Nat Commun | 张赫团队揭示DNA-lncRNA三链体“招募促癌”新机制

DNA-RNA三链体是双链DNA与单链RNA相互作用形成的异源三链杂交体,在DNA-RNA三链体形成过程中,单链RNA与富含嘌呤的双链DNA通过碱基互补配对,利用Hoogsteen氢键形成并维持三链体的稳定性1。相较于传统的沃森-克里克碱基配对,Hoogsteen氢键更加灵活,因此RNA可以更广泛、更灵活地与基因组DNA结合,从而为分子之间的动...

...上发文揭示DNA-lncRNA三链体“招募促癌”新机制-同济大学新闻网

DNA-RNA三链体是双链DNA与单链RNA相互作用形成的异源三链杂交体,在DNA-RNA三链体形成过程中,单链RNA与富含嘌呤的双链DNA通过碱基互补配对,利用Hoogsteen氢键形成并维持三链体的稳定性。已有研究报道表明,DNA-RNA三链体广泛参与基因表达调控、DNA损伤修复、染色体稳定维护和肿瘤发生发展等多个重要的生理和病理过程。...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

由于mRNA片段化和基于beads的文库纯化过程中偏好150-200bp的片段,导致这个方案最后获得的cDNA片段都在200bp以下。每个样本平均测20-30millionreads,对每个基因或转录本进行定量,再统计分析差异基因(参考RNA-seq数据分析部分)。short-readRNA-seq结果很稳定,对RNA-seq的short-read测序技术多次测试比较发现,其平台内...

分子杂交仪 沃信杂交炉杂交箱主要用于检测RNA分子特异性相互作用

分子杂交仪:主要用于检测DNA或RNA分子之间的特异性相互作用,即杂交反应。通过控制温度、时间等条件,使特定的探针与待测样本中的核酸序列进行杂交,从而判断样本中是否存在目标序列。分子杂交仪广泛应用于基因表达分析、突变检测、病原体检测等领域。基因测序仪:则是一种直接测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。它...

沃信图文科普:紫外交联仪可用于修复DNA分子中的单链断裂

紫外交联仪在DNA和RNA研究中具有广泛的应用,主要体现在以下几个方面:一、DNA研究中的应用DNA印迹杂交紫外交联仪常用于DNA印迹杂交实验中,通过紫外线照射使DNA变性并固定在膜上,进而与特定的探针进行杂交,以检测和量化DNA样品中的特定序列。这种方法在基因表达分析、遗传病诊断、基因多态性研究等方面具有重要意义。

Nature子刊:同济大学张赫团队揭示DNA-lncRNA三链体“招募促癌”新...

该研究率先揭示了肽基脯氨酰异构酶A(PPIA)指导的DNA-lncRNA三链体“招募促癌”机制,首次提出了异构酶辅助DNA-RNA杂交体形成的创新概念(www.e993.com)2024年11月3日。为了研究DNA-lncRNA三链体在肿瘤发生中的作用和调控机制,研究团队确定了他们此前发现并命名的促癌lncRNAGAU1作为三链体候选分子。通过预测发现,GAU1在整个基因组中有48086个...

RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析

RNAseq和WES识别了常规方法未检测到的其他遗传学异常。最后,重点介绍了3个案例,说明了如何实现不同诊断技术和专家之间的协同作用。本研究表明了现代测序技术和流式细胞术整合到淋巴瘤常规诊断中的可行性,并讨论了附加价值。在儿童淋巴瘤患者中,RNA和DNA测序的纳入不仅能支持诊断,而且能为开发基于研究的新型治疗策略...

肺癌融合基因检测:RNA 水平的 NGS 你听过吗?

DNA水平检测融合基因的不足及RNA水平检测融合基因的优势从DNA水平检测融合基因不可避免存在如下局限性和挑战:融合基因检测要全面覆盖非常冗长且含有大量重复序列的内含子区域,才能准确地找到融合断裂点;内含子区域GC含量变化不利于探针均匀有效地捕获目标区域片段;...

沃信:分子杂交仪(杂交炉 杂交箱)功能、原理和应用场景分享

分子杂交仪:基于核酸分子的变性和复性原理。在变性条件下,DNA或RNA双链解离成单链;在复性条件下,单链重新组合成双链;在杂交条件下,特异性探针与目标DNA或RNA片段进行杂交。通过检测杂交信号的有无和强度,可以判断样本中是否存在目标序列。基因测序仪:则主要基于Sanger发明的双脱氧链末端终止法或Maxam-Gilbert发明的...

2025天津医科大学《810生物学基础》全国硕士研究生入学统一考试大纲

3、重组DNA分子的构建4、重组DNA分子导入受体细胞5、重组克隆的筛选分子生物学DNA的生物合成一、DNA的复制(一)正常复制是生物体种族延续和个体发育的保证(二)DNA复制的基本特征是半保留复制1、半保留复制的概念2、半保留复制的证明3、半保留复制的重要意义...