经典荟萃|近期植物泛基因组研究集锦
1中国农业科学院蔬菜花卉研究所钱伟团队构建了菠菜泛基因组近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所钱伟团队在国际植物学知名期刊PlantBiotechnologyJournal在线发表了题为“Pan-genomeanalysisof13Spinaciaaccessionsrevealsstructuralvariationsassociatedwithsexchromosomeevolutionanddomesticationtraitsinspinac...
小植物拥有已知最大基因组
Tmesipterisoblanceolate拥有迄今发现的最大基因组。本报讯人类基因组由30亿个碱基对组成,然而与太平洋新喀里多尼亚等岛屿上的一种蕨——Tmesipterisoblanceolate相比,就是小巫见大巫了。因为这种蕨类植物拥有迄今为止发现的最大基因组,包含1600亿个碱基对。相关研究5月31日发表于《交叉科学》。这一发现有望帮...
一种蕨类植物或拥有最大基因组,碱基对数量为人类基因组的50多倍
披针叶梅溪蕨是一种罕见的植物,只生长在太平洋西南部的新喀里多尼亚和瓦努阿图的一些岛屿上。2023年,研究人员从新喀里多尼亚采集了样本。为计算该蕨类植物基因组的大小,他们从其茎中提取细胞核,用荧光染料对细胞核内的DNA进行染色,然后测量细胞核通过光探测器时的光强度,最终测算出了其基因组的大小。研究人员解释道...
首个对叶榕完整基因组发布 为榕属植物性别演化提供重要资源
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队发布首个对叶榕的完整基因组,修正了此前学界对其基因组测序绘制中存在的大量间隙和组装错误,大幅提升了对叶榕基因组的连续性、完整性和准确性,为榕属植物性别演化提供了重要资源。据介绍,榕树是桑科榕属800多种植物的统称,广泛分布于...
叶下珠科药用植物基因组研究获新进展
近日,我国科学家在叶下珠科药用植物基因组研究方面取得新进展,研究揭示了多次杂交与多倍化事件共同塑造了叶下珠科复杂的物种形成历史。相关成果发表于《植物学杂志》(ThePlantJournal)。叶下珠科包含超过2000个物种,大部分具有药用功能。叶下珠科的物种具有多种不同的染色体倍性和复杂的演化历史,其中守宫木属与叶下珠属...
Science经典:植物基因组的同线性与共线性分析思路
因此,在真兽目类群中,准确识别同源基因通常相对容易,而根据“基因组中的最佳匹配标准”(best-in-genome)进行共线性和同线性的推断通常也相对简单(www.e993.com)2024年9月20日。这一标准是通过在两个基因组之间进行配对比较,识别出一对一最佳匹配的染色体区域。然而,在被子植物(开花植物)中,情况有所不同。被子植物的基因组在大小和结构方面...
昆明植物所完成勐腊毛麝香高质量基因组的组装和萜类物质合成相关...
该研究基于Illumina和PacBioHiFi测序数据以及HiC辅助组装,首次获得勐腊毛麝香的染色体级别的高质量基因组。组装完成的勐腊毛麝香基因组总体大小约为442.84Mb,scaffoldN50达到27.98Mb,且95.55%的序列被锚定到14条染色体上。该工作注释到236.86Mb的重复元件,占总基因组的58.62%。该研究通过从头预测、转录本测序和同源...
武汉植物园在第三纪孑遗植物保护基因组学方面取得新进展
本研究强调了不同种群动态历史对第三纪孑遗植物有害突变的积累和清除的影响,这些突变可能决定其长期生存和灭绝风险,研究结果对第三纪孑遗植物以及其他物种的小种群有害变异的遗传管理具有重要意义。首先,研究团队基于Illumina、PacBiolongreads和Hi-C测序技术相结合的策略组装获取了金钱槭和云南金钱槭的参考基因组。对...
发现迄今最大的基因组,是人类基因组的50多倍!
这种植物的基因组大小为148.89Gbp(1488.9亿碱基对)。衣笠草。(图/Alpsdake,WikimediaCommons,CCBY-SA4.0)最近,这个纪录被打破了。在发表于iScience杂志上的一项新研究中,研究人员在来自新喀里多尼亚多的一种梅溪蕨Tmesipterisoblanceolata中,发现了一个更大的真核基因组。这一新记录为160.45Gbp,比衣笠草...
浅谈SLAF的枸杞高密度连锁图谱,鉴定果实大小相关数量性状位点
特别是枸杞果相关性状的果实大小相关性状,此外,它将确保成为比较基因组研究的重要来源,并有助于组装枸杞的参考基因组。六、结论枸杞是一种果实木本植物,因其广泛的药用和营养优势而作为超级食品而广受欢迎。果实大小相关属性对于评估小果枸杞和植物结构非常重要。