Nat Methods | 链接基因变异与蛋白质序列和结构的强大生信工具:G2P
用户在“startwithagene/proteinidentifier”栏输入基因DNMT3A,选择一种结构(PDB4U7T)并上传注释,例如34个错义变异(碱基编辑位置)、BE扫描的sgRNA评分和来自AlphaMissense的致病性预测评分,以及结构域注释(图3a)。结果部分的“ResourcesintheG2Pportal”栏可做补充。通过选择“Base-editedposition”和“d...
药康生物:公司不涉及任何人源基因序列分析业务 所有的技术及样本...
证券时报e公司讯,药康生物(688046)1月28日晚间公告,近日,公司”关注到在一项2024年1月25日提交给美国众议院的《生物安全法案》草案里涉及限制中国的生物技术公司使用人类基因等遗传物质的相关表述。公司模式动物小鼠均利用科研界公布的无人种差异性的人类基因组序列进行制作,不涉及任何人源基因序列分析业务。所有的技术...
重大突破!仅在人类基因组重复出现,人类基因簇新序列被发现
#三分钟讲科普#11月28日，《科学进展》上发布了一篇文章，其中的主要内容是关于重复基因簇序列的新发现，来自美国西北大学的研究团队在反复的实验中，找到了仅在人类基因组重复出现，并且具有灵长类独有特性的延长因子。这一发现是人类在研究生物基因领域的又一突破，并且弥补了人类基因组计划中的空白区域，为之后的...
【无锡沃信】分子杂交仪介绍及在基因检测和疾病诊断等方面的应用
一、分子杂交仪介绍及在蛋白质研究领域的应用分子杂交仪介绍分子杂交仪是一种用于检测待测基因组中是否含有已知基因序列的设备。它基于分子杂交技术,通过特定的探针与待测样本中的目标序列进行杂交反应,从而实现对目标序列的检测和分析。分子杂交仪在生物科学研究领域具有广泛的应用,特别是在基因检测和疾病诊断等方面发挥...
Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...
为阐明宏基因组样本的基因组成,通常采用两种主要方法,各有利弊。第一种方法是将测序读数精确地映射到一组已知的、有注释的参考基因组序列上,以提供已知生物、基因和潜在功能的快速概览。MG-RAST就是擅长这类分析的系统之一。在第二种方法中,将大量读数从头组装为contigs/scaffolds,可以为了解以前未被描述的生物体及其...
Nature Methods | 基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动...
蛋白质序列中的变异映射:可以在“基因/蛋白质查询模块”中选择MORC2基因,并查看其相关的蛋白质序列、变异和功能特征(www.e993.com)2024年11月20日。该图展示了MORC2蛋白N端区域(残基20-470)中的多个ClinVar数据库中的致病/可能致病(PLP)错义变异。这些变异在蛋白质序列上以黄色标记展示,帮助识别这些重要的致病性变异。
Nature Methods | 精准基因比对新突破:Genes2Genes框架助力单细胞...
01NatureMethods报道了一种新的框架——Genes2Genes(G2G),能够在单个基因层面上对单细胞轨迹进行精确对齐。02与传统方法不同,G2G允许在参考轨迹和查询轨迹之间同时捕捉基因表达的匹配和不匹配状态,包括基因表达的插入和删除。03通过模拟数据中的性能测试,G2G在所有轨迹模式下的准确率都高于其他算法,尤其是在处理分歧...
全球首个核苷酸序列!江苏泰州发现罕见小p血型,我国仅记录10余人
在临床试验中，ABO血型系统和Rh血型系统的临床意义最为重要，是与人类输血关系最为密切的两个血型系统。如常见的A型血是指红细胞上有A抗原的血型，B型血是指红细胞上有B抗原的血型；一般媒体报道较多的稀有“熊猫血”，则属于Rh血型系统中红细胞上缺乏D抗原的，也称Rh（D）阴性血。此次曹国平发现的特殊基因序列的P...
遗传发育所等在植物着丝粒研究中获进展
研究发现连翘基因组大小为688.79Mb、N50序列大小为48.48Mb,并注释到33,932个编码基因。研究进行连翘着丝粒的序列、结构和功能分析。研究鉴定到编码连翘着丝粒特异组蛋白CENH3的基因,制备了特异识别CENH3蛋白的抗体,并通过染色质免疫共沉淀并结合二代测序的方法,确定了连翘着丝粒的位置和大小。同时,研究通过生物信息学...
新物种、新 CRISPR 系统!Evo 大模型突破全基因组生成,创造生物大...
Evo由ArcInstitute、斯坦福大学和TogetherAI的研究人员开发,是一个长上下文的生物基础模型,能够泛化生物学的基本语言:DNA、RNA和蛋白质。它能够从单个分子到整个基因组规模(超过650kb)进行预测任务和多模态长序列生成设计。该文首先列出了Evo模型在生成CRISPR-CAS