超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...
科学家开发非天然氨基酸eFSY,能在活细胞中鉴定直接的蛋白质相互作用
能在活细胞中以原位方式捕获蛋白质之间较弱的、瞬时相互作用;能区分直接蛋白质与间接蛋白质相互作用;能鉴定蛋白质相互作用的界面;能提高蛋白质相互作用鉴定的灵敏度;能鉴定出在其它技术中丢失的、或未被鉴定出的蛋白质相互作用。例如,亲和纯化结合质谱鉴定技术是鉴定蛋白质相互作用的常用技术之一。但是,该技术...
新AI模型可大幅提高化合物-蛋白质相互作用预测可靠性—新闻—科学网
中国科学院上海药物研究所研究员郑明月,副研究员张素林、李叙潼,提出了基于知识图谱的人工智能计算模型PertKGE,并以数据驱动的形式从微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用(CPI)。9月19日,相关研究发表于《细胞基因组学》。对化合物和蛋白质之间的相互作用进行建模,是药物发现的基础。目前,研究人员可以利用不...
David Baker任科学顾问,初创公司发布世界最大蛋白质相互作用数据...
生物技术初创公司A-AlphaBio发布世界上最大的蛋白质相互作用数据库AlphaSeq,包含超7.5亿条测量结果,并且每个月以3M-50M数据点的速度快速扩展,解决数据集匮乏问题。蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-ProteinInteractions,PPI)是细胞生命活动的重要组成部分,在调控和维持细胞的生理功能中(如细胞的信号传导...
...商业大学辛嘉英教授等:酚酸与蛋白质和碳水化合物相互作用及对...
蛋白质与酚酸的相互作用受不同条件以及酚酸和蛋白质类型的影响,并引起其加工性质、营养价值、抗氧化活性等方面的变化,蛋白质与酚酸的相互作用能够拓展其应用领域和赋予新的价值,并进一步影响其所在的食品体系,因此可利用不同食物来源的蛋白质与酚酸结合以开发具有更好营养、功能、感官品质的新食物成分或产品。
分析蛋白质功能结构域的策略和步骤
6.细胞位置和相互作用分析了解蛋白质在细胞中的位置以及它与哪些其他蛋白质相互作用,也是理解其功能的关键(www.e993.com)2024年10月16日。百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商相关服务:httpsbiotech-pack/full-length-sequence.htmlhttpsbiotech-pack/protein-sequence.html...
AI+合成生物学,世界最大蛋白质相互作用数据库!
最新的结合亲和数据集(PDBbind+)只有3,176个蛋白质,相比较PDB收录的蛋白质/核酸结构超20万个。初创公司A-AlphaBio有望通过AI+合成生物学+NGS(下一代测序)的方式来突破这一困境。公司称拥有世界上最大的蛋白质相互作用数据集AlphaSeq,包含了超过7.5亿条测量结果,并且每个月以3M~50M数据点的速度快速扩展...
打破AlphaFold大模型局限,世界最大蛋白质相互作用数据集AlphaSeq...
他们最近发布的AlphaSeq数据库专注于蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI),包含了超过7.5亿条测量结果,构成了世界上最大的PPI数据集。在AlphaSeq数据的基础上,训练出的AlphaBind模型可以准确预测有不同结合特性(亲和力、特异性、交叉反应性、表位等)的蛋白质序列,从而辅助蛋白质设计或发现全新的蛋...
...Nature揭示:可卡因与人类多巴胺转运蛋白相互作用的精细结构...
近日,一篇发表在国际杂志Nature上题为“Structureofthehumandopaminetransporterincomplexwithcocaine”的研究报告中,来自哥本哈根大学等机构的科学家们揭示了可卡因与人类多巴胺转运蛋白相互作用的精细结构。这项发现有望助力更进一步地理解药物成瘾背后的分子机理。
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
AlphaFold3和AlphaFold2的区别(包含实践示范:如何使用AlphaFold3大模型开源服务器进行蛋白质结构预测以及相互作用预测)Rosettafold详解c)基于Alphafold的下游应用基于AF的蛋白-蛋白对接/蛋白-多肽对接利用AF2做多构象预测和功能发现基于AF2的环肽设计d)trrosetta幻想设计e)基于ProteinMPNN的蛋白质设计MPNN模型简...