统计物理视角下的 AlphaFold 与蛋白质组研究|周二直播·生命复杂...

通过各种物理分析方法,我们揭示了蛋白质结构特征、动态行为和功能特化如何随着生物体复杂性的增加而演化。通过对AlphaFold数据库中的蛋白质进行统计分析,我们发现蛋白质结构复杂性与生物体复杂性呈现显著的正相关性,其功能多样性也随进化复杂度增加而提升。这就像是发现了蛋白质进化的“普适定律”——类似于物理学中...

WB进阶Webinar:质控专家带您打破“实验玄学”,做好磷酸化蛋白检测

蛋白翻译后修饰(PTM)通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,改变蛋白质的理化性质,影响蛋白质的空间构象、活性状态、亚细胞定位、蛋白互作等。PTM让单个蛋白质实现功能多样性,适应不同生理需求。PTM是细胞信号传递必不可少的元素,被称为细胞的“自然语言”。蛋白质磷酸化是广泛存在的PTM之一,细胞内超过30%的蛋白...

上海应用技术大学2025考研招生入学考试大纲:846食品化学

蛋白质的组成、结构与分类,蛋白质在食品中的化学变化及对食品质量的影响,蛋白质在食品中的功能性质及对食品品质的影响。本章要求:1.了解氨基酸、多肽和蛋白质的结构和性质2.理解天然蛋白质的晶体结构及维持其结构的作用力3.掌握蛋白质的变性机理、影响因素及其对食品品质的影响,控制蛋白质变性的措施4.掌握...

...实验室青年研究员谈攀发布关于FSFP:基于语言模型的蛋白质功能...

我们的测试结果表明,即便是在原始的蛋白质预训练模型对突变-性质预测的spearman相关性低于0.1的情况下,FSFP方法只利用任意20个湿实验数据训练模型,也能将上述的预测相关性大幅提高到0.5以上。同时,为了研究FSFP的有效性。我们在一个具体的蛋白质Phi29改造案例中进行了湿实验验证,FSFP在只使用20个湿实验数据训练模...

【学术进展】基因组学再创新高,生命科学迎来颠覆性进展,解决历史...

4.蛋白质组5.功能基因组实操内容基因组常用深度学习框架1.安装并介绍深度学习工具包tensorflow,keras,pytorch2.在工具包中识别深度学习模型要素2.1.数据表示2.2.张量运算2.3.神经网络中的“层”2.4.由层构成的模型2.5.损失函数与优化器

Food Chemistry|热杀菌对烧鸡蛋白质理化性质及体外模拟消化后代谢...

南京农业大学曹雅琦博士、黄明教授等人研究了低温杀菌(80°C,30min)、中温杀菌(100°C,30min)及高温杀菌(120°C,30min)等三种杀菌温度对烧鸡蛋白理化性质的影响,并利用体外模拟消化技术研究热杀菌温度对烧鸡蛋白消化率的影响,同时结合UPLC-QTOF-MS/MS代谢组学分析,阐明了热杀菌温度对烧鸡代谢产物释放的影响,...

考研生物物理学专业简介

生物物理学的研究对象主要包括生物体的组织、细胞、分子等不同层次的结构,以及这些结构所涉及的生物化学反应、生物电活动、生物光学等物理现象。通过运用物理学的原理和技术手段,生物物理学研究人员可以揭示生物体内各种生物过程的物理机制,如蛋白质的折叠和功能、细胞的运动和分裂、神经信号的传递等。

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

“了解事物的外观非常重要,因为这样你可以理解它们的功能,”格拉斯哥大学结构生物学家HelenWalden说道。有些人研究问题的化学性质,有些人则研究了物理性质。实验学家通过艰苦的实验室工作重建了蛋白质形状。计算生物学家通过模型和模拟寻找线索,并用不同的算法规则组合进行编程和重新编程。

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生_腾讯新闻

“了解事物的外观非常重要,因为这样你可以理解它们的功能,”格拉斯哥大学结构生物学家HelenWalden说道。有些人研究问题的化学性质,有些人则研究了物理性质。实验学家通过艰苦的实验室工作重建了蛋白质形状。计算生物学家通过模型和模拟寻找线索,并用不同的算法规则组合进行编程和重新编程。

【寻新】AI for Engineering:大模型实现多款高难度蛋白质产品产业...

其次,利用9800万条标注了蛋白质各种性能参数的标签信息,进行监督学习,让模型学习不同蛋白质性能的特征;03最后,对模型的打分结果进行少量实验验证,并将实验数据反馈给模型,通过自研小样本学习方法,用实验数据微调大模型使得它能精准预测蛋白质特定功能性质,最终定向进化出理想功能的蛋白质产品。