中科院启动首个国际科学计划 力图突破合成生物学技术核心瓶颈

日前，中国科学院第一个国际科学计划暨合成细胞国际科学计划在深圳举行的首届合成细胞国际会议上宣布启动。据介绍，合成细胞研究涉及从生物大分子到单细胞的多层次技术，复杂性递增，且缺乏跨层次理论指导。关键技术如DNA复制、基因组合成等发展不平衡，模块协同难度大。各国虽各有所长，但标准不统一、平台缺失，限制了整...

Nat Commun|空间转录组学和单细胞多组学整合分析构建人类胸腺细胞...

研究人员对16个胸腺样本进行了单细胞转录组测序,包括产前(4个样本)、儿童(8个样本)、成人(2个样本)和老年(2个样本)阶段(图1a,b)。经过质量控制、整合、主成分分析(PCA)和无监督聚类后,利用典型标记,将聚集的细胞预先注释为六大谱系,即红系(Ery)细胞(HBG1和HBG2)、B细胞(CD79A和CD19)、浆细胞(IGHG1和IG...

聚焦合成细胞研究!中国科学院首个国际科学计划启动

合成细胞研究涉及从生物大分子到单细胞的多层次技术,复杂性递增且缺乏跨层次理论指导,其中DNA复制、基因组合成等关键技术发展不平衡,模块协同难度大。作为全球性大科学难题,该领域的研究急需国际协作。2014年以来,全球各国竞相在人工合成单细胞生命领域投入重点研发项目和研究计划,我国也紧跟步伐,进行了系统化布局。2023...

Nat Commun | 龙尔平等合作建立人类肺组织单细胞多组学图谱定位...

该研究运用单细胞同胞转录组和表观遗传组测序技术,建立了第一个人类肺组织单细胞多组学图谱;研发不同层次的多组学整合手段,发现了介导肺癌遗传易感性的不同细胞亚群、关键分子及信号通路;阐明了细胞类型特异的肺癌易感基因和演变规律,提供了具有潜在临床应用价值的肺癌精准诊疗靶点和关键分子表型。图1.本研究的总体...

Nature子刊 | 单细胞技术鉴定对弥漫性大B细胞淋巴瘤有临床效果的...

研究团队首先通过纳米孔网格的延时成像显微镜(TIMING)、三维共聚焦显微镜单细胞水平对样品细胞进行了检测。结果显示,CR个体的T细胞迁移速度、T细胞的线粒体和溶酶体体积显著高于PR或PD个体,无监督的层次聚类的结果则表明连续杀伤、迁移能力以及线粒体和溶酶体体积增加是与CR个体的T细胞相关的特征。

Nat. Methods. 速递:考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型

鉴于此,来自哈佛大学的MarinkaZitnik教授团队开发了一种考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型——PINNACLE,通过结合单细胞转录组数据、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、细胞相互作用和组织层次数据,为每个蛋白质生成细胞类型特异的低维表示,该模型生成的结果能够显著增强之前仅通过蛋白三维结构得到的通用表示,进而完...

iMeta | 徐健/姚粟/崔云龙-合作发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞...

因此,我们提出了一种无需标记、单细胞精度、基因组-表型组结合的策略,利用单细胞拉曼光谱和基因组测序的互补优势,称为单细胞鉴定、原位活力和活性检测与溯源(SCIVVS),并以益生菌(包括乳酸杆菌、双歧杆菌和链球菌)为例进行了验证。在SCIVVS中,使用D2O标记的单细胞拉曼显微光谱技术,直接从产品中提取单个细胞进行总活...

【日程公布】第五届单细胞技术应用研讨会暨空间组学前沿研讨会9月...

论坛背景为了加强国内外单细胞和空间生物技术学术交流,促进单细胞&空间组学基础研究、转化与临床研究深入发展,“第五届单细胞技术应用研讨会暨空间组学前沿研讨会”将于2024年09月20-21日在中国·北京召开。为推动我国单细胞组学技术更快、更优的解决临床问题,转化

Nature子刊:龙尔平等合作建立人类肺组织单细胞多组学图谱定位肺癌...

研究团队针对转录组RNA-seq和表观遗传组ATAC-seq的数据特征,创新了一套多层次的顺式调控元件-靶基因关联算法,定位了64个肺癌易感基因,为后续的药物研发和干预提供具有潜在临床应用价值的精准诊疗靶点和关键分子表型。图2.人类肺组织单细胞多组学(转录组和表观遗传组学)图谱...

今晚直播前沿技术讲座| 三维多组学单细胞技术的开发以及应用

报告人将介绍其新开发的ChIATAC技术,该技术专门针对低细胞起始量进行三维基因组研究。此外,报告人还将展示其最新研发的ChAIR技术,这一创新技术能够在单细胞层面上同时分析三维基因组结构、染色质开放区域和转录组,为研究者提供了一个全面的方法来探索染色质结构对转录调控的影响。