AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评
预测对了结构,但不等于明白了蛋白质折叠过程和原理。生物实验科学家也有不少看法:算出结构只是生物学规律发现的第一步;计算的多个models中,有时打分排序不准;开放AlphaFold2的server之后,使用效果不一定那么好;只是在已有蛋白质结构数据集上训练得到的模型,尚不能计算其它构象或其它类别的分子结构。还有关心这...
MALDI-TOF MS鉴定病原微生物临床应用专家共识
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorptionionizationtime-of-flightmassspectrometry,MALDI-TOFMS)是一种新型软电离有机质谱技术,用于分析生物分子(如DNA、蛋白质、多肽、糖类等)和大分子量的有机分子[1],使得微生物蛋白质指纹图谱进行菌种鉴定成为可能。随着MALDI-TOFMS仪器临床...
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
提纯蛋白质,确定浓度、pH值、缓冲液等条件,控制蛋白质稳定性等。1、目的蛋白质信息检索与调查-利用生物信息学工具搜集目标蛋白质的基因序列、结构域、同源蛋白质的信息-分析目标蛋白质的理化性质,如分子量、等电点、聚合程度、稳定性等2、质粒制备-设计引物,克隆目标基因到表达载体-转化表达宿主,提取...
coip-质谱
其基本原理是在非变性条件下,将细胞裂解,在细胞裂解液中加入相应的抗体,加入的抗体可以和已知的抗原(诱饵蛋白)形成抗原-抗体复合物,如果在系统中存在与抗原相互作用的蛋白质(靶蛋白),该蛋白质也会以复合物的形式沉淀下来,经过洗脱就可以得到与已知抗原相互作用的蛋白质,用于下一步研究。图1co-i图2CO-IP-MS...
中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目公开招标公告
中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目招标项目的潜在投标人应在oitccas获取招标文件,并于2024年09月09日13点30分(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:OITC-G240570350项目名称:中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目...
动态追踪蛋白质结构:深入了解氢氘交换质谱的原理与应用
一、氢氘交换质谱的基本原理氢氘交换质谱是一种测量蛋白质中氢和氘交换的技术(www.e993.com)2024年10月16日。当蛋白质暴露在含有氘化物的缓冲液中时,氢原子会被氘原子取代。交换速率取决于蛋白质的结构和溶液条件。通过质谱仪测量交换后的蛋白质样品,可以得到关于蛋白质结构的信息。交换速率较快的区域通常对应于蛋白质表面暴露的区域,而交换...
汇集结构质谱尖兵,开拓蛋白质结构生物学的新天地——第十四届质谱...
它是利用化学交联剂将空间距离足够接近的蛋白质内/间的氨基酸以共价键连接起来,再利用质谱对交联肽段进行鉴定,进而实现蛋白质相互作用的组成、界面和位点的解析。现有化学交联技术主要用于解析体外表达纯化的或细胞裂解液中的蛋白质复合物,而在细胞内蛋白质复合物的原位构像解析方面仍处于起步阶段。针对上述问题,我们...
整合生命组学数据,揭示生命复杂系统构成原理
二、蛋白质组学的研究方法双向电泳(2-DE):通过等电聚焦(IEF)和SDS-PAGE分离蛋白质,根据蛋白质的等电点和分子量进行分析。优点:分辨率高,适用于复杂样品。缺点:操作复杂,无法检测低丰度或难溶的蛋白质。质谱分析(MassSpectrometry,MS):质谱技术通过离子化蛋白质或肽段,测量其质荷比(m/z),用于蛋白质鉴...
1025万!中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪和黑龙江省农垦...
(一)项目基本情况项目编号:OITC-G240570350项目名称:中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目预算金额:525.000000万元(人民币)最高限价(如有):525.000000万元(人民币)采购需求:1、采购项目的名称、数量:投标人可对其中一个包或多个包进行投标,须以包为单位对包中全部内容进行投标,不得拆分,...
Nat Chem Biol | 北京大学王初/肖俊宇通过热蛋白质组分析发现金属...
热移测定(TSA)在配体与单个蛋白质结合的研究中得到了广泛的探索,其基本原理是配体结合会导致靶蛋白的热稳定性增加。Savitski等人将细胞TSA(CETSA)14和基于串联质量标签(TMT)的多重定量蛋白质组学相结合,开发了一种称为热蛋白质组分析(TPP)的方法,可以在蛋白质组水平上对活细胞中的药物靶标进行无偏鉴定。随后,TPP...