8年“种”出一篇Science,他们期待更多科学家用上这套体系
此后8年间,黄学辉带领团队,从涵盖全球栽培稻主要遗传亚群的16份品系出发,构建了包含18421个稳定纯合的水稻“混血杂交”群体。这一独特的群体不仅具有完全清晰的遗传背景,而且打破了水稻自然群体中明显的遗传结构分群。同时,团队对全部株系进行了精细的基因型分析和表型测量,定位到控制16个重要农艺性状的96个高置信候选...
如何分析植物遗传进化?
主成分分析主要应用:群体分层、outlier筛选、亚群进化关系、群体结构矫正。本次课程利用smartpca软件进行实际操作,掌握二维图和三维图绘制。选择清除分析自然选择促使有利突变在群体中保留下来,与之连锁的中性位点突变频率提升,非连锁的中性位点突变频率下降;简单的说就是基因组某区域由于受到了选择而消除多态性,即遗传多...
科学家重建山东人群六千年遗传史,再证“重瓣花朵式假说”
在前述研究中,研究人员通过古基因组学分析发现,黄河中游的新石器农业人群深刻塑造了史前北方人群的遗传结构:黄河中游的新石器农业人群贡献了黄河下游山东大汶口文化人群58.6-100%的祖先成分、黄河上游甘青齐家文化人群约80.4%的祖先成分、内蒙古庙子沟文化人群约80%的祖先成分、黄河中游陕北地区石峁文化相关人群...
山东人从哪来?科学家重建山东人群六千年遗传史—新闻—科学网
在前述研究中,研究人员通过古基因组学分析发现,黄河中游的新石器农业人群深刻塑造了史前北方人群的遗传结构:黄河中游的新石器农业人群贡献了黄河下游山东大汶口文化人群58.6-100%的祖先成分、黄河上游甘青齐家文化人群约80.4%的祖先成分、内蒙古庙子沟文化人群约80%的祖先成分、黄河中游陕北地区石峁文化相关人群约79%...
追问daily | AI驱动游戏引擎,实时生成游戏画面;Claude系统提示词...
不同药物对抑郁症患者大脑层级结构的重组方式显著不同█AI行业动态Anthropic首次公开Claude系统提示词,推动AI透明化进程GameNGen:AI驱动游戏引擎,实时生成逼真游戏画面Cerebras发布超快AI推理系统█AI研发动态高效检测孤独症遗传标记的脑成像技术牛津大学光计算突破:打破传统,提升AI算力新高度...
Cell | 综述:解密复杂性状的遗传与分子基础
遗传变异主要分为两类:序列变异和结构变异(www.e993.com)2024年9月19日。序列变异包括单核苷酸多态性(SNPs)、插入和缺失(Indels),而结构变异则包括拷贝数变异(CNVs)、倒位、易位和大片段的插入或缺失。这些变异通过改变基因序列或基因表达调控元件,进而影响基因表达的水平和模式。遗传变异对基因表达调控的具体影响...
...团队开发trRosettaRNA:利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构
trRosettaRNA的结构如图1所示。从RNA的核苷酸序列开始,首先分别通过程序rMSA和SPOT-RNA生成多重序列比对(MSA)和二级结构。然后将它们转换为MSA表示和配对表示,然后将其输入transformer网络(名为RNAformer)以预测1D和2D几何形状。与trRosetta类似,这些几何形状被转换为约束,以指导基于能量...
汉语到底是如何演化的?复旦团队用科技手段回答新文科议题
据介绍,该研究整合了语言学、群体遗传学和生态学等多学科的理论和方法,深入解析了汉语方言内部的精细化结构和地理分布规律,同时结合现有的群体遗传数据,系统分析了中国各地语言和群体遗传结构之间的关系,透视了汉文化传播和融合的多重模式,为探究汉族人群的人口活动与语言文化交融的复杂历史提供了全新的视角。
群体进化,文章发表就这么简单!
群体遗传学是研究群体的遗传结构及其变化规律的遗传学分支学科。其应用数学和统计学方法研究群体中基因频率和基因型频率以及影响这些频率的选择效应和突变作用,研究迁移和遗传漂变等与遗传结构的关系。为了让更多的研究者能够自主的进行群体遗传进化以及GWAS分析,并将结果用于高分文章的发表。
提取38个古人基因 厦大研究发现中原地区人群"一脉相承"
研究人员观察到,自新石器时代晚期以来,中原地区没有看到明显的人群遗传结构的改变,并没有受到印欧人群、匈奴和鲜卑等北方游牧人群的显著影响,这与欧洲动荡的人口历史形成鲜明对比。不过,唯一的遗传离群值是一个可以追溯到明清时期的个体——该个体与一些现代中国南方少数民族人群相对遗传同质,都可以被模拟为中原古人和...