IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践

近日,中国农业科学院刘永鑫组联合南京农业大学袁军组在国际期刊Protein&Cell(IF=21.1)发表了题为”“ThebestpracticeformicrobiomeanalysisusingR”的综述论文,建立了微生物组分析的R语言代码库EasyMicrobiomeR,助力微生物组学发展。图文摘要本文详细介绍了基于R语言的324个常用R包进行微生物组数据...

R语言学习 - 热图美化 (数值标准化和调整坐标轴顺序)

R包reshape2,轻松实现长、宽数据表格转换用R在地图上绘制网络图的三种方法PCA主成分分析实战和可视化附R代码和测试数据iTOL快速绘制颜值最高的进化树!12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化编程模板-R语言脚本写作:最简单的统计与绘图,包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出R语言统计入门课...

R语言学习笔记(二)

开发这个包的是鼎鼎大名的R语言大神HadleyWickham,他目前是Rstudio的首席科学家,除了dplyr包,还有包括ggplot2、reshape、tidyverse等应用极为广泛的R包也是他开发的。这里介绍的dplyr包主要是用来操作数据框的,概括起来主要有五大最常用的功能,包括过滤、筛选、排列、变换、汇总。大多数功能通过R的基础函数也能实现,但d...

用R语言把数据玩出花样

接下来,进行反正操作,把宽表再转换为长表,还是使用reshape()函数。#宽表变为长表>reshape(wide,direction="long")programfuntimeR.fun1Rfun18.31Java.fun1Javafun18.45PHP.fun1PHPfun110.49Python.fun1Pythonfun110.45R.fun2Rfun28.72Java.fun2Javafun24.15...

Keras R语言接口正式发布,同时公开20个完整示例

KerasR接口默认使用TensorFlow后端引擎。使用如下install_keras()函数安装核心Keras库和TensorFlow后端：library(keras)install_keras()（）这个函数默认基于CPU安装Keras和TensorFlow。如果你想要自定义安装，比如说想要利用英伟达GPU，可以查看install_keras()函数的详细文档。MNIST样例可以通过实现一个简单的例子来学习...

10个令人相见恨晚的R语言包

4.stringr我发现R基础库的字符串功能使用起来非常困难和麻烦(www.e993.com)2024年11月10日。HadleyWickham编写的另一个包,stringr,提供了一些非常需要的字符串运算符。很多函数使用那些做基础分析时不常用的数据结构。stringr非常易于使用。几乎所有的(和所有的重要功能)都以”str”为前缀,所以很容易记住。