经典荟萃|近期植物泛基因组研究集锦
1中国农业科学院蔬菜花卉研究所钱伟团队构建了菠菜泛基因组近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所钱伟团队在国际植物学知名期刊PlantBiotechnologyJournal在线发表了题为“Pan-genomeanalysisof13Spinaciaaccessionsrevealsstructuralvariationsassociatedwithsexchromosomeevolutionanddomesticationtraitsinspinac...
MPB 编委 | 基于野菊分型基因组解析金合欢素合成酶及其演化历史
研究团队首先对野菊的基因组进行组装,并绘制了第一张染色体级别的分型基因组,野菊单倍型大小约为3G,杂合度较高,具有9对18条染色体,每套单倍型约包含6万个基因。通过与其近缘种菊花脑(Chrysanthemumnankingense),甘菊(Chrysanthemumlavandulifolium)进行详细的比较基因组学分析,发现菊属内可能存在严重的不完全谱系分选或...
小植物拥有已知最大基因组
迄今发现的最小基因组属于一种哺乳动物寄生虫——肠脑炎微孢子虫,其基因组仅由225万个碱基对组成。此前的研究发现,植物基因组往往更大。基因组相对较大的植物通常寿命更长,但繁殖速度较慢,更易受环境压力影响。然而未参与该研究的美国密歇根州立大学的RoseMarks指出,生物体基因组的大小与其物理或生理复杂性之间...
1600亿碱基对,这种蕨类植物拥有已知最大基因组
迄今发现的最小基因组属于一种哺乳动物寄生虫——肠脑炎微孢子虫,其基因组仅由225万个碱基对组成。此前的研究发现,植物基因组往往更大。基因组相对较大的植物往往寿命更长,但繁殖速度较慢,更容易受环境压力影响。但未参与该研究的美国密歇根州立大学的RoseMarks指出,生物体基因组的大小与其物理或生理复杂性之间...
昆明植物所成功解析茶果樟的全基因组
其基因组大小为1.06Gb,contigN50长度92.10Mb,约99.92%的组装序列可以定位到12条染色体上(2n=24),组装结果仅1个gap,同时共注释发现30497个基因,其中28681个基因为蛋白质编码基因。基于该研究结果,团队在国际期刊ScientificData在线发表了题为Chromosome-levelgenomeassemblyofthethreatenedresourceplant??...
一种蕨类植物或拥有最大基因组,碱基对数量为人类基因组的50多倍
披针叶梅溪蕨是一种罕见的植物,只生长在太平洋西南部的新喀里多尼亚和瓦努阿图的一些岛屿上(www.e993.com)2024年9月20日。2023年,研究人员从新喀里多尼亚采集了样本。为计算该蕨类植物基因组的大小,他们从其茎中提取细胞核,用荧光染料对细胞核内的DNA进行染色,然后测量细胞核通过光探测器时的光强度,最终测算出了其基因组的大小。研究人员解释道...
Nature | 转座酶辅助下的高效植物基因组整合技术—TATSI
近日,美国密苏里大学R.KeithSlotkin和南卡罗来纳大学C.NathanHancock团队合作在Nature上发表了题为“Transposase-assistedtarget-siteintegrationforefficientplantgenomeengineering”的研究论文,开发出了植物转座酶辅助靶点整合(Transposase-AssistedTarget-SiteIntegration,TATSI)系统,在植物基因组中实现了高...
...中国药科大学李萍/陆续团队通过8种地锦草亚属植物的质体基因组...
中国药科大学李萍/陆续团队近期在《FoodChemistry》期刊发表了题为“ComparativeplastomesofeightsubgenusChamaesyceplantsandsystemauthenticationofEuphorbiaeHumifusaeHerba”的研究论文,通过8种地锦草亚属植物的质体基因组比较分析对地锦草药材进行了系统鉴定。
易科泰表型组学研究技术亮相亚洲动植物基因组学大会
亚洲动植物基因组学大会PAGASIA2024于6月5-7日在深圳成功举办。数百位中国、日本、韩国等亚洲基因组学研究的专家学者参加了本次大会,围绕最前沿的研究课题进行了深入探讨。表型组学与基因组学互为表里,一方面表型组分析能够验证基因的实际功能及其与环境的关系,两者结合才能完整解释特定基因的作用以及如何发挥作用;...
首个对叶榕完整基因组发布 为榕属植物性别演化提供重要资源
榕属植物包含6个亚属,一半雌雄同株(单棵榕树上包含正常的雌花和雄花),一半功能性雌雄异株(雌榕树仅含有雌花,雄榕树包含雄花和短花柱雌花)。其中,对叶榕是聚果榕亚属比较古老的雌雄异株植物,具有明显的性别分化。从生物学角度看,解析对叶榕的基因组对研究榕属植物性别分化及相关生物学性状和基因功能至关...