R语言学习笔记(三)——实用的内置函数

R中有很多实用的内置函数,这里不做系统的介绍,仅列举一些在数据分析中非常实用的函数。(1)关于NA对于一组数据来说,如果出现了缺失值,在R中是不能直接进行统计分析的,好在R中有专门针对缺失值的几个函数,下面举例说明。>x<-c(1,2,3,4,4,NA)>mean(x)[1]NA向量x中有NA值,看到直接...

作出SCI论文中的table 1 原来这么简单!

今天给大家分享一下如何使用R语言完成表1的设计。library(tableone)library(survival)首先是加载tableone包,使用survival包中的pbc数据集进行演示data(pbc)head(pbc)查看pbc数据集的数据varsToFactor<-c("status","trt","ascites","hepato","spiders","edema","stage")pbc[varsToFactor]<-lapply...

技术文章:用R语言中的forestplot包绘制森林图的用法

以下使用forestplot函数画森林图,注意查看每个代码发生变化的参数以及对应图片中明显变化的地方。forestplot(tabletext,graph.pos=4,hrzl_lines=list("3"=gpar(lty=2),"11"=gpar(lwd=1,columns=c(1:3,5),col="#000044"),"12"=gpar(lwd=1,lty=2,columns=c(1:3,5),col="...

IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践

近日,中国农业科学院刘永鑫组联合南京农业大学袁军组在国际期刊Protein&Cell(IF=21.1)发表了题为”“ThebestpracticeformicrobiomeanalysisusingR”的综述论文,建立了微生物组分析的R语言代码库EasyMicrobiomeR,助力微生物组学发展。图文摘要本文详细介绍了基于R语言的324个常用R包进行微生物组数据...

R语言学习 - 热图美化 (数值标准化和调整坐标轴顺序)

R语言-热图绘制(heatmap)R语言-基础概念和矩阵操作R语言-热图简化推荐一款高颜值免费在线SCI绘图工具~~~热图美化上一期的绘图命令中,最后一行的操作抹去了之前设定的横轴标记的旋转,最后出来的图比较难看。上次我们是这么写的p<-p+xlab("samples")+theme_bw()+theme(panel.grid.ma...

数据代码分享|R语言回归分析:体脂数据、公交绿色出行与全球变暖2...

用线性回归方法来拟合数据方程的基本统计原则和它们如何描述数据元素之间的关系(www.e993.com)2024年11月10日。如何使用R准备数据进行回归分析(查看文末了解数据免费获取方式),定义一个线性方程并估计回归模型。案例1:体脂数据回归分析data=read.table("bodyfat.txt",header=F)给变量名赋值...

R语言广义加性混合模型(GAMM)分析长沙气象因子、空气污染、PM2.5...

airquality=read.csv("长沙气象站逐日气象+空气污染数据.csv")Region=read.csv("长沙市年各个站点的PM2.5每日浓度.csv",skip=1)Table2.SignificancetestsofPM2.5levelsfordifferentseason,region,daytimeanddayofweek.对不同季节、地区、白天和周日的PM2.5水平进行显著性检验。

10个令人相见恨晚的R语言包

4.stringr我发现R基础库的字符串功能使用起来非常困难和麻烦。HadleyWickham编写的另一个包,stringr,提供了一些非常需要的字符串运算符。很多函数使用那些做基础分析时不常用的数据结构。stringr非常易于使用。几乎所有的(和所有的重要功能)都以”str”为前缀,所以很容易记住。

R语言实现随机森林超详细教程

R语言实现(1)寻找最优参数mtry,即指定节点中用于二叉树的最佳变量个数:library("randomForest")n<-length(names(train_data))#计算数据集中自变量个数,等同n=ncol(train_data)rate=1#设置模型误判率向量初始值for(iin1:(n-1)){set.seed(1234)rf_train<-randomForest(as.factor(train_data$IS_...