他们用AI破译蛋白质结构“密码”
在蛋白质的世界里,氨基酸以长链的形式相连,折叠成复杂的三维结构,赋予蛋白质重要功能。自20世纪70年代以来,科学家一直致力于根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这是一项极其艰巨的任务。因为有些氨基酸和其他氨基酸相互作用,有些氨基酸则具有疏水性。而且氨基酸链形成了复杂的形状,使精准确定蛋白质结构难上加难。AI模...
诺奖2024|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构,人们在AI模型的帮助下,洞悉蛋白质结构的上述密码后,产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的,包...
...给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构预测成果
比如,该团队重新设计了蛋白质-蛋白质相互作用特异性,并证明特异性变化在体外和体内都有效。另据悉,他还设计了一种名为Top7的蛋白质,后者具有完全新颖的褶皱。虽然他主要以开发蛋白质结构和功能的计算预测方法而闻名,但也对使用AI计算方法来驱动生物学的实验颇为感兴趣。凭借在蛋白质折叠方面的成果,Baker还曾获得...
Cell:张锋团队揭示首个真核基因编辑系统Fanzor的结构多样性和DNA...
这一发现揭示了Fanzor蛋白在基因转移和寄生关系中的潜在功能。此外,该研究通过解析不同DNA结合构象的结构,揭示了Fanzor如何调控自身以激活DNA切割活性。在GtFz1中,未结合DNA的状态以及两个结合了不同形式DNA的结构展示了REC结构域在R-loop形成和稳定中的关键构象变化。而在SpuFz1和PpFz1中,研究解析了具有不同数量G...
2024年动物源食品科学与人类健康国际研讨会--分会场二∣大会综合...
海参含有丰富的皂苷、蛋白质、多肽、糖类、脂肪酸、维生素和多种微量元素。具有抗癌、抗凝血、抗细菌和真菌、防止氧化等生理活性。海参皂苷是海参的主要活性物质之一。海参皂苷是海参特有的三萜化合物,其结构复杂性在于其苷元环上的取代基种类、取代位置、以及与之相连的糖的类型、数量、连接次序及位点等都有不同,...
模拟5亿年的进化信息,首个同时推理蛋白质序列、结构和功能的生物...
自然进化是如何在超过三十亿年的时间里,雕琢出当前自然界中蛋白质的多样性的呢?这一过程涉及无数随机突变与自然选择事件,每一个环节都严格考验着蛋白质的序列、结构及其执行的生物功能,只有最适应环境变化的蛋白质才能留存下来(www.e993.com)2024年10月17日。因此,现存蛋白质序列信息中实质上是蕴含着生物学变量对几十亿年漫长进化路径的影响。
解密蛋白质结构:探索生物系统的精巧设计
许多疾病与蛋白质结构的异常有关。例如,蛋白质的突变可能导致结构的改变,进而影响其功能。一些神经系统疾病、遗传性疾病和肿瘤等都与蛋白质结构的异常有关。了解蛋白质结构的细微变化,有助于揭示疾病的发病机制,并为疾病的治疗提供新的思路和方法。5.利用蛋白质结构的启示...
河北科技大学王世杰教授等:肠道菌群介导的不同饮食模式与高尿酸血症
尿酸转运蛋白是尿酸的载体,转运蛋白功能障碍引起尿酸排泄减少是HUA的常见病因。肠道中相关的尿酸转运体主要包括葡萄糖转运蛋白9(GLUT9/SLC2A9)和乳腺癌耐药蛋白(BCRP/ABCG2)。研究发现小肠上皮细胞缺乏GLUT9或ABCG2会出现小肠尿酸转运功能障碍,可诱发HUA。肠道菌群与尿酸转运蛋白之间的关系尚不明确,但据目前的研究表...
填补AlphaFold3空白,字节跳动提出物理引导的方法让蛋白质动起来
世界是变化的,分子是运动的,从预测静态单一结构走向动态构象分布是揭示蛋白质等生物分子功能的重要一步。探索蛋白质的构象分布,能帮助理解蛋白质与其他分子相互作用的生物过程;识别蛋白质表面下的潜在药物位点,描绘各个亚稳态之间的过渡路径,有助于研究人员设计出具有更强特异性和效力的目标抑制剂和治疗药物。但传统的...
专访腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组...
通过蛋白质组或转录组等组学数据,我们可以更全面地理解细胞的微环境和疾病产生的原因,这对于临床治疗和疾病机制的研究具有重要意义。与AlphaFold等关注单个蛋白质结构的技术相比,我们的研究更侧重于整个细胞和微环境的系统性分析,这使得我们的工作更接近临床应用和疾病机制的探索。雷峰网:虽然是三个论文成果,但...