中科院1区-南中医: 仙连解毒方通过调节代谢谱、肠道菌群和代谢物...
其中,鞘脂代谢、甘油磷脂代谢相关性最强(p<0.05,影响>0.1),提示这两种代谢途径是XLJDD治疗CRC的关键途径。7.肠道菌群与临床因素的相关性分析CRC与炎症密切相关,肠道微生物群结构的变化也会影响宿主的代谢表型。因此,我们采用Spearman相关分析法探讨服用XLJDD后三者之间的相关性。炎症因子与肠道菌群的相关性研究表明...
全基因组选择技术 可预测玉米育种值
全基因组选择技术是利用遍布整个基因组的分子标记预测未测试育种材料的基因组估计育种值,利用基因组估计育种值代替田间测试表型进行选择。随着高密度分子标记鉴定费用的降低,全基因组选择技术有望替代多环境试验和大规模遗传交配设计,预测未测试杂交种产量和自交系配合力表现。近日,沈阳农业大学联合国际玉米小麦改良中心开展...
if5.5+陕西中医大:丹皮酚通过调节肠道微生物群和代谢物改善小鼠...
首先,我们评估了层内相关性,包括肠道微生物群、粪便代谢物和表型之间的相关性;肠道微生物群和粪便代谢物;以及粪便代谢物和表型。我们使用相关系数大于0.6的数据构建包含三层的集成可视化网络。如图7所示,肠道微生物层中的9个分类群,比如乳球菌、乳酸杆菌、Akkermansia和拟杆菌,以及粪便代谢物层中的33种代谢...
科研丨内蒙古农大: 牛奶发酵过程中的代谢差异和单个乳酸乳球菌乳...
颜色代表1和-1之间的Spearman相关系数数值大于0表示正相关,反之亦然。(原文图4)。6代谢物的多变量接受者操作特性(ROC)分析ROC曲线是评估一个或多个生物标志物预测性能的图形工具,表示一个生物标志物区分两组的能力。使用随机森林算法来计算影响率,绘制该物质和曲线下面积(AUC)的折线图(图6A)。AUC值越接近于1...
科研| 浙大(IF:16.8):多组学研究揭示与奶牛饲料效率有关的瘤胃微...
vectors,mmvec)条件概率估计的双标图;坐标轴:利用mmvec估计微生物-代谢物条件概率的奇异值分解的主成分;箭头:微生物,圆点:代谢物,圆点的颜色代表与宿主饲料效率的关系(蓝色:负相关,红色:正相关);考虑到高饲料效率(B)和低饲料效率(C)奶牛瘤胃中特定微生物类群的存在,热图显示了各种与效率相关的代谢物的推断条件...
年终变态长文:基因是怎么预测身高,抑郁,慢性病的?
GWAS简单来说,就是在基因位点相互独立的前提下,探索每一个基因位点对表型的影响(www.e993.com)2024年7月3日。目前几乎所有GWAS研究的DNA数据都是基因芯片提供的,检测大概几十万位点,然后我们可以借助imputation这样的技术,将这几十万个位点,扩展到1000万位点。imputation的原理在这就不详细说了,核心是DNA上,位点和位点之间存...
科研| 国人佳作:Prevotella copri增加饲喂配方饲粮的猪的脂肪积累
仅显示相关性大于0.5的分类单元。当P<0.005时,经过质量控制的OTUs通过置换多变量方差分析(PERMANOVA)分组为12个CAGs。右侧的颜色渐变显示CAGs和LMP间相关性的P值和系数。b与猪LMP相关的粪便微生物群的关键OTUs。c利用宏基因组测序数据发现与LMP显著相关的细菌物种。
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我们用“模块特征值”来代表该模块基因集表达量的综合值。因此可通过模块的特征向量与表型的相关系数或者模块的显著性P值,将每个模块与性状关联起来。此外,模块之间不是孤立存在的,相互之间是有联系的,通过网络热图可以直观的看到性状关联模块与其它模块之间的联系强弱。