中科大团队提出基于深度学习的空间转录组结构表征 SPACEL

SPACEL包含三个模块:Spoint嵌入了带有概率模型的多层感知器,用于对单个ST切片中每个点的细胞类型组成进行解卷积;Splane采用图卷积网络方法和对抗性学习算法来识别跨多个ST切片在转录组和空间上一致的空间域;Scube自动转换连续切片的空间坐标系并将它们堆叠在一起以构建组织的3D结构。图1:SPACEL流程。