中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生

以下是大多数已发明的16SrRNA基因扩增子测序方法的标准流程：通过一对靶向16SrRNA基因保守区域的通用引物扩增菌群中细菌的16SrRNA基因，并利用高通量测序平台测序获得所有扩增的16SrRNA基因的序列。高通量的16SrRNA基因扩增子测序方法有以下优点：该方法基于16SrRNA基因的扩增，因此可以适用于未培养的细菌或低生物...

全读长时代到来!华大成全球唯一拥有三种不同技术路径测序仪的机构

测序设备新增装机市场份额连续两年位居国内第一,中国国产测序仪在生育健康、肿瘤和传感染疾病防控、慢性病管理等场景,在大人群基因组学、疾控、海关、司法、教育、文物、生态环境、生物多样性等领域得到越来越广泛的应用。

北京大学汤富酬团队再发文:新的单细胞全基因组测序方法

研究人员首次将限制性内切酶切割和连接策略与TGS平台相结合进行单细胞基因组测序,并开发了一种单细胞长读取基因组测序技术Refresh-seq。与SMOOTH-seq相比,Refresh-seq提高了基因组覆盖率和一致性。它提高了二倍体细胞两个等位基因的恢复率,即使在很浅的测序深度下,对植入前遗传诊断等医学应用具有巨大的潜力。该方法易于...

生命解码:基因测序的群雄逐鹿

与454及SoLiD技术采用的乳液PCR(EmusionPCR)技术不同,illumina/Solexa的测序技术在DNA扩增环节采用了桥式PCR扩增技术(如下图),直接将DNA片段附着在处理过的介质表面,这种技术天生适合做高通量测序仪。测序芯片上能容纳的DNA簇密度伴随加工技术进步在不断增加,这使得illumina测序通量提升的天花板至今仍在持续抬升。图...

Nature Biotechnology:m6A定量测序新方法 | 何川、陈建军、陈梦洁...

目前RNAm6A主流的测序方法依然是基于抗体的MeRIP,但该测序方法存在明显的缺点,包括分辨率低,无法定量,比较不同条件下m6A差异有局限性,以及建库需要大量的RNA,不能应用于单细胞水平的研究等。近年来陆续开发的m6A测序方法(如Mazter-seq,m6A-REF-seq,DART-seq,m6A-SEAL,m6A-label-seq等)也只是部分解决了上述...

Nature | 一种检测单链DNA突变的新方法:单分子测序

(HairpinDuplexEnhancedFidelitysequencing),在这种方法应用中:1),增加了每条链的测序通过次数(DNA的中位大小为1.7kb,测序中位数是32);2)在文库准备过程中,通过ssDNA断口链接或者使用NanoSeqA-tailing方法进行末端加尾,或者使用无需加尾的方法,以去除实验过程中的非特异性信号;3)改进了计算机分析算法,以...

第四代基因测序技术——纳米孔测序

纳米孔测序的原理纳米孔单分子测序技术是基于电信号测序的技术,相对于其他测序技术,纳米孔测序技术的样本处理极其简单,无需DNA聚合酶或者连接酶,也无需dNTPs(脱氧核苷三磷酸),其测序过程中包含了以下4种关键物质。纳米孔蛋白:可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白,具有天然的蛋白纳米孔。

整合生命组学数据,揭示生命复杂系统构成原理

二、转录组学的研究方法微阵列技术(Microarray):微阵列技术利用已知序列的探针检测样本中对应的mRNA或cDNA,通过荧光信号的强弱反映基因表达水平。优点:成本低,数据处理相对简单。缺点:只能检测已知序列,灵敏度和动态范围有限。RNA测序(RNA-Seq):RNA-Seq是基于高通量测序技术,通过对cDNA文库进行深度测序,获取样本中...

12月1日正式实施!高通量测序基因分型系统规范全文及解读

本文件规定了高通量测序基因分型系统的组成、功能要求、性能要求、信息安全要求及测试方法。本文件适用于基于高通量测序的基因分型系统的设计、研发、测试与评估。高通量测序基因分型系统是通过对遗传标记STR、SNP的自动分型实现对生物特征的识别。其流程是将高通量测试设备下机数据经过预处理、序列比对、位点覆盖深度及...

基因检测在疾病确诊、家系遗传模式分析与再生育计划中的重要作用

1、桑格测序这种方法最早由英国科学家FredSanger于1977年开发，使用链终止技术对DNA进行测序。桑格测序的原理可以概括如下：DNA分解成单链以引物为模板，通过DNA聚合酶合成新的互补核苷酸，形成互补链该链继续延伸，直到双脱氧核苷酸（链终止核苷酸）添加到链上，形成片段双脱氧核苷酸根据其携带的核苷酸（腺嘌呤、鸟...