Nature Methods主题特刊:关注 AI 在生物学中的应用

在生成细胞类型特异的蛋白质表示时,模型考虑了多种生物背景信息,如单细胞转录组数据、蛋白质-蛋白质相互作用网络、细胞类型到细胞类型的相互作用和组织层次等。相信这个模型将会为整个领域提供一定的方向指引。PINNACLE在考虑生物学背景信息的情况下学习蛋白质表示httpsnature/articles/s41592-024-02341-3...

厦门大学韩家淮及全球12位细胞生物学家眼中的细胞生物学

有了额外的单细胞原位信息,就能以时空分辨率建立生物过程模型。系统稳态是任何生物体生命的基本要求,而细胞稳态是系统稳态的基础,维持细胞稳态的细胞应激反应是不可或缺的。单细胞分析和亚细胞分析彻底改变了细胞反应机制的发现方法,使科学家能够发现适应不良条件下,各组织、器官和整个机体的协调细胞应激反应。JulieA....

吴家睿:21世纪生物医学的三个主要发展趋势|2022科学发展报告

这种复杂性思维转变之代表是，2000年之初在生命科学领域兴起了一门交叉学科——系统生物学(systemsbiology)，即整合经典的分子细胞生物学、新兴的各种组学，以及信息科学和数学等非生物学科的研究策略和方法，对生命复杂系统及其生理病理活动进行系统性和整体性的检测和分析。这门新兴学科很快得到了研究人员的接受和重视；...

大数据时代下生命科学研究面临的挑战及解决方案

生命系统呈现分子、细胞、组织、个体等多层次的结构,并且这些层次之间高度互联、动态调控,形成了一个复杂的系统;而由此获得的数据也具有多层次、动态变化的特点。此外,随着生命科学研究的不断深入,海量的多组学数据、文献资料和其他生物学数据持续涌现和积累,从而导致数据规模和复杂性进一步增加。这种多类型、多维度且体量...

FEIPU MILC|数据驱动的生命科学研究进展

生命系统呈现分子、细胞、组织、个体等多层次的结构,并且这些层次之间高度互联、动态调控,形成了一个复杂的系统;而由此获得的数据也具有多层次、动态变化的特点。此外,随着生命科学研究的不断深入,海量的多组学数据、文献资料和其他生物学数据持续涌现和积累,从而导致数据规模和复杂性进一步增加。这种多类型、多维度且体量...

诺禾致源2023年年度董事会经营评述

公司持续创新技术和解决方案体系,拓展多组学服务边界,多组学的集成解决方案协助科学家以更系统的视角迎接复杂挑战(www.e993.com)2024年11月15日。多组学的整合解决方案协助科学家以解析复杂的生物科学现象。公司在多组学解决方案上建立了完善的服务体系,并已开发包括基因组学、变异组学、转录组学、表观组学、微生物组学、空间转录组学、单细胞测序技术...

从三叶虫到元谋人,《人民日报》整版关注云南化石地

云南地层通过古生物化石记录地球生命系统演化发展的过程从生命起源到智慧萌芽,云南地层通过古生物化石记录了地球生命系统演化发展的过程:去澄江看虫,认识寒武纪生命大爆发的奇迹;到罗平观鱼,观看三叠纪时期大灭绝后的生物苏醒;在禄丰摸龙,触摸侏罗纪霸主庞大的身躯;在元谋识骨,追寻古人类的足迹。近日,记者行走彩云之南...

极端制造 | 单细胞分辨率生物制造策略综述

作为一门跨学科生物技术,生物制造将活细胞引入制造过程,使得体外构建复杂生物组织及生命系统成为可能。常用的生物制造方法是对生物材料进行一体式(bulk)成型制造,但是该方法较难实现微观细节和组分的可控分布。基于模块化组装的生物制造方法基于离散-组装的制造思想,使用细胞、生物材料及其结合体作为构建单元来组装所需的...

从单细胞到多细胞 科学家揭开十亿年前的生物进化大事

该研究揭示了植物单细胞到多细胞进化和陆生植物起源的机制,补上了生命进化研究过程中一直缺失的重要节点,对认识整个生命系统起源具有重要的理论和实践意义。该研究成果在线发表在《尖端科学(AdvancedScience)》上。10亿年前的一大步地球上最早的生命,可以追溯到35亿年前,但一直到10亿年前,这些生物仍旧处于单细胞...

AI生命科学走到哪了?谢晓亮、Arieh Warshel、高毅勤、唐建、许田...

同时,单细胞技术的发展,轻松地获得十万、百万的数据点变得不再遥远,结合人工智能算法,能极大地提高了解析复杂生物系统的可能性。高歌在报告中也提到了遇到的挑战:数据质量与传统方法相比存在差异。为此,高歌运用生成模型来解决单细胞数据分析中的问题:建立对抗部分,通过优化目标函数实现对批次效应(batcheffect)的预测。