Cell | TR-gnomAD:揭示遗传多样性中串联重复的全新视角

串联重复是指基因组中连续重复的DNA序列,它们在进化和疾病形成中发挥着关键作用。尽管它们构成了我们基因组的约6%,但到目前为止,全球性的生物样本库(biobank-scale)对这类遗传变异的参考图谱仍然非常有限。基因组聚合数据库(GenomeAggregationDatabase,gnomAD)虽然被广泛认为是单核苷酸变异(Single-NucleotideVariants,...

iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...

此外,通过与人类代谢组数据库(HMDB)比较分析,共有371种代谢物(占总代谢物的44.48%)被识别,主要包括脂类和亲脂分子、有机酸及其衍生物、有机杂环化合物(图S4A)。而通过与LipidMaps数据库进行对比,识别出128种代谢物(占总代谢物的15.34%),该亚群中的主要类别包括磷脂酸(PA)、甘油磷酸乙醇胺(GP02)、脂肪酸及其...

图灵奖数据库大师 Stonebraker 师徒对数据库近 20 年发展与展望的...

非规范化/预连接的问题是一个古老的话题,可以追溯到1970年代[116]:(1)如果联接不是一对多,那么就会有重复数据,(2)预连接并不一定比联接更快,(3)没有数据独立性。尽管他们强烈抨击SQL很糟糕,但到2010年代末,几乎所有NoSQLDBMS都添加了SQL接口。直接的例子包括DynamoDBPartiQL[56]...

数据清洗的概念、常见问题及实践方法

处理重复数据需要根据具体情况来选择合适的方法。除了使用现有的数据清洗工具外,还需要结合业务规则和数据特点来进行合理的数据清洗操作。以下是处理重复数据的方法:1.数据值完全相同的多条数据记录对于值完全相同的数据,可以使用一些去重工具自动识别和删除重复的数据行。例如,可以使用帆软FDL等数据清洗工具进行去重操作。

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

样本提取前是否需要去除宿主细胞或核酸,应结合样本类型及应用方向综合考虑。例如,tNGS可靶向捕获特异性病原微生物的核酸,人源核酸对检测结果的干扰较小。而对于mNGS而言,如果样本中宿主细胞含量较高,在测序数据量恒定的条件下,会导致病原微生物检测的灵敏度降低,因此,高宿主背景样本提取前可考虑采用经过验证的方法去除...

如何设计真正的实时数据湖?

在试图将这一理论运用到数据湖设计实践中时,我们发现流和表作为数据的两种形态,之间互相转换的方法和时空特性,是研究的重点(www.e993.com)2024年11月24日。分析过程大致如下,剖析Oracle、MySQL等经典数据库设计,不难发现传统数据库的构成都是data+log,即数据文件与日志文件。其中,log本身就属于流的范畴。换句话说,在传统数据库中,实际上...

240万亿数据被洗出够训18个GPT4!全球23所机构联手公开清洗秘籍

从巨大的CommonCrawl爬虫网站库中，我们获取了一个包含2023年之前所有数据的庞大数据集，总容量高达240T。这些数据未经筛选，如同一个信息的宝库，等待我们去发掘其中的价值。实际上，DCLM-POOL这个数据库拥有惊人的2000亿篇文档，经过gzip压缩后，这些文档的总容量达到了370TB。而这些海量的文档在处理过程中，生成了...

今日发布!上海法院知识产权专业化审判三十周年100件经典案例

今年是上海法院知识产权专业化审判三十周年。三十年来,三级法院充分发挥知识产权审判职能,严格公正司法、激励创新创造、维护公平竞争、促进文化繁荣、服务对外开放,涌现出一大批具有典型性、代表性和引领性的优秀案例。现发布上海法院知识产权专业化审判三十周年100件经典案例,并从中选取部分经典案例予以介绍。

肥西县派河流域工业污染源预警溯源监管系统运维保障服务招标公告...

3、重复性:≤2%4、零点漂移:±2mg/L5、量程漂移:±2FS6、测量模式:整点测试;连续测试7、计量方式:采用自适应双红外计量定量技术,进样稳定性好8、环境温度:5℃～40℃9、工作电压:AC220V±22V10、记忆效应:≤1.0mg/L11、检出限:5.0mg/L...

复旦类脑智能科技研究院2023年科研成果汇编

MetaBinner在CAMIII大规模宏基因组数据解析国际竞赛的重叠群分箱任务中整体排名最优。阅读连接:httpsgenomebiology.biomedcentral/articles/10.1186/s13059-022-02832-62建立空间组学数据库和快速读取方法SODB2023年2月16日,复旦大学类脑智能科学与技术研究院原致远青年副研究员与德州大学达拉斯分校张奇伟...