基于影像多组学数据库的无创可视化新方法,揭示乳腺癌肿瘤内异质性...
队列1从多组学研究队列中收集了468例患者的数据,包括全外显子测序(n=365)、转录组测序(n=369)、拷贝数变异(n=404)、代谢组学(n=221)、HE染色的病理图像(n=324),以及随访数据(n=468),用于识别IITH及其预后意义;验证IITH、GITH和细胞形态ITH(MITH)之间的相关性;并确定IITH的生物学特征。队列2包括临床特征...
机器学习面试的 12 个基础问题
算法1:批归一化变换,在一个mini-batch上应用于激活x。批归一化是一种用于训练神经网络模型的有效方法。这种方法的目标是对特征进行归一化处理(使每层网络的输出都经过激活),得到标准差为1的零均值状态。所以其相反的现象是非零均值。这将如何影响模型的训练:首先,这可以被理解成非零均值是数据不围绕0...
复旦NLP组开源PPO-Max:32页论文详解RLHF背后秘密,高效对齐人类偏好
在RM架构中,研究人员使用基于Transformer的预训练语言模型,去掉最后unembedding层,并增加一个额外的线性层。输入任意文本,奖励模型将最后一个token转换为标量奖励值:奖励值越大,代表样本越好。训练奖励模型通常需要一个「针对相同输入生成的两个回复之间的成对比较」数据集。近端策略优化ProximalPolicyOptimizationP...
iMeta | 中国药科大学李萍/李菁-编码胆盐水解酶的乳酸杆菌的分类...
●给予编码BSH‐T3的罗伊氏乳酸杆菌可以改变小鼠的肝肠胆汁酸谱。摘要胆盐水解酶(bilesalthydrolases,BSHs)是胆汁酸(bileacids,BAs)肝肠代谢所必需的酶。BSH催化游离BA的产生并调节BA池的动态平衡。本研究鉴定乳酸杆菌为编码BSH的关键菌属,并利用人类肠道微生物组数据库的宏基因组数据筛选获得了16个主要菌种。
解析R848结合流感疫苗的偶联剂依赖效应:对APC激活及体内免疫原性...
将PBMC(1个-2×106个/孔)保存在48孔板中,添加不同物质(如L-谷氨酰胺、丙酮酸钠、非必需氨基酸等)和胎牛血清进行培养。使用不同的刺激物(如IPR8、IPR8-SM(PEG)4-R848、IPR8-GMBS-R848、TLR鸡尾酒)刺激PBMC16小时,或不刺激。对免疫群体进行表面分析,使用特定抗体进行染色(如CD3、CD20、人类白细胞抗原...
奥卡姆剃刀的“谎言”
因为A包括了B的可能,所以你预测A可能性更大,才是理性的(www.e993.com)2024年7月7日。诺奖得主卡尼曼曾经设计过一个类似的实验,大部分人选择了“看似更有可能然而其实概率更小”的选项,他将其称为“合取谬误”。增加“球迷集体高呼梅西的名字”这一假设,符合人类的想象力和讲故事的本能,但却是一种假设负荷。????????...
特征选择策略:为检测乳腺癌生物标志物寻找新出口
实验团队从GDCTCGA-BRCA项目中,合计收集了1,881个microRNA-Seq数据,并按照8:2的比例,分成了训练集和测试集两部分。这些数据与300个实体原发肿瘤样本(T)以及101个正常相邻肿瘤(NAT)样本相关,都属于导管及小叶乳腺组织。应用特征选择法之前,这些数据都进行了方差稳定归一化处理(variance...
分析阿兹夫定的临床试验数据:一个打死不冤的伪新冠特效药
核酸转阴是用RT-PCR来判断,就是划一个CT值的标准,CT值越高,载毒量越低。核酸阴性即RT-PCR的CT值低于设定的阴性标准了。然后看中症试验论文里的CT值比较:两个组有区别吗?方差范围互相重合,居然能说阿兹夫定转阴时间更快?论文说阿兹夫定是6.24天转阴,安慰剂组7.94天,去看5、7、9这三个采样点,两组CT值有...
R语言马科维茨Markowitz均值-方差(风险投资模型)分析最优投资组合...
从X0数据集中随机选择5个列,将其索引存储在变量col中。这些列将用于构建投资组合。X=timeSeries(X0[,col])创建一个时间序列对象X,其中包含X0数据集的选定列。X将用于进行投资组合分析。SpecMVEfficientPortfolio模型是指均值-方差效率组合模型(Mean-VarianceEfficientPortfolioModel)。
Stata : 论文中数据分析的一把利剑
reg(被解释变量)(解释变量1)(解释变量2)……[aweight=h]如果我们确切地知道扰动项的协方差矩阵的形式,那么GLS估计是最小方差线性无偏估计,是所有线性估计中最好的。显然它比OLS更有效率。虽然GLS有很多好处,但有一个致命弱点:就是一般而言我们不知道扰动项的协方差矩阵,因而无法保证结果的有效性。