追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?Vol.38
实验结果表明,在帕金森病患者的EV中,磷酸化??-突触核蛋白相对于总??-突触核蛋白的比例显著高于血浆整体中的水平,表明EV可以保护这种磷酸化标记免受循环磷酸酶的影响,从而保存疾病进程的关键信息。研究进一步验证了该技术的诊断潜力,为帕金森病和路易体痴呆等脑部疾病的早期诊断带来新的可能。研究结果已发表在PNAS...
填补AlphaFold3空白,字节跳动提出物理引导的方法让蛋白质动起来
CONFDIFF首先在SE(3)空间上构建了一个非条件的生成扩散模型,通过预测主链原子坐标和主链朝向来构建蛋白质构象。为了充分利用先验结构和序列信息,CONFDIFF使用目标序列的预训练表示训练了一个基于序列的条件生成模型来引导上述的非条件模型,使生成构象拥有多样性的同时又能符合相应的结构与序列约束。图1:COFFDIFF...
人类/小鼠的肝脏、胰腺类器官培养建立及基因操作(下)
(vii)吸尽上清,每个样品加入30??l的Direct-PCR溶液,外加0.5??l的蛋白酶K(20mg/ml原液)。(viii)将样品在60℃下培养过夜。(ix)室温下,≥8000g离心10min。(x)4°C保存DNA。▲关键步骤在裂解缓冲液(Direct-PCR溶液)中长时间储存可能会影响DNA和随后的PCR扩增。因此,要么使用新分离的DNA,...
bioRxiv |小分子靶向新冠病毒木瓜蛋白酶样蛋白
SARS-CoV-2PLpro与SARS具有90%的相似性,而与MERS也有49%的相似度。PLpro含有较高丰度的半胱氨酸,其中四个对于锌离子的匹配至关重要,活性中心的Cys111具有高反应活性和不同氧化态,构成催化三联体,与主要蛋白酶的反应基团与机理有一定差异。研究者测定了不同条件下的PLpro晶体结构,类似拇指-手掌-手指的结构,具有...
今日《科学》:可爱龙实验室解析 sgRNA引导和靶向RNA激活的蛋白酶...
这些研究表明,该系统的蛋白酶活性调控十分严谨,需要同时满足至少三个条件。第一,目标RNA必须和guideRNA的引导区完全互补配对(至少18个碱基)。第二,guideRNA5'tag位置的PFS区的前两位(-1和-2位置碱基)必须与目标RNA错配。与靶向互补配对。第三,靶向RNA的3'端除去前两位不能错配的碱基之外还需要额外至少3个...
中国新冠药物研究登《科学》封面!发现靶向主蛋白酶新候选药
研究人员表明,11a和11b在体外展示出对SARS-CoV-2主蛋白酶极佳的抑制活性,在1μM浓度下抑制性分别达到100%和96%(www.e993.com)2024年11月19日。同时抗病毒活性测试结果表明,化合物11a和11b都具有较好的抗病毒效果,EC50(半最大效应浓度,指能引起50%最大效应的浓度)分别为0.53μM和0.72μM。化合物11a(图A)和11b(图B)对新冠...
【学术前沿】 蛋白酶抑制剂可有效抑制SARS-CoV-2感染
SARS-CoV感染过程中需要蛋白酶切割S蛋白),评估TMPRSS2和CatB/L两种蛋白酶在SARS-CoV-2感染过程中的作用,在表达TMPRSS2的Caco-2细胞系和Vero细胞系中,加入TMPRSS2抑制剂camostatmesylate,可部分抑制SARS-CoV-2感染细胞;在两种蛋白酶都表达的Caco-2细胞系和仅表达CatB/L的293T细胞系中通过改变条件抑制Cat...
有助于抑制剂研发!中德科学家揭示新冠病毒主蛋白酶晶体结构
为了提高化合物在等离子体中的半衰期,他们通过将P3-P2酰胺键隐藏在一个吡啶酮环中来修饰11r(图1中的绿圈),并预期这可能会阻止细胞蛋白酶访问这个键和裂解它。此外,为了增加化合物在血浆中的溶解度并减少其与血浆蛋白的结合,他们用疏水的Boc基团取代疏水的肉桂基(图1,红色圆圈)得到13a。
专家点评Science丨革命性新工具——sgRNA引导和RNA激活的蛋白酶系统
这些研究表明,该系统的蛋白酶活性调控十分严谨,需要同时满足至少三个条件。第一,目标RNA必须和guideRNA的引导区完全互补配对(至少18个碱基)。第二,guideRNA5'tag位置的PFS区的前两位(-1和-2位置碱基)必须与目标RNA错配。与靶向互补配对。第三,靶向RNA的3'端除去前两位不能错配的碱基之外还需要额外...
Cell|蛋白酶抑制剂可有效抑制SARS-CoV-2感染
SARS-CoV感染过程中需要蛋白酶切割S蛋白),评估TMPRSS2和CatB/L两种蛋白酶在SARS-CoV-2感染过程中的作用,在表达TMPRSS2的Caco-2细胞系和Vero细胞系中,加入TMPRSS2抑制剂camostatmesylate,可部分抑制SARS-CoV-2感染细胞;在两种蛋白酶都表达的Caco-2细胞系和仅表达CatB/L的293T细胞系中通过改变条件抑制Cat...