蛋白质设计师David Baker:我喜欢做那些“魔法”般的事
所以,这也是一个很好的例子,说明蛋白质设计可以帮助我们更好地理解天然蛋白质的工作方式。NSR:你们还设计过一个蛋白质转子,它是由两个单独设计的蛋白质组件组装而成的。所以,模块化是蛋白质设计的发展方向吗?Baker:没错。在蛋白质从头设计中,我们正在构建一组通用的结构组件,它们之间可以按照不同的方式进行简单...
重磅!2024年诺贝尔化学奖:AI驱动的蛋白质结构预测革新肿瘤治疗
蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)靶点:预测关键PPI的结构细节,设计小分子抑制剂或PROTAC分子来干扰这些相互作用,抑制癌细胞的生长和转移。变构调节位点识别:通过AI预测的蛋白质结构,识别潜在的变构调节位点,为开发变构调节剂提供新思路,调控蛋白质的功能和活性。RNA结合蛋白靶向:预测RNA结合蛋白的结构,设计干扰其功能的...
OpenAI最大对手:AI是时代的恩典!
可解释性就是一个明显的例子:虽然生物神经元和人工神经元运作方式表面上完全不同(它们通过脉冲,通常是脉冲频率来传递信息,所以有一个时间因素是人工神经元没有的,还有一些跟细胞生理学和神经递质相关的细节也会影响它们的工作方式),但“由简单的单元组成的分布式网络,经过训练,执行线性/非线性的组合操作,它们是怎么一...
50%入围命中率,用AI筛选药物上科大“冬旦之间”团队的办法是...
我们不依赖结构信息,而是利用最先进的蛋白质语言模型和AI技术进行预测,一方面有效减小了参数维度、节省计算时间,另外一方面也规避了本赛题涉及蛋白质无准确实验结构的限制。”““在学术界,我们可能更关注算法精度的提升,但在工业界,关注的则是成果能否转化为实际应用、算法能否真正降低药物研发的成本。”在团队成员...
靠做大餐救星,安琪纽特酵母蛋白走红网络,销量飙升800%
他表示,安琪纽特作为安琪酵母旗下的重要品牌,目前聚焦于酵母蛋白粉等核心产品,依托公司的酵母核心技术,专注于酵母源营养产品的开发和推广。安琪纽特酵母蛋白粉通过蛋白互补原理,将专利酵母蛋白与欧美进口乳清蛋白和非转基因大豆分离蛋白按照特定比例精心混合,使肠道更易吸收,产品销量已突破百万大关。
从诺奖到药物设计新宠,“强强联手”的DAC能否突破“不可成药”困境?
既然靶向蛋白降解和ADC优势互补,那么当两者强强联手,能否带来更高效的疗法?DAC正是在这样的想法下诞生(www.e993.com)2024年10月17日。ADC由单克隆抗体、连接子和小分子药物载荷组成,而DAC则是将小分子载荷替换成了靶向蛋白降解剂。以肿瘤治疗为例,DAC的抗体首先识别细胞表面的肿瘤相关抗原,这时DAC就可以通过受体介导的内吞作用进入细胞的溶酶体。
David Baker专访:选择重大的科学问题、享受你的工作
Baker:这取决于你想要实现的“特定功能”是什么。比如说,如果你想设计一个能够与某个癌细胞靶点结合的蛋白质,你需要首先确定二者的结合面,要做到这一点,你需要对这个靶点的结构和功能有所了解。之后,你可以设计出这个蛋白质的大致形状,这个形状应当能与靶蛋白互补;然后,再去设计结合面上的氨基酸序列,让二者在几何形...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
我们会举例说明RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用,包括转录和翻译的动力学分析,RNA结构,RNA-RNA和RNA-蛋白质间相互作用等。最后我们小小地展望一下RNA-seq的未来,如单细胞和空间转录组是否也会是以后的常规分析,在什么情况下longreads会替代shortreadsRNA-seq。不过篇幅有限,本文对RNA-seq分析还是有照顾不到...
AI助飞,这些科学家创业为何“多快好省”|范式变革催生新质生产力...
洪亮给记者打比方,“如果说ChatGPT是用大模型理解人类文字排列方式来做智能问答,那么Pro系列蛋白质大模型就是用AI学习自然界生物分子的设计规则,从而实现性能优越的各种蛋白产品的智能开发。”洪亮团队发表蛋白质全新序列研究成果。(资料)基于Pro系列大模型,他们与金赛药业联合开发用于纯化生物生长激素的极耐碱的单域...
蛋白质之间相互作用的判断有哪些常用方法?
3.蛋白质互补技术(ProteinComplementationAssay,PCA)蛋白质互补技术是一种利用分割的蛋白质标签在细胞中重组形成活性标签的方法。通过将目标蛋白的两个互补标签分别融合在两个不同的载体中,然后共转染至细胞中,若目标蛋白相互作用,则两个标签会重新组合形成一个完整的活性标签。