微生物组-宏基因组分析专题研讨会 (2024.11,线下+线上)
生信中最常用的三类语言是Shell+R+Python/Perl,前两门是基础,保证你完成项目分析。我们在课上将同时讲解生物学家必要掌握的Shell和R语言基础知识,保证你高效、稳定的使用宏基因分析平台、保证大数据分析和后期可视化至发表阶段所需的技能。我们在文后提供了学习视频供提前预习。图3.Shell和R学习大纲,首创Rstu...
青年博士Nature,Science双发,植物领域迎来史上“翻天覆地”的变化!
2.Rstudio软件与R包安装3.R语言语法及数据类型4.条件语句和循环Linux实操1.Linux操作系统2.Linux操作系统的安装与设置3.网络配置与服务进程管理4.Linux的远程登录管理5.常用的Linux命令6.在Linux下获取基因数据7.Shellscript与Vim编辑器下·第三天微生物组常用分析方法(实操)1...
R语言实例操作分析GEO数据库甲基化芯片
将表格粘贴在txt文档里面,以“group.txt”命名。将M.txt和group.txt放在同一文件夹里,文件夹名就叫M吧,文件的准备已告一段落。接下来,就可以打开Rstdio了(和R软件运行一样,本质也是R软件,只是界面不同),做分析之前,需要安装甲基化芯片相关的包,这个过程一般比较慢,大概2h。而通过以下的代码就可以实现安装。...
食品科学新突破!利用机器学习与人工智能做食品科学研究,高分论文...
(3)R语言tidyverse(4)R语言正则表达式;(5)代谢组学数据过滤;(6)代谢组学数据Scaling原理与R实现;(7)代谢组学数据的Normalization;(8)代谢组学数据清洗演练;D2在线代谢组分析网页Metaboanalyst操作(1)用R将数据清洗成网页需要的格式;(2)独立组、配对组和多组的数据...
Nature文献速读!多位生物医学领域“大牛”研究方法流出,学会这些...
D1代谢组学数据清洗与R语言进阶(1)代谢组学中的t、fold-change和响应值;(2)数据清洗流程;(3)R语言tidyverse(4)R语言正则表达式;(5)代谢组学数据过滤;(6)代谢组学数据Scaling原理与R实现;(7)代谢组学数据的Normalization;...
强!本科生在Nature(IF=36)发表文章,爆炸性信息!
深度学习通过强大的深度神经网络模型从高维大数据中自动挖掘数据潜在特征得以实现,过去10年,深度学习在计算机视觉、语音识别、自然语言处理领域取得了巨大成功(www.e993.com)2024年10月16日。基因组学大数据与疾病表型间的复杂关系难以解析,运用深度学习挖掘多组学数据探索复杂疾病致病机制及药物反应机制将会极大的提升精准医学和转化医学的进度。,近两年国内...
TBtools一种面向生物学家的HTS数据处理工具包
1.设置gff3/gtf文件。2.单击“初始化”按钮,TBTools将提供可供用户选择的功能。3.选择一个目标特性,例如:“CDS”4.选择一个ID对特定特征的序列段进行分组。“Parent”5.建立基因组序列档案。6.设置输出文件。如果要从CDS上游或下游提取序列,例如从CDS上游提取2000bp序列(通常称为“启动区域”),则需...
西湖大学多学科联合招聘
5.请将以上材料合并为单一PDF文件,发送至a.kavokin@westlake.edu,邮件标题和附件请注明:ResearchAssistant+姓名拼音;6.通过初审者会安排电话和英文面试。上述岗位招满前一直有效。西湖大学生命科学学院研究员许圳杰科研团队招聘启事本实验室利用分子细胞生物学技术、超高分辨率活细胞显微成像结合生物化学与动物...