系统学习单细胞多组学、空间转录组和机器学习单细胞分析应用线上...

2,从生信零基础开始到单细胞基础和高阶课程,最后到空间转录组和单细胞机器学习应用逐步提高,3,系统学学习,一次学到位,包教包会,4,连续一个月紧凑学习,精细化讲解将单细胞内容全部学懂、学会、学透彻、学以致用,5,了解单细胞测序基本概念及原理、测序分析的常用软件、测序数据的下载方法和研究思路、学会用R...

不会编程不会代码如何做好生信分?生物信息学从此不再有难点析

临床生信之家平台包含了6大数据库TCGA,GEO,Target,ICGC,CCLE还有Single-cell数据库,超过50种生信分析工具。以TCGA数据库为例进入TCGA功能模块中,左侧栏列出了TCGA数据库中所有33种肿瘤类型,未来还将包括非肿瘤疾病。顶部则是各种分析模块,方便用户选择和操作。此外,平台提供了强大的样本筛选功能,允许用户根据临床信...

2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...

对于蛋白质-小分子复合物的X射线晶体结构,口袋中有一个配体,绿色区域是对接口袋的位置,即受体中的配体结合区域(图11D)。表2分子对接分析12.分子对接分析通过iGEMDOCK和SYBYL2.1.1分析SGR和ALDH2的组合(表2)。通过SYBYL2.1.1,发现有8个化合物与ALDH2结合良好(T_Score>5)。通过iGEMDOCK,发现11种化合物...

基因家族纯生信分析依然可以发表6分+

为了验证SKA1-3表达的结果,从GEO下载了GSE84402数据集。此外,还获得了GSE84402数据集,其中包括来自28对HCC和相应非癌组织的14个标本。与TCGA分析类似,SKA1-3在肿瘤中的表达水平高于正常组织(图12)。图12小编总结本文是一篇分析全面的基因家族的生信分析。首先,SKA1-3在肝癌患者中表达上调,与临床分期、年龄、...

8+非肿瘤生信分析!快来学习吧~

本研究所用MS表达数据来自GEO数据库。通过蛋白质注释数据库筛选细胞外蛋白质差异表达基因(EP-DEG)。技术路线本研究技术路线如图1所示。图1结果解析01DEGs的识别为了比较MS组和对照组之间基因表达的差异,本研究进行了样本之间的差异基因表达分析。GSE5839数据集中四个样本基因的中位数、上下四分位数、最大值...

数据不够?生信分析帮你凑!学会深度挖掘快速发文章

4.数据挖掘与生物信息学R语言是数据挖掘神器,可以很快从GEO,TCGA等数据库里提取到想要的数据,还能进一步寻找、分析差异基因,进行相关研究(www.e993.com)2024年11月22日。5.好用、免费的各种工具包目前R的工具包的数量已超过1万,各种包和函数的透明性极好,这使得对函数地调整和改良变得非常便利,这种事情放在任何其他统计软件里都...

中科院重点实验室招AI生信/核酸化学/核酸生物方向博后,协助解决...

AI生信方向招收计算机、自动化、生物信息学、系统生物学等相关专业的博士后。满足以下要求:熟练掌握至少一种编程语言,例如R、Python、C++等;熟悉NCBI、GEO、TCGA等常用网站。熟练掌握生物信息、机器学习、统计推断等相关领域算法。在生物信息、机器学习等领域发表过高质量SCI文章至少1篇。核酸化学方向招收有机化...

生信难吗?万物皆可建模,利用免费数据库简单发5+纯生信

由于mRNAsi值是根据参考数据集计算得到的,不能直接用于实际临床指导。因此,作者就通过一系列的生信分析,去挖掘与mRNAsi密切相关的基因,进而去建立一个与mRNAsi预测模型高度相似的预测模型。研究人员通过差异表达分析找正常组织和肿瘤组织之间的差异表达基因,然后利用WGCNA分析筛选与mRNAsi值显著相关的SI基因。利用研究同样的...

生信科研小白想发文?一文get 6.852分“肿瘤预后”研究套路!_腾讯...

研究思路大致为:单样本基因集富集分析(SsGSEA)→缺氧相关基因预后signature筛选→预后模型构建与验证→HRS与临床病理特征分析→结合临床病理特征构建决策树及诺模图文章的数据是从GEO数据库获取1072名符合早期(I-II期)标准的LUAD患者的RNA-Seq数据和临床信息,将数据集分为训练集和验证集;...

赞!中文版GEO数据库来了,数据集介绍全部实行中英文对照

日前据媒体报道,为“生信分析0代码”而生的临床生信之家,继解决TCGA数据后,1月29日今天上午,终于开始录入GEO数据了,这预示中文版GEO数据库的到来!从体验看,其有以下特点:1.所有数据都来之GEO,以上提到的难弄的数据预处理过程均自动完成。2.临床生信之家一贯的:无需代码基础,鼠标点点点即可完成ID转换,数据...