经济学:动态模型平均(DMA)、动态模型选择(DMS)、ARIMA、TVP预测...
R语言:EM算法和高斯混合模型的实现左右滑动查看更多01020304for(iin1:(ncol(exp.coef.))){plot(exp.coef.[,i],type="l",col=col[i])}plot(index(exp.coef.[,i]),rep(0,length(x$exp.coef.[,i])xaxt='n',xlab="",ylab="",main="系数"图4最后,可...
R语言学习笔记(三)——实用的内置函数
关于循环相信接触R的人都十分了解,这里只列举两个递归函数的例子。(1)斐波那契数列斐波那契数列本身就是用递归定义的F(n)=F(n-1)+F(n-2),因此非常适合用递归函数实现。>fib<-function(n){#定义函数if(n==1|n==2){return(1)}else{return(fib(n-1)+fib(n-2))}}>...
【视频】R语言LDA线性判别、QDA二次判别分析分类葡萄酒品质数据|...
tetred.prb<-rdct(mod.gl,newdat=tstDattye="robtest.ped<-rep("good",length(pred.prconfusionMatrix(data=as.factor(test.pred),#绘制测试ROC图oc.l<-roc(testa$al,es.pr.rob$god)点击标题查阅往期内容01020304##测试误差和训练误差er.st.<-mean(tet...
IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践
近日,中国农业科学院刘永鑫组联合南京农业大学袁军组在国际期刊Protein&Cell(IF=21.1)发表了题为”“ThebestpracticeformicrobiomeanalysisusingR”的综述论文,建立了微生物组分析的R语言代码库EasyMicrobiomeR,助力微生物组学发展。图文摘要本文详细介绍了基于R语言的324个常用R包进行微生物组数据...
R语言并行计算加快土壤微生物生态学分析(1):spearman相关系数加快...
我们可以看到使用corr.test()函数进行计算需要313秒,而使用R代码进行并行计算仅需0.99秒。我们再比较一下不同线程情况下所需的时间。单核运行代码如下:system.time(network_construct(otu[,1:500],1))图3自建函数单核运行时间即使使用单核进行计算速度,也要比corr.test()函数快上很多,毕竟该函数里面...
R语言实现随机森林超详细教程
R语言实现(1)寻找最优参数mtry,即指定节点中用于二叉树的最佳变量个数:library("randomForest")n<-length(names(train_data))#计算数据集中自变量个数,等同n=ncol(train_data)rate=1#设置模型误判率向量初始值for(iin1:(n-1)){set.seed(1234)rf_train<-randomForest(as.factor(train_data$IS_...
技术文章:用R语言中的forestplot包绘制森林图的用法
在Meta分析中森林图比较常见,但其实掌握了用R语言中的forestplot包绘制森林图的各个用法,森林图可以用于表示其他数据类型各组间的指标的中值和四分位距的范围。它是在平面直角坐标系中,以一条垂直的无效线(横坐标刻度为1或0)为中心,平行于横轴的多条线段描述了每个组的指标的中值和可信区间,最后一行(Summary)则用...
R语言学习笔记(八) -极大似然估计
简单来说就是写出似然函数,取对数求导,令导数等于0,最后求出参数的极大似然估计。R语言学习笔记(二)??????R语言学习笔记(五)——曼哈顿图R语言学习笔记(七)-离散型数据的模型预测2R语言学习笔记(四)—pheatmapR语言学习笔记(三)——实用的内置函数R语言学习笔记(六)-离散型数据的模型预测1...
一文详解如何用 R 语言绘制热图
ColSideColors=c(rep("purple",5),rep("orange",6)))#参数RowSideColors和ColSideColors用于分别注释行和列颜色等,可help(heatmap)详情增强热图函数heatmap.2()在热图绘制方面提供许多扩展,此函数包装在gplots包里。library(gplots)heatmap.2(df,scale="none",col=bluered(100),...