识挖掘高速公路。国际大...
...广州实验室徐涛院士团队提出研究细胞器互作位点蛋白质组的新方法
其原理在于:绿色荧光蛋白GFP被分为两个互补片段,分别定位到不同的细胞器膜上,在二者的接触位点,两个片段即可靠近并形成完整的GFP蛋白,指示互作位点(www.e993.com)2024年7月24日。随后,利用GFP纳米抗体(nanobody)和完整GFP蛋白之间的结合将APEX2蛋白招募到互作位点,标记相邻的蛋白质。BiFCPL技术既能发挥双分子荧光互补技术灵敏、简便和可视化的优势...
广州实验室徐涛院士团队iScience:研究细胞器互作位点蛋白质组的新...
其原理在于:绿色荧光蛋白GFP被分为两个互补片段,分别定位到不同的细胞器膜上,在二者的接触位点,两个片段即可靠近并形成完整的GFP蛋白,指示互作位点。随后,利用GFP纳米抗体(nanobody)和完整GFP蛋白之间的结合将APEX2蛋白招募到互作位点,标记相邻的蛋白质。BiFCPL技术既能发挥双分子荧光互补技术灵敏、简便和可视化的优势...
DMFold:精确到氨基酸的互作蛋白结合位点预测分析工具
2.以FASTA格式输入2个互作蛋白质或者多个蛋白质复合物的对应蛋白质氨基酸序列;输入自己的邮箱(一个邮箱,或者一个IP地址,一次只能提交一个任务,前一个任务完成后才可以提交第二个任务);点击RUNDMFold,如下:3.提交后马上收到分析任务已完成提交的邮件,给了分析任务的网页链接和编号,一般在2-5天后收到分析任务完...
...团队研究成果:利用深度学习方法揭秘疾病突变对蛋白质互作影响...
前期研究表明遗传因素在其中起重要作用,但从患者的全基因组检测数据里识别可能的致病性基因突变以及所影响的蛋白质复合物(例如PPI)仍是个极具挑战的工作。因此,研究团队通过MIPPI对来自于发育迟缓障碍患者的612个罕见错义变异,进行蛋白互做的致病性解析。研究团队通过MIPPI,比较具有相同突变蛋白的不同成对蛋白互作...
Nature | RNA与蛋白质互作调控新范式——蛋白RNAylation:噬菌体...
这表明ModB通过RNAylation改变了宿主细胞的蛋白质合成能力或选择性,导致细菌的mRNA翻译关闭,从而促进了噬菌体基因组的复制和表达。总之,这项研究揭示了噬菌体病毒通过RNAylation对宿主细菌基因表达进行操控的机制,并挑战了RNA和蛋白质相互作用的传统观念,这对于我们理解这些生物过程进而开发出新的疗法具有重大意义。