嘉宾揭晓!9月5日“第六届蛋白质组学”主题研讨会不容错过
中国生物物理学会表型组学分会创会秘书长,中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学分会委员,中国抗癌协会专业委员会委员,Springer出版集团《Phenomics》杂志创刊执行主编。主要从事以蛋白质组为核心的临床多组学研究:开发一站式高效蛋白质组技术系统和数据云平台Firmiana;建立了内源性转录因子活性分析技术(catTFRE);转录因子...
AI填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制,促进新药...
2021年,DavidBaker团队在Science杂志发布了开源的蛋白质预测工具RoseTTAFold,该工具利用自然语言处理(NLP)技术,直接从多序列比对(MSA)中提取共进化信息,其预测精度可与CASP14中的AlphaFold2相媲美。从此,基于蛋白质序列的预训练模型,亦称为蛋白质语言模型(PLM),开始广泛应用于蛋白质结构预测。2022年末...
Nat Cancer | 梁晗等绘制癌症患者组织样本和细胞系的蛋白表达图谱...
这项研究所产生的蛋白表达图谱,具有几个主要优势。首先,研究人员分析了大约9,000个样本,涵盖所有主要癌症类型/细胞系。因此,RPPA500便于进行传统分析和高级数据挖掘,如全癌种范围的深度学习。与其他受癌症类型和技术问题限制的蛋白质组学研究不同,RPPA500允许直接跨癌症类型比较。其次,RPPA500涵盖了两个互补的数据集...
新质生产力-引领科研未来 | 2024单细胞蛋白质组学技术与产业应用...
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最新研究揭示小细胞肺癌蛋白质组分子分型及精准治疗方向
相关研究成果发表在权威学术杂志《基因组蛋白质组与生物信息学报》上。小细胞肺癌是一种高度恶性的肺神经内分泌肿瘤,其肿瘤细胞增殖活性高,早期转移倾向显著,治疗手段单一,预后差。现阶段并没有特别有效的评估预测患者预后、治疗反应和指导临床治疗的技术方案。研究团队依据蛋白质组特征,将小细胞肺癌分为3个分子亚型...
Nat Chem | 陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能...
作者通过一系列体外和体内实验证实了photoBQQ探针对三链体DNA的特异性识别能力及其对三链体DNA调控蛋白的临近标记活性(www.e993.com)2024年9月7日。利用该探针,作者在HeLa和A549细胞系中开展了化学蛋白质组学研究,特异性捕获并通过定量质谱成功鉴定了78个高置信度的三链体DNA互作蛋白,为理解三链体DNA的动态调控机制奠定了坚实基础。
FSHW | 综合蛋白质组-转录组分析揭示副干酪乳杆菌H4-11和马克斯...
在第3天和第1天分别进行了双菌发酵米酸和单菌发酵米酸的比较转录组和比较蛋白组分析,发现与L.paracaseiH4-11生长有关的大多数DEPs定位在细胞质、细胞质膜和细胞壁中(图1A和图1C)。而与K.marxianusL1-1生长有关的大多数DEPs定位在细胞核、线粒体、细胞质和线粒体中(图1B和图1D)。表明这两种细胞具有...
Nature评选今年值得关注的七大科技:蛋白质设计、脑机接口、细胞...
Nature杂志年初评选了2024年值得关注的七大科技,包括:用于蛋白质设计的深度学习、深度伪造检测、大片段DNA插入、脑机接口、超分辨率成像技术、细胞图谱、3D打印纳米材料。今年有许多科技创新令人兴奋,而人工智能是很多领域的核心所在。关键词:AIforBiology,蛋白质设计,脑机接口,超分辨率成像技术,细胞图谱、3D打印纳米...
通过监测血液中这三种蛋白质,能提前15年预测痴呆?
GFAP和GDF15与VaD的关联是本研究的新发现。尽管我们的研究提供了对血浆蛋白相对全面的评估,但并非所有的人类蛋白质组数据都能被捕获到,由于缺乏血浆Aβ和tau相关蛋白的检测数据,这限制了我们研究它们对痴呆的预测价值。澎湃科技:研究采用迄今为止全球最大规模的基于社区队列的蛋白质组学数据,能否介绍一下这些数据?
Nature | 由数千种蛋白质组成的最大数据集是人类健康研究的标志性...
这项具有里程碑意义的研究是由医药蛋白质组学项目开展的,该项目由13家领先的生物制药公司合作完成。研究小组对数据进行了分析,展示了利用这项研究进行未来研究的巨大潜力,包括建立一个可公开访问的影响血液中蛋白质水平的所有常见基因变异库,对英国生物库中前20种最常见疾病的血液蛋白质水平进行分析,以及训练机器...